[发明专利]不同区域普洱茶晒青毛茶的分子鉴别方法无效
申请号: | 200810058670.3 | 申请日: | 2008-07-11 |
公开(公告)号: | CN101353701A | 公开(公告)日: | 2009-01-28 |
发明(设计)人: | 季鹏章;张俊;黄兴奇 | 申请(专利权)人: | 云南省农业科学院茶叶研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N27/447 |
代理公司: | 昆明今威专利代理有限公司 | 代理人: | 康珉 |
地址: | 666201*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 不同 区域 普洱茶 毛茶 分子 鉴别方法 | ||
1.一种不同区域普洱茶晒青毛茶的分子鉴别方法,由样本DNA的提取、选择接头和预扩引物、AFLP引物筛选、AFLP扩增、AFLP-毛细管电泳检测、数据处理和分析六个步骤组成,其特征在于:(1)在AFLP引物筛选中,筛选出E-AAC/M-CTG和E-AAC/M-CTA两对扩增多态性最高的引物,用于AFLP分析,其序列如下,
E-AAC:5’-GACTGCGTACCAATTCAAC-3’
M-CTG:5’-GATGAGTCCTGAGTAACTG-3’
M-CTA:5’-GATGAGTCCTGAGTAACTA-3’;
(2)在AFLP-毛细管电泳检测中,选择性扩增样本检测在CEQ8000遗传分析系统上完成;其上样液:甲酰胺10ul,Size standard-6000.2ul,稀释10倍的Sample 3ul;电压:6KV,电流:4Ma,时间:50min;其扩增产物在高分辨率毛细管中电泳分离,激光激发荧光采集数据,电泳结果通过软件自动统计分析并转化为“0、1”原始数据矩阵备用;同时,导出电泳分离图谱。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:在样本DNA的提取中,样本各取1.0g,分别按照改进的CTAB法提取总DNA,提取的总DNA样本经RNA酶A纯化后,用紫外分光光度计测定260nm和280nm下的光密度值,以确定其纯度和浓度,并将总DNA浓度稀释到200ng/ul,用于PCR反应。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:
EcoR I接头的核苷酸序列为5′-CTCGTAGACTGCGTACC-3’、3′-CTGACGCATGGTTAA-5′;
Mse I接头的核苷酸序列为5′-GACGATGAGTCCTGAG-3′、3′-TACTCAGGACTCAT S′;
EcoR I预扩引物的核苷酸序列为5′-GACTGCGTACCAATTC-3′(E0)、5′-GACTGCGTACCAATTCA-3′(E1);
Mse I预扩引物的核苷酸序列为5′-GATGAGTCCTGAGTAA-3′(M0)、5′-GATGAGTCCTGAGTAAA-3′(M1)。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:在AFLP扩增中,样本DNA经限制性内切酶EcoR I、Mse I分别酶切;双酶切产物加入EcoR I和Mse I接头序列和T4连接酶进行连接;连接产物加入EcoR I和Mse I引物进行预扩增,反应热循环程序为:94℃预变性2min,然后进入循环,每个循环94℃变性20sec,56℃退火30sec,72℃延伸2min,共20个热循环,最后60℃延伸30min,4℃冷却后取出;预扩增产物稀释20倍后,加入选定的引物进行选择性扩增;选择性扩增为两段循环,94℃预变性2min后,第一段循环为:94℃变性20sec,66-56℃退火30sec,72℃延伸2min,共10个热循环;其中,退火温度从66 ℃开始,每个循环降1℃;第二段循环为:94℃变性20sec,56℃退火30sec,72℃延伸2min,共20个循环,最后60℃延伸30min,冷却后取出检测;扩增反应在MJ Research PTC200-wellthermal cycler仪上进行。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:得到的原始数据矩阵,用POPGENE version1.32软件进行遗传多样性分析,获得居群遗传多样性以常规的多态位点百分率(P),Nei′s基因多样性指数He,Shannon多样性指数Ho,基因多样度Ht;同时,进行电泳分离图谱的特征峰比对分析。
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