[发明专利]一种环境水体样品中多种肠道病原菌的同时定量检测方法无效
申请号: | 200810150351.5 | 申请日: | 2008-07-16 |
公开(公告)号: | CN101333557A | 公开(公告)日: | 2008-12-31 |
发明(设计)人: | 刘永军;王晓昌;张崇淼 | 申请(专利权)人: | 西安建筑科技大学 |
主分类号: | C12Q1/10 | 分类号: | C12Q1/10;C12Q1/06;C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 710055*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 环境 水体 样品 多种 肠道 病原菌 同时 定量 检测 方法 | ||
1.一种环境水体样品中多种肠道病原细菌同时快速定量检测方法,其特征在于,该方法运用肠道病原细菌PCR通用引物,建立实时荧光定量聚合酶链式反应体系,定量测定环境水体中大肠杆菌、霍乱弧菌、痢疾杆菌、伤寒杆菌的细菌细胞密度,具体包括下列步骤:
步骤一,设计并合成肠道病原细菌PCR通用引物:
该肠道病原细菌PCR通用引物的分为上游引物和下游引物,其核苷酸序列分别为:
上游引物:5’-aaggcgacgatccctagctggtctgagaggatga/c-3’,
下游引物:5’-gcttgccagtatcagatgcagttcccaggttgagc-3’;
步骤二,制作定量PCR标准曲线:
标准曲线的纵坐标是已知细胞浓度的埃希氏大肠杆菌梯度稀释DNA提取物QPCR检测的CT值,横坐标是相应的埃希氏大肠杆菌细胞密度;
步骤三,细菌浓缩回收及细菌DNA提取:
地表水水样通过离心收集细菌细胞,细菌DNA的提取采用细菌裂解缓冲液及苯酚-氯仿法提取;
步骤四,定量PCR反应体系及相关参数的确定:
QPCR扩增反应体系总体积25μL,内含1×realMastrMix/1×SYBRsolution,dNTP 0.2mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0U,1×PCR缓冲液,2.0mmol/LMgCl2,上下游引物分别为0.1mmol/L,DNA模板2μL;
PCR扩增条件:94℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环,最后72℃链延伸5min;阴性对照中,用灭菌双蒸水代替DNA模板,每隔0.2s自动读数一次,阈值设定为最初的3~7个循环荧光值标准偏差的10倍;
步骤五,结果计算:
通过已知细胞数量的埃希氏大肠杆菌QPCR标准曲线,即可确定环境水样中目标细菌细胞的数量。
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