[发明专利]三种甘薯病毒的多重RT-PCR检测方法有效
申请号: | 200810049503.2 | 申请日: | 2008-04-07 |
公开(公告)号: | CN101250594A | 公开(公告)日: | 2008-08-27 |
发明(设计)人: | 张振臣;张业辉;张德胜;蒋士君;乔奇;王永江;秦艳红 | 申请(专利权)人: | 河南省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 郑州大通专利商标代理有限公司 | 代理人: | 陈大通 |
地址: | 45000*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甘薯 病毒 多重 rt pcr 检测 方法 | ||
1.三种甘薯病毒的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,
(1)分别合成甘薯潜隐病毒引物SEQ1、SEQ2,甘薯G病毒引物SEQ3、SEQ4和甘薯羽状斑驳病毒引物SEQ5、SEQ6;
其中,SEQ1:5′-CTTCAGTGACGTTGCTGAAGC-3′,
SEQ2:5′-TGCACACCCCTCATTCCTAAG-3′,
SEQ3:5′-CCAAATATCAATGGTGATTGGGT-3′,
SEQ4:5′-CCACGCATTCCAAGTAGTGTGTGT-3′,
SEQ5:5′-GCACCAATGGCAAATGGAAGAATAG-3′,
SEQ6:5′-GAGGTTATGTATATTCCTTGTAAC-3′;
(2)提取感病牵牛叶片的总RNA,作为PCR模板,进行反转录;
(3)将所述SEQ1、SEQ3、SEQ5引物等体积混合形成上游引物混合物,将所述SEQ2、SEQ4、SEQ6引物等体积混合形成下游引物混合物,然后将所述上、下游引物混合物置于PCR反应体系中,以反转录产物作为模板,进行PCR扩增;
(4)用琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。
2.根据权利要求1所述的三种甘薯病毒的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,所述反转录的反应体系为10μl,包括1μl 10×RT buffer、2μl浓度为25mM的MgCl2、1μl浓度各为10mM的dNTP混合物、0.5μl浓度为2.5μM的Oligo dT引物、10U RNase抑制剂、2.5UAMV反转录酶和4.75μl病毒的总RNA;反转录反应程序为:42℃30min,99℃5min,5℃5min。
3.根据权利要求1所述的三种甘薯病毒的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,所述PCR反应体系为50μl,包括10μl 5×PCR buffer、2.5U Taq酶、0.5μl浓度各为10mM的dNTP混合物、1μl上游混合引物、1μl下游混合引物,其中每种引物浓度均为10μM,用5μl反转录产物作模板,用DEPC-H2O补足至50μl。
4.根据权利要求1所述的三种甘薯病毒的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应程序为:94℃预变性2min,94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸2min,30个循环,最后72℃延伸10min。
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