[发明专利]一种辅助筛选籼稻和粳稻的方法

说明书

技术领域

本发明涉及一种辅助筛选籼稻和粳稻的方法。

背景技术

栽培稻是世界上最重要的粮食作物之一，在其11,500多年的栽培稻驯化历史中为适应不同的农业生态环境，栽培稻形成了丰富的遗传多样性和明显的遗传分化，产生了籼稻(indica)和粳稻(japonica)两个不同的生态型(Morishima H，Oka HI.Phylogenetic differentiation of cultivated rice.XXII.Numerableevaluation of the Indica-Japonica differentiation.Japanese Journal ofBreeding，1981，31：402-413；Glaszmann J C.Isozymes and classification ofAsian rice varieties.Theoretical and Applied Genetics，1987，74：21-30；Wang Z Y，Tanksley S D.Restriction fragment length polymorphism in Oryzasativa L.Genome，1989，32：1113-1118；Blair M W，Panaud O，McCouch S R.Inter-simple sequence repeat(ISSR)amplification for analysis ofmicrosatellite motif frequency and fingerprinting in rice(Oryza sativa L.).Theoretical and Applied Genetics，1999，98(5)：780-782.))。它们之间在许多形态和生理性状上存在着明显的差异(Morishima H，Oka H I.Phylogeneticdifferentiation of cultivated rice.Numerical evaluations of theindica-japonica differentiation.Jpn.J.Breed，1981，31：402-413；WANGXiang-Kun，CHENG Kan-Sheng，HUAN Nai-Wei，LUO Jun，LU Yi-Xuan，LIUGuang-Rong.Study on two important rice types concerning the origin anddifferentiation of Asian cultivated rice.Acta Genetica Sinica，1987，14(4)：262-270.)。然而，水稻的籼-粳分化是一个缓慢的进化过程，在许多水稻地方种中存在着典型的籼稻或粳稻，但也存在籼粳分化不明显的中间型，对于这些类型很难用传统的方法来鉴定，更难研究水稻的籼粳分化程度。因此，开发新型的Marker基因及其分子标记来准确鉴定籼稻和粳稻，并且用其研究水稻的进化非常必要。

Sir2(silence information regulator)基因家族是一种保守的从古细菌到哺乳动物都存在的NAD+依赖的组蛋白/非组蛋白去乙酰化酶。在酵母中，Sir2连同与它相互作用的几个蛋白质在基因沉默、基因组稳定性、细胞寿命以及代谢调节上起着不可缺少的作用。其主要的作用机制是：热量限制降低了抑制物烟酰胺的浓度，从而激活了Sir2的组蛋白去乙酰化功能。在哺乳动物中，有7个Sir2同源基因，分别命名为SIRT1到SIRT7。其中SIRT1研究的最多，它在DNA损伤修复、细胞周期控制、抑制细胞凋亡、抵抗氧化逆境和延长细胞寿命方面起着重要作用(王丽辉，金炜元，陈勇，王君晖.Sir2基因家族的功能和作用机制.细胞生物学杂志，2006，6：822-826.)。而在植物中，SIR2基因数量较少。在水稻中仅有2个SIR2基因，即OsSRT1和OsSRT2。2007年，Huang L M等对其中的1个SIR2基因(OsSRT1)进行了研究，研究结果认为基因OsSRT1过表达可增强水稻对氧化胁迫的抗性。关于OsSRT2(LOC_Os12g07950)的功能研究未见报道。

发明内容

本发明的目的是提供一种辅助筛选籼稻和粳稻的方法。

本发明所提供的辅助筛选籼稻和粳稻的方法，是检测待测水稻中是否缺失GenBank accession AL731882中自5’末端第67843-67878位的核苷酸序列，若缺失，则待测水稻为候选籼稻，若不缺失，则待测水稻为候选粳稻。