[发明专利]MN/CA9剪接变体

权利要求书

1.与哺乳动物中MN/CA IX异常表达相关的肿瘤发生前/肿瘤性疾病的诊断和/或预后方法，包括区分全长[FL]和旁路剪接的[AS]MN/CA9mRNA或MN/CA IX表达。

2.如权利要求1所述的方法，包括使用一种或多种探针和/或引物来检测或检测并定量FL和/或AS MN/CA9mRNA表达。

3.如权利要求2所述的方法，包括使用：

(a)探针和/或引物，以检测全长[FL]MN/CA9mRNA但不检测旁路剪接的[AS]MN/CA9mRNA；

(b)探针和/或引物，以检测AS MN/CA9mRNA但不检测FL MN/CA9mRNA；和/或

(c)探针和/或引物，以检测FL和AS MN/CA9mRNA。

4.如权利要求2所述的方法，其中所述哺乳动物是人，且其中所述一种或多种探针和/或引物选自SEQ ID NOS：97-101和与SEQ ID NOS：97-101至少80％同源的核酸序列。

5.如权利要求2所述的方法，包括使用核酸扩增方法。

6.如权利要求5所述的方法，其中所述核酸扩增方法包括使用PCR、RT-PCR、实时PCR或定量实时RT-PCR。

7.如权利要求2所述的方法，包括使用微阵列芯片，所述芯片含有结合全长[FL]MN/CA9mRNA但不结合旁路剪接的[AS]MN/CA9mRNA的探针，和/或结合AS MN/CA9mRNA但不结合FL MN/CA9mRNA的探针。

8.如权利要求2所述的方法，还包括测定FL:AS MN/CA9mRNA的比率。

9.如权利要求2所述的方法，其中所述AS MN/CA9mRNA表达指示正常MN/CA9基因表达，所述FL MN/CA9mRNA表达指示异常MN/CA9基因表达。

10.如权利要求2所述的方法，其中所述AS MN/CA9mRNA表达指示正常含氧量情况下MN/CA9基因的表达，所述FL MN/CA9mRNA表达指示低氧情况下MN/CA9基因的表达。

11.如权利要求1所述的方法，包括使用一种或多种抗体来区分肿瘤发生前/赘生性组织中的FL和AS MN/CA IX表达。

12.如权利要求11所述的方法，包括检测或检测并定量所述组织中的AS MN/CA IX。

13.如权利要求12所述的方法，还包括测定所述组织中FL MN/CA IX水平与AS MN/CA IX水平的比率。

14.如权利要求13所述的方法，其中所述比率指示所述组织中低氧的存在或程度。

15.如权利要求11所述的方法，包括检测或检测并定量脊椎动物组织中的FL MN/CA IX和AS MN/CA IX，其包括以下步骤：

(a)使所述脊椎动物组织的样品同时或按序与至少两种抗体、至少两种抗原结合抗体片段、或抗体和抗原-结合抗体片段的混合物接触，其中至少一种抗体/抗体片段特异性结合于FL MN/CA IX蛋白但不结合AS MN/CAIX蛋白，其中至少一种其他抗体/抗体片段特异性结合于FL和AS MN/CAIX两者；

(b)检测并定量所述样品中的所述抗体/抗体片段；和

(c)比较所述差异结合性抗体/抗体片段的结合以测定FL MN/CA IX和AS MN/CA IX的相对水平。

16.如权利要求15所述的方法，其中所述特异性结合于FL MN/CA IX但不结合AS MN/CA IX的抗体/抗体片段对MN/CA IX的碳酸酐酶(CA)结构域有特异性；其中所述特异性结合于FL MN/CA IX和AS MN/CA IX两者的抗体/抗体片段对MN/CA IX的蛋白聚糖样(PG)结构域有特异性。