[发明专利]一种定量分析RNA突变有害性的方法无效
申请号: | 200810111511.5 | 申请日: | 2008-06-05 |
公开(公告)号: | CN101281562A | 公开(公告)日: | 2008-10-08 |
发明(设计)人: | 王升启;舒文杰;伯晓晨 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100850*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 定量分析 rna 突变 有害 方法 | ||
1. 一种定量分析RNA突变有害性的方法,其特征在于所述的方法融合了RNA突变的位点结构有害性和RNA突变的位点序列有害性的信息,定量分析RNA突变的有害性。
2. 根据权利要求1所述的一种定量分析RNA突变有害性的方法,其中所说的RNA突变的位点结构有害性,其特征是,它的计算包括下列步骤:
1)接收来自计算机终端输入的RNA序列,判别该序列的合法性;
2)产生突变体;
3)通过RNA折叠算法,得到输入序列及其突变体的结构整体;
4)计算输入的RNA序列与其突变体之间的结构整体的距离;
5)根据位点结构有害性评估函数,计算位点结构有害性。
3. 根据权利要求1所述的一种定量分析RNA突变有害性的方法,其中所说的RNA突变的位点序列有害性,其特征是,它的计算包括下列步骤:
1)接收来自计算机终端输入的RNA序列及其同源序列,判别它们的合法性;
2)多序列比对;
3)根据位点序列有害性评估函数,计算位点序列有害性。
4. 根据权利要求2所述的位点结构有害性评估函数,其特征是,它将输入的RNA序列与其突变体序列之间的结构整体的距离作为RNA突变位点结构有害性的一种定量度量。
5. 根据权利要求3所述的位点序列有害性评估函数是位点信息函数的函数,其特征是,它满足五个性质,其中的位点信息函数f(pr(i))可以采用线性函数或双曲正切函数的形式。
6. 根据权利要求1所述的位点结构有害性和位点序列有害性的信息融合,其特征是,它是指位点结构有害性评估函数乘以位点序列有害性评估函数。
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