[发明专利]利用内含肽反式剪接制作蛋白质分子量标准的方法无效
申请号: | 200810024846.3 | 申请日: | 2008-05-07 |
公开(公告)号: | CN101281201A | 公开(公告)日: | 2008-10-08 |
发明(设计)人: | 王强;陈建群;张云华;张鹏飞;王凯;刘静;王海燕;李宕 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N1/28 |
代理公司: | 南京天翼专利代理有限责任公司 | 代理人: | 汤志武;王鹏翔 |
地址: | 210093*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 内含 反式 剪接 制作 蛋白质 分子量 标准 方法 | ||
1、利用内含肽反式剪接制作蛋白质分子量标准的方法,其特征是选择一段一定分子量的已知蛋白X,另选择两种互不兼容的内含肽A和B,将内含肽A和B分别分解为氨基末端(N端)与羧基末端(C端),即An、Ac、Bn、Bc;然后将它们组成五个重组蛋白,即起点蛋白(X-An)、中段1(Ac-X-Bn)蛋白、中段2蛋白(Bc-X-An)、终点1蛋白(Ac-X)、终点2蛋白(Bc-X);通过上面五个蛋白的相互组合连接叠加,获得多种分子量分布范围的蛋白质分子量标准。
2、根据权利要求1所述的利用内含肽反式剪接制作蛋白质分子量标准的方法,其特征是五种非天然形成的蛋白分子构成:
1)一种蛋白包含一定分子量的已知蛋白和断裂内含肽A的氨基末端部分;
2)一种蛋白包含断裂内含肽A的羧基末端部分,一定分子量的已知蛋白和断裂内含肽B的氨基末端部分;
3)一种蛋白包含断裂内含肽B的羧基末端部分,一定分子量的已知蛋白和断裂内含肽A的氨基末端部分;
4)一种蛋白包含断裂内含肽A的羧基末端部分和一定分子量的已知蛋白;
5)一种蛋白包含断裂内含肽B的羧基末端部分和一定分子量的已知蛋白。
3、根据权利要求1所述的利用内含肽反式剪接制作蛋白质分子量标准的方法,其特征是:
1)编码“起点”蛋白的核苷酸序列,该核酸分子的由已知蛋白的核苷酸序列的3′端侧接编码断裂内含肽A的氨基末端部分的核苷酸序列;
2)编码“中段1”蛋白的核苷酸序列,该核酸分子由已知蛋白的核苷酸序列的5′端侧接编码断裂内含肽A的羧基末端部分的核苷酸序列,3′端侧接编码断裂内含肽B的氨基末端部分的核苷酸序列;
3)编码“中段2”蛋白的核苷酸序列,该核酸分子由已知蛋白的核苷酸序列的5′端侧接编码断裂内含肽B的羧基末端部分的核苷酸序列,3′端侧接编码断裂内含肽A的氨基末端部分的核苷酸序列;
4)编码“终点1”蛋白的核苷酸序列,该核酸分子的由已知蛋白的核苷酸序列的5′端侧接编码断裂内含肽B的羧基末端部分的核苷酸序列;
5)编码“终点2”蛋白的核苷酸序列,该核酸分子的由已知蛋白的核苷酸序列的5′端侧接编码断裂内含肽A的羧基末端部分的核苷酸序列。
4、根据权利要求1所述的利用内含肽反式剪接制作蛋白质分子量标准的方法,其特征是选择大肠杆菌Escherichia coli K12的gusA基因的1-85氨基酸,加上一个天冬氨酸(密码子为GAU),得到分子量为10000.23Da的蛋白序列,作为蛋白X;另选择蓝藻Synechocystis sp.PCC6803的DnaE和DnaB分别作为内含肽A和B。将内含肽A和B分别分解为氨基末端(N端)与羧基末端(C端),即An、Ac、Bn、Bc。然后将它们组成五个重组蛋白,即起点(X-An)、中段1(Ac-X-Bn)、中段2(Bc-X-An)、终点1(Ac-X)、终点2(Bc-X);
首先让“起点”蛋白和“终点2”蛋白反应,得到分子量为已知蛋白两倍的蛋白;
让“起点”蛋白、“中段2”蛋白反应,然后再加入“终点1”蛋白反应,得到分子量为已知蛋白3倍的蛋白;让“起点”蛋白、“中段1”蛋白反应,然后再加入“中段2”蛋白反应,最后加入“终点2”蛋白,得到分子量为已知蛋白4倍的蛋白;依次循环重复,便可以得到分子量为已知蛋白任意整数倍的蛋白。
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