[发明专利]用于富集、除去和检测革兰氏阳性细菌的方法和手段有效
申请号: | 200780051424.9 | 申请日: | 2007-12-21 |
公开(公告)号: | CN101636415A | 公开(公告)日: | 2010-01-27 |
发明(设计)人: | 马丁纳·贝辛格;斯蒂芬·米勒;安贾·菲利普;迈克尔·许茨 | 申请(专利权)人: | 拜奥默里克斯公司 |
主分类号: | C07K19/00 | 分类号: | C07K19/00;C12N15/62;C12N9/88;C07K14/315;G01N33/569 |
代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 | 代理人: | 张文辉 |
地址: | 法国埃*** | 国省代码: | 法国;FR |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 富集 除去 检测 革兰氏 阳性 细菌 方法 手段 | ||
1.由下述组成的多肽:
i)内溶素或另一种细胞壁溶解酶的无酶促活性的细胞壁结合结构域,其中所述无酶促活性的细胞壁结合结构域选自:SEQ ID NO:19、21、23-33,和
ii)JS标签,其选自SEQ ID NO:1-18,其中所述JS标签位于i)中所述的序列的C-或N-末端,并且任选地
iii)接头,其选自由SEQ ID NO:34-38组成的组的序列,其中接头位于i)中所述的序列和ii)所描述的序列之间,和/或
iv)间隔区序列,其选自GFP、GST或MBP组成的组,其中所述间隔区位于i)中所述的序列和ii)所描述的序列之间,
其中除i)中所述细胞壁结合结构域之外,所述多肽不包含内溶素或另一种细胞壁溶解酶的别的结构域,并且其中多肽能够结合革兰氏阳性细菌,但在SEQ ID NO:19的情况中多粘芽孢杆菌(B.polymyxa)和球形芽孢杆菌(B.sphaericus)除外,和通过蛋白生物素连接酶而被体内生物素化。
2.根据权利要求1的多肽,其中所述多肽是生物素化的。
3.根据上述权利要求任一项的多肽,其显示由下组序列组成的序列:
i)选自SEQ ID NO:8的序列,
ii)选自SEQ ID NO:19的序列,
iii)选自SEQ ID NO:35的序列,和任选地
iv)作为间隔区的GFP、GST或MBP序列。
4.根据权利要求3的多肽,其为所示SEQ ID NO:42-43的序列之一。
5.编码根据权利要求1至4任一项的多肽的核酸。
6.根据权利要求5的核酸,其中编码SEQ ID NO:1-18的序列的N端序列以选自SEQ ID NO:54-56的序列开始。
7.编码根据权利要求1至4中任一项的多肽的载体。
8.表达根据权利要求5或6的核酸或依照权利要求7的载体的细胞。
9.根据权利要求1至4任一项的多肽之一用于结合、富集、从样品中除去、捕获和/或检测细菌的用途,其中所述用途不是疾病的诊断或治疗方法。
10.用于富集、除去、捕获和/或检测来自样品的细菌的方法,其中所述方 法不是疾病的诊断或治疗方法,其包括以下步骤:
a)使样品与生物素化的依照权利要求1至4任一项的多肽接触和/或一起温育,
b)使步骤a)中获得的所述多肽-细菌复合物与提供生物素结合物质的载体接触和/或一起温育,
c)将步骤b)中获得的所述载体-多肽-细菌复合物与所述样品分开,
d)任选地,自所述载体-多肽-细菌复合物清洗非特异性附着的样品成分,
e)任选地,将所述载体与所述多肽-细菌-复合物分开,并
f)任选地,检测所述细菌。
11.根据权利要求10的方法,其中所述生物素结合物质包含亲合素或链霉抗生物素蛋白。
12.根据权利要求11的方法,其中所述方法经由磁性、层析或分批方法来实施。
13.根据权利要求10至12任一项的方法,其中步骤f)中的所述检测经由选择性生长条件、基于核酸的方法;细菌细胞壁及其成分的检测,细菌成分的检测经由偶联有标志物的别的特异性细胞壁结合结构域,和/或经由微生物学、形态学和/或生化检测方法的组合来实施。
14.根据权利要求13的方法,其中所述基于核酸的方法选自下组:PCR、RT-PCR、PCR-RFLP、rep-PCR指纹法、NASBA、DNA杂交方法、多基因座序列分型(MLST)和rRNA比较。
15.根据权利要求13的方法,其中所述细菌细胞壁及其成分的检测分别经由内溶素、抗体的细胞结合结构域或经由FTIR来实施。
16.根据权利要求13的方法,其中所述细菌成分的检测经由ELISA、酶活性、多位点酶电泳(MEE)或生物发光测定法来实施。
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