[发明专利]一种直接用于解析微生物群落结构的土壤DNA提取方法无效
申请号: | 200810007226.9 | 申请日: | 2008-02-20 |
公开(公告)号: | CN101514339A | 公开(公告)日: | 2009-08-26 |
发明(设计)人: | 豆俊峰;丁爱中 | 申请(专利权)人: | 北京师范大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100875北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 直接 用于 解析 微生物 群落 结构 土壤 dna 提取 方法 | ||
1.一种直接用于解析微生物群落结构的土壤DNA提取方法,其特征在于,该技术的具 体步骤如下:
(1)称取2.0g土壤样品于10ml离心管中,加入5ml pH值为9.5的0.1M磷酸缓冲液, 旋涡振荡5min,在11000r/min条件下离心10min,弃去上清液,按照上述方法 对分离出的土壤再洗涤2次;
(2)向由步骤(1)得到的土壤中加入5ml裂解液后混匀,裂解液的组成为:0.1~0.3M Tris-HCl,0.05~0.15M EDTA,1.0~1.5MNaCl,pH 8.0~8.5,百分比浓度为0.5~1.5% 的十六烷基三甲胺,然后加入1.5mg蛋白酶K和4g小玻璃珠,在50℃条件下 振荡30min后加入1ml浓度为100g/L的十二烷基硫酸钠溶液,旋涡振荡5min 后在65℃条件下水浴振荡1h,在11000r/min条件下离心10min,收集上清液得 细胞裂解液;
(3)向由步骤(2)得到的细胞裂解液中加入1ml pH值为6.0~6.5浓度为10M的KSCN 溶液,在35℃条件下水浴振荡15min,在11000r/min条件下离心10min,收集 上清液;
(4)将由步骤(3)得到的上清液加入到离心纯化柱上,将离心纯化柱放入离心管中, 在11000r/min条件下离心10min,倒去离心管中的液体,重复这一过程,直至所 有由步骤(3)得到的上清液都经过离心纯化柱纯化;
(5)向经步骤(4)处理后的离心纯化柱中加入0.7ml洗涤液,洗涤液的组成为:10ml 4M NaAc与90ml无水乙醇混合后调pH值至7.5,在11000r/min条件下离心5 min,倒去离心管中的液体,重复这一过程1次,即向该离心纯化柱中再次加入 0.7ml洗涤液,然后在11000r/min条件下离心5min,倒去离心管中的液体;
(6)向经步骤(5)处理后的离心纯化柱中加入0.7ml洗脱液,洗脱液的组成为:10~15 mM Tris-HCl,1.0~2.0mM EDTA,pH 8.0,在65℃水浴中放置2min,在11000r/min 条件下离心5min,将离心管中的液体重新加入到该离心纯化柱中,在65℃水浴 中放置2min,在11000r/min条件下离心5min,离心管中液体即为土壤微生物 DNA溶液,在-20℃保存备用。
2.根据权利要求1所述直接用于解析微生物群落结构的土壤DNA提取方法,其特征在 于,所述步骤(2)中裂解液的组成优选为:0.2M Tris-HCl,0.15M EDTA,1.0MNaCl,pH 8.0,百分比浓度为1.5%的十六烷基三甲胺。
3.根据权利要求1所述直接用于解析微生物群落结构的土壤DNA提取方法,其特征在 于,所述步骤(6)中洗脱液的组成优选为:12mM Tris-HCl,1.0mM EDTA,pH 8.0。
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