[发明专利]香菇栽培菌种241-4的分子标记、其检测方法及应用无效
申请号: | 200810037260.0 | 申请日: | 2008-05-09 |
公开(公告)号: | CN101265493A | 公开(公告)日: | 2008-09-17 |
发明(设计)人: | 宋春艳;谭琦;尚晓冬;陈明杰 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/04 | 分类号: | C12Q1/04;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 | 代理人: | 黄志达;谢文凯 |
地址: | 201106*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 香菇 栽培 菌种 241 分子 标记 检测 方法 应用 | ||
技术领域
本发明属香菇栽培菌种的检测领域,特别是涉及香菇栽培菌种241-4的分子标记、其检测方法及应用。
背景技术
我国香菇产量已从1983年的1.95万吨迅速发展到2005年的242万吨,占全球香菇总产量的70%以上,改写了世界食用菌产量的排行榜,并不断缩小与排行第一的双孢蘑菇产量差距,有专家预测,由于中国香菇产业的迅猛发展,在近10年内其将成为世界产量最高的食用菌。中国香菇以其惊人的发展速度,优质的品质及低廉的成本为世界菇业人士瞩目,中国香菇已风靡世界。
优质菌种在香菇单产和质量中的贡献率举足轻重,这决定了香菇菌种在香菇产业中的重要地位。1999年我国签署了《国际植物新品种保护法》,这不仅要求我们尊重其它国家的品种知识产权,同时也要加强保护我们国家自己的品种知识产权,为了建立食用菌新品种登记制度来真正保护我国的品种产权,必须首先建立成熟的品种鉴定技术,为新品种登记奠定基础。尤其日本2004年4月1日开始实行《种苗法修正案》,对我国食用菌尤其是香菇的出口构成了极大的威胁。就国内而言,香菇栽培菌种“同种异名,异种同名”的现象,不仅给菇农带来了极大的损失,影响了他们的栽培积极性,也极大地影响了中国香菇的快速发展;而且,随着大规模的工厂化栽培方式的出现,对香菇栽培菌株质量的要求越来越高,需要发展更为简便、快速、准确的菌株鉴定技术,以保证每批次的用种都准确无误。
面对这种局势,就需要我们进一步加快菌种鉴定技术的研究,在香菇的研究中引进更为有效的菌种鉴定体系。
发明内容
本发明的目的是提供一种香菇栽培菌种241-4的分子标记、其检测方法及应用,通过采用PCR技术,经过筛选试验,获得了香菇菌株241-4的特异DNA片断,以此片段的DNA序列为基础,设计特异性PCR扩增引物,通过对241-4菌株的特异片段检测从而对香菇241-4菌株进行鉴定和检测。
本发明的一种香菇栽培菌种241-4的分子标记,是基因SCAR的分子特异检测标记,其PCR扩增的专用引物是241-4F/R,241-4F是5’CTCTGGTCATTGTTACTGTG 3’,241-4R是5’CTCTGGCAAGGCTTAT 3’,PCR产物大小为555bp。
扩增出的SCAR片段的基因序列如下:
5′-CTCTGGTCATTGTTACTGTGTTTATTGGAGTACTGAGCAACTACAAGACTCTGTAGCACAACCTACTGAGCTTGTATTAAGGCATTGACATTCTCTGCACTGAGCTGGGTGGCATACTGCTTGGGTTAGCTGAAGGGCGCTCCAGTGTGTTTCAACTTCAACAAGTGCAGTCTCCTTCAACACGGAATAGGAATCAATGGGTAATGTTTGAGATCTTCAGACGACTGAAAATCAATACACGATGAATAAAACTAATTAAACAAGAAAAGAAAAAGACCGAATACATGTACTAAAAACGAGGAACGATCTTCAAGGCTAACTCCCCATTGTTGGTTCAAGCTATCATGAAAGAAAGCCGGGAGTTTTTGGGATAAGAATGCTGCAGTGCAAGGTACATGTTCGGCAAACAAAGGGCAGTTAGCCCGACCGATCCAGAAATCGCGAATATAAATCTAAAATCAAAATCAATTAACAAGTTCGGTTGGAAAACCAGACAAACAAATACATACCAAGAATGGTGCCGCCTCCTCAAATAGAGCATAAGCCTTGCCAGAG-3′。
本发明的香菇栽培菌种241-4的分子标记的检测方法,包括下列步骤:
(1)菌丝培养
将4℃保藏的香菇菌种转接到PDA平板上,23℃~25℃避光培养,10d~14d后接到100mL PDY培养基中,100rpm~150rpm,23℃~25℃摇瓶培养10d~14d后收集菌丝,放入-20℃冰箱保冻备用;
(2)基因组DNA的提取
用改进的CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法提取菌丝的基因组DNA:
1)将-20℃冷冻干燥的香菇菌丝研磨成粉末,加入65℃预热的2×CTAB抽提液,65℃保温45min以上,间或轻摇混匀;
2)12000rpm,4℃离心20min,取上清液;
3)加入等体积的酚、氯仿和异戊醇混合液(混合液的混合体积比为25∶24∶1),轻轻混匀10min,12000rpm,4℃离心10min,取上清液移入新离心管中;
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