[发明专利]强直性脊柱炎易感性检测方法和试剂盒无效

专利信息
申请号: 200810034223.4 申请日: 2008-03-05
公开(公告)号: CN101525655A 公开(公告)日: 2009-09-09
发明(设计)人: 黄薇;雷蓉;牛振民 申请(专利权)人: 上海人类基因组研究中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 代理人: 徐 迅
地址: 20120*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 强直性脊柱炎 感性 检测 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种体外检测样品是否存在抗原肽转运蛋白1(TAP1)的单核苷酸多态性的方法,其特征在于,包括步骤:

(a)用TAP1基因特异性引物扩增样品的TAP1基因,得到第一扩增产物,以及用LMP2基因特异性引物扩增样品的LMP2基因,得到第二扩增产物;和

(b)检测第一扩增产物中是否存在以下单核苷酸多态性:

366位G→缺失;

其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1;

和检测第二扩增产物中是否存在以下单核苷酸多态性:

185位G→A和601位G→A;

其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:4。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的TAP1基因特异性引物具有SEQ ID NO:2和3的序列,而所述的LMP2基因特异性引物具有SEQ ID NO:5和6的序列。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的第一扩增产物的长度为100-2000bp且含有SEQ ID NO:1中第621位;并且所述的第二扩增产物的长度为100-2000bp且含有SEQ ID NO:4中第185和601位。

4.一种检测强直性脊柱炎的试剂盒,其特征在于,它包括特异性扩增TAP1基因或转录本的引物,所述的引物扩增出长度为100-2000bp且含有SEQ ID NO:1中第621位的扩增产物;以及

特异性扩增LMP2基因或转录本的引物,所述的引物扩增出长度为100-2000bp且含有SEQ ID NO:4中第185和601位的扩增产物。

5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,它还含有选自下组的试剂:

(a)与SEQ ID NO:1中第621位、SEQ ID NO:4中第185和601位的突变结合的探针;

(b)识别SEQ ID NO:1中第621位、SEQ ID NO:4中第185和601位的突变限制性内切酶。

6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述的突变是同时存在以下的单核苷酸多态性:

366位G→缺失;

其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1;以及

185位G→A和601位G→A;

其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:4。

7.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述的TAP1基因特异性引物具有SEQ ID NO:2和3的序列,而所述的LMP2基因特异性引物具有SEQ ID NO:5和6的序列。

8.一种对个体的强直性脊柱炎易感性进行诊断的方法,其特征在于,它包括步骤:

检测该个体的TAP1基因或转录本,并与正常的TAP1基因或转录本相比较,同时检测该个体的LMP2基因或转录本,并与正常的LMP2基因或转录本相比较;

其中,存在差异就表明该个体患强直性脊柱炎的可能性高于正常人群。

9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,检测的是TAP1的基因和LMP2基因,并与正常TAP1和LMP2的核苷酸序列比较差异。

10.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述的差异是同时存在以下的单核苷酸多态性:

366位G→缺失;

其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1;以及

185位G→A和601位G→A;

其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:4。

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