[发明专利]强直性脊柱炎易感性检测方法和试剂盒无效
申请号: | 200810034223.4 | 申请日: | 2008-03-05 |
公开(公告)号: | CN101525655A | 公开(公告)日: | 2009-09-09 |
发明(设计)人: | 黄薇;雷蓉;牛振民 | 申请(专利权)人: | 上海人类基因组研究中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 | 代理人: | 徐 迅 |
地址: | 20120*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 强直性脊柱炎 感性 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种体外检测样品是否存在抗原肽转运蛋白1(TAP1)的单核苷酸多态性的方法,其特征在于,包括步骤:
(a)用TAP1基因特异性引物扩增样品的TAP1基因,得到第一扩增产物,以及用LMP2基因特异性引物扩增样品的LMP2基因,得到第二扩增产物;和
(b)检测第一扩增产物中是否存在以下单核苷酸多态性:
366位G→缺失;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1;
和检测第二扩增产物中是否存在以下单核苷酸多态性:
185位G→A和601位G→A;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:4。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的TAP1基因特异性引物具有SEQ ID NO:2和3的序列,而所述的LMP2基因特异性引物具有SEQ ID NO:5和6的序列。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的第一扩增产物的长度为100-2000bp且含有SEQ ID NO:1中第621位;并且所述的第二扩增产物的长度为100-2000bp且含有SEQ ID NO:4中第185和601位。
4.一种检测强直性脊柱炎的试剂盒,其特征在于,它包括特异性扩增TAP1基因或转录本的引物,所述的引物扩增出长度为100-2000bp且含有SEQ ID NO:1中第621位的扩增产物;以及
特异性扩增LMP2基因或转录本的引物,所述的引物扩增出长度为100-2000bp且含有SEQ ID NO:4中第185和601位的扩增产物。
5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,它还含有选自下组的试剂:
(a)与SEQ ID NO:1中第621位、SEQ ID NO:4中第185和601位的突变结合的探针;
(b)识别SEQ ID NO:1中第621位、SEQ ID NO:4中第185和601位的突变限制性内切酶。
6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述的突变是同时存在以下的单核苷酸多态性:
366位G→缺失;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1;以及
185位G→A和601位G→A;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:4。
7.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述的TAP1基因特异性引物具有SEQ ID NO:2和3的序列,而所述的LMP2基因特异性引物具有SEQ ID NO:5和6的序列。
8.一种对个体的强直性脊柱炎易感性进行诊断的方法,其特征在于,它包括步骤:
检测该个体的TAP1基因或转录本,并与正常的TAP1基因或转录本相比较,同时检测该个体的LMP2基因或转录本,并与正常的LMP2基因或转录本相比较;
其中,存在差异就表明该个体患强直性脊柱炎的可能性高于正常人群。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,检测的是TAP1的基因和LMP2基因,并与正常TAP1和LMP2的核苷酸序列比较差异。
10.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述的差异是同时存在以下的单核苷酸多态性:
366位G→缺失;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1;以及
185位G→A和601位G→A;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:4。
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