[发明专利]一种用于检测胃组织的低表达piRNA探针及其检测方法

说明书

技术领域

本发明涉及piRNA，具体涉及一种用于检测胃组织的低表达piRNA探针及其检测方法。 

背景技术

真核基因组中除了有编码蛋白质的基因外，还有一大部分DNA被转录成非编码RNA(noncoding RNAs，ncRNAs)。近年来的研究发现，许多ncRNA可在多个层次上调节着基因的表达，特别是小RNA在基因表达调控中的作用及其与疾病发生、发展的关系越来越引起了人们的重视。前期研究已经发现了2类对基因表达有重要调控作用的小RNA——短干扰RNA(short interfering RNA，siRNA)和微小RNA(microRNA，miRNA)。 

2006年俄罗斯、日本和美国的四家实验室几乎同时报道，在生物体内存在除siRNA和miRNA以外的另一类小RNA。这些小RNA与前2类小RNA的主要区别在于其长度更长(约为30个核苷酸)和采用不同的机制实现对基因表达的调控。因此，这类RNA被称为第三类小RNA。目前已从多种生物中发现了第三类小RNA。研究发现，它们可与小鼠和大鼠的阿格蛋白亚家族Piwi相互作用，因此根据其功能将其命名为Piwi相互作用RNA(Piwi-interacting RNA，piRNA)。 

阿格蛋白(argonaute protein)的主要功能与小分子RNA相关的基因沉默作用有密切关系。RNA沉默作用通过降解mRNA、抑制翻译和重建染色体等方式调节基因的表达。RNA沉默主要通过RNA诱导沉默复合物(RNA-induced silencing complex，RISC)和转录的基因沉默RNA诱导起始复合物(RNA-induced initiation of transcriptional genesilencing，RITS)来发挥作用。这些复合物的主要成分包括小分子RNA和阿格蛋白。阿格蛋白家族是在所有RISC和RITS复合物中均存在的唯一共同成分。这说明阿格蛋白在小分子RNA相关的RNA沉默机制中具有独特的功能。也说明piRNA在基因表达调控中起着重要作用。 

我国是胃癌高发区，现有的技术中均没有涉及到胃组织的癌变与哪些低表达的piRNA有关。 

发明内容

本发明所要解决的技术问题是提供一种用于检测胃组织的piRNA异常表达的探针，还提供了利用该探针检测胃癌组织的piRNA低表达的方法。 

本发明解决上述技术问题所采用的技术方案为：一种用于胃组织的低表达piRNA探针，探针的序列由化学修饰过的寡聚核苷酸编码片段和延伸臂片段组成，所述的寡聚核苷酸编码片段为至少一种下述piRNA序列：hsa_piR_000370，hsa_piR_009567，hsa_piR_000216，hsa_piR_000728，hsa_piR_010229，hsa_piR_000990，hsa_piR_000460，hsa_piR_006105，hsa_piR_005837，hsa_piR_007743，hsa_piR_009884，hsa_piR_000001和hsa_piR_004611。 

所述的寡聚核苷酸编码片段为hsa_piR_000370序列。 

所述的寡聚核苷酸编码片段为hsa_piR_000370序列和hsa_piR_009567序列组成。 

所述的寡聚核苷酸编码片段为hsa_piR_000370序列、hsa_piR_009567序列和hsa_piR_000460序列组成。 

所述的寡聚核苷酸编码片段还包括至少一种下述piRNA序列：hsa_piR_000397，hsa_piR_000781，hsa_piR_010053，hsa_piR_000459，hsa_piR_009981，hsa_piR_001440，hsa_piR_008983，hsa_piR_005378，hsa_piR_001445，hsa_piR_014109，hsa_piR_001207，hsa_piR_000160和hsa_piR_007871。 

所述的寡聚核苷酸编码片段为hsa_piR_000370序列、hsa_piR_009567序列、hsa_piR_000460序列和hsa_piR_000397序列组成。