[发明专利]核苷酸序列阵列和使用该阵列的方法无效
申请号: | 200810095172.6 | 申请日: | 2008-03-12 |
公开(公告)号: | CN101275168A | 公开(公告)日: | 2008-10-01 |
发明(设计)人: | K·埃伦费尔德斯托尔岑巴赫;J·乌加尔德;A·阿拉韦纳杜阿尔特;N·卢瓦拉;A·马斯塞普尔韦达;P·帕拉达巴尔德坎托斯;R·巴迪利亚奥尔鲍姆 | 申请(专利权)人: | 拜奥希格马公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/02 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 罗菊华 |
地址: | 智利*** | 国省代码: | 智利;CL |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核苷酸 序列 阵列 使用 方法 | ||
1. 用于微生物样品中检测和鉴定基因的核苷酸序列阵列,所述基因编码具有生物技术中相关活性的蛋白,其特征在于该阵列包括附着于其表面的下列DNA片段中的一种、数种或者所有种:
a.至少一种特异鉴定编码生物膜形成相关蛋白的基因的DNA片段;
b.至少一种特异鉴定编码CO2固定相关蛋白的基因的DNA片段;
c.至少一种特异鉴定编码能量代谢相关蛋白的基因的DNA片段;
d.至少一种特异鉴定编码趋化性和移动性相关蛋白的基因的DNA片段;
e.至少一种特异鉴定编码铁氧化相关蛋白的基因的DNA片段;
f.至少一种特异鉴定编码氮代谢相关蛋白的基因的DNA片段;
g.至少一种特异鉴定编码硫同化相关蛋白的基因的DNA片段;
h.至少一种特异鉴定编码硫化化合物氧化/还原相关蛋白的基因的DNA片段;
其中每种DNA片段都存在数百个拷贝,形成同源组分的斑点,并立体分布于支持物表面。
2. 如权利要求1所述的阵列,其特征在于特异鉴定编码生物膜形成相关蛋白的基因的DNA片段,选自序列号1-86所限定的DNA片段和它们的反向互补序列。
3. 如权利要求2所述的阵列,其特征在于DNA片段是完整的DNA片段,或者在具有所述片段产生的特异性的更长序列内,或者为类似于其包含的任意子片段。
4. 如权利要求3所述的阵列,其特征在于子片段优选包含50-70个核苷酸。
5. 如权利要求1所述的阵列,其特征在于特异鉴定编码CO2固定过程相关蛋白的基因的DNA片段选自序列号87-101所限定的DNA片段和它们的反向互补序列。
6. 如权利要求5所述的阵列,其特征在于DNA片段是完整的DNA片段,或者在具有所述片段产生的特异性的更长序列内,或者为类似于其包含的任意子片段。
7. 如权利要求6所述的阵列,其特征在于子片段优选包含50-70个核苷酸。
8. 如权利要求1所述的阵列,其特征在于特异鉴定编码能量代谢相关蛋白的基因的DNA片段选自序列号102-156所限定的DNA片段和它们的反向互补序列。
9. 如权利要求8所述的阵列,其特征在于DNA片段是完整的DNA片段,或者在具有所述片段产生的特异性的更长序列内,或者为类似于其包含的任意子片段。
10. 如权利要求9所述的阵列,其特征在于子片段优选包含50-70个核苷酸。
11. 如权利要求1所述的阵列,其特征在于特异鉴定编码趋化性和移动性相关蛋白的基因的DNA片段选自序列号157-192和它们的反向互补序列所限定的DNA片段。
12. 如权利要求11所述的阵列,其特征在于DNA片段是全长DNA片段,或者在具有所述片段产生的特异性的更长序列内,或者为类似于其包含的任意子片段。
13. 如权利要求12所述的阵列,其特征在于子片段优选包含50-70个核苷酸。
14. 如权利要求1所述的阵列,其特征在于特异鉴定编码铁氧化相关蛋白的基因的DNA片段选自序列号193-197和它们的反向互补序列所限定的DNA片段。
15. 如权利要求14所述的阵列,其特征在于DNA片段是全长DNA片段,或者在具有所述片段产生的特异性的更长序列内,或者为类似于其包含的任意子片段。
16. 如权利要求15所述的阵列,其特征在于子片段优选包含50-70个核苷酸。
17. 如权利要求1所述的阵列,其特征在于特异鉴定编码氮代谢相关蛋白的基因的DNA片段选自序列号198-203和它们的反向互补序列所限定的DNA片段。
18. 如权利要求17所述的阵列,其特征在于DNA片段是全长DNA片段,或者在具有所述片段产生的特异性的更长序列内,或者为类似于其包含的任意子片段。
19. 如权利要求18所述的阵列,其特征在于子片段优选包含50-70个核苷酸。
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