[发明专利]一种应用悬浮芯片技术检测宋内志贺氏菌方法无效
申请号: | 200810181200.6 | 申请日: | 2008-11-27 |
公开(公告)号: | CN101440404A | 公开(公告)日: | 2009-05-27 |
发明(设计)人: | 王景林;赵金银;高姗;刘艳华;康琳 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;G01N21/64 |
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地址: | 100071*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 应用 悬浮 芯片 技术 检测 宋内志贺氏菌 方法 | ||
1.一种用于宋内志贺氏菌检测的悬浮芯片,包括诊断微球和与此诊断微球耦联的寡聚核苷酸探针,其特征是该寡聚核苷酸探针是宋内志贺氏菌O-抗原聚合酶基因rfc上的一段序列。
2.根据权利要求1所述用于宋内志贺氏菌检测的悬浮芯片,其中寡聚核苷酸探针如序列表中序列3所示,在其5′进行NH2-(CH2)12修饰。
3.根据权利要求1或2所述用于宋内志贺氏菌检测的悬浮芯片,其特征是该芯片可鉴定和检测宋内志贺氏菌。
4.根据权利要求1或2所述用于宋内志贺氏菌检测的悬浮芯片,其特征在于包括一对特异性引物,引物序列如序列表中序列1和2所示,并对序列1进行5′Biotin修饰。
5.权利要求1或2所述用于宋内志贺氏菌检测的悬浮芯片的制备方法,包括如下步骤:制备寡聚核苷酸探针;用纯水稀释氨基修饰的探针;将储备的微球振荡,然后转移到棕色EP管中;离心收集微球,加入MES液进行振荡;向悬浮微球中加入上述探针,并振荡;在微球溶液中加入新配制的EDC溶液,振荡;然后进行温育;再次向微球溶液中加入新配置的10mg/ml EDC,振荡,然后进行温育;向微球溶液中加0.02% Tween-20,离心收集微球;用0.1% SDS重悬微球,离心收集微球;用TE悬浮微球;用血球计数板计算微球的个数,2—8℃,避光保存。
6.权利要求1或2所述用于宋内志贺氏菌检测的悬浮芯片使用方法,包括以下步骤:
a)根据宋内志贺氏菌rfc基因设计并合成用于PCR扩增的特异性引物,并对其中一条引物进行Biotin修饰;
b)按常规方法制备的待检样本基因组DNA,并使用步骤a)中的引物对待检样本基因组DNA进行PCR扩增,同时使PCR产物带上Biotin修饰;
c)将步骤b)中的PCR产物与权利要求1中所述悬浮芯片杂交;
d)对步骤c)中杂交悬浮芯片进行链霉亲和素化藻红蛋白标记,并对其检测荧光信号。
7.根据权利要求6所述的一种检测宋内志贺氏菌的方法,其特征是上述步骤b)所建立的PCR反应体系如下:
表格1 PCR反应体系
PCR反应程序为:37℃温育5min;94℃变性3min;运行35个循环:94℃ 30sec,53℃ 30sec,72℃ 40sec;最后,72℃延伸3min。
8.根据权利要求4所述的一种检测宋内志贺氏菌的方法,其中杂交温度为52℃,杂交时间为大于15min。
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