[发明专利]硫链丝菌素的生物合成基因簇无效
申请号: | 200810202416.6 | 申请日: | 2008-11-07 |
公开(公告)号: | CN101445803A | 公开(公告)日: | 2009-06-03 |
发明(设计)人: | 刘文;廖日晶;虞沂;段炼;雷春;丁莹 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海有机化学研究所 |
主分类号: | C12N15/54 | 分类号: | C12N15/54;C12N15/55;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/31;C07K14/195 |
代理公司: | 上海新天专利代理有限公司 | 代理人: | 邬震中 |
地址: | 200032*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 硫链丝 菌素 生物 合成 基因 | ||
1.一种抗革兰氏阳性菌活性的抗生素—硫链丝菌素的生物合成基因簇,其特征在于编码硫链丝菌素生物合成所涉及的22个基因,具体为:
1)1个氨基转移酶基因,即tsrA:
tsrA位于基因簇核苷酸序列第3774-2686个碱基处,长度为1089个碱基对,氨基转移酶,362个氨基酸;
2)脂肪酶基因,即tsrB:
tsrB位于基因簇核苷酸序列第4626-3796个碱基处,长度为831个碱基对,编码脂肪酶,276个氨基酸;
3)天门冬酰胺合成酶基因,即:tsrC
tsrC位于基因簇核苷酸序列第6541-4685个碱基处,长度为1857个碱基对,编码天门冬酰胺合成酶,618个氨基酸;
4)酯环化酶基因,即基因tsrD:
tsrD位于基因簇核苷酸序列第个7088-6681碱基处,长度为408个碱基对,编码酯环化酶,135个氨基酸;
5)酰基-CoA脱氢酶基因,即tsrE:
tsrE位于基因簇核苷酸序列第8449-7163个碱基处,长度为1287个碱基对,编码酰基-CoA脱氢酶,428个氨基酸;
6)甲基转移酶基因,即tsrF:
tsrF位于基因簇核苷酸序列第9529-8594个碱基处,长度为936个碱基对,编码甲基基转移酶,311个氨基酸;
7)与thiostrepton侧链生物合成相关但具体功能未知的基因,即:tsrG:
tsrG位于基因簇核苷酸序列第10241-9600个碱基处,长度为642个碱基对,编码一个未知功能蛋白,213个氨基酸;
8)前体肽基因,即tsrH:
tsrH位于基因簇核苷酸序列第10570-10746个碱基处,长度为177个碱基对,编码Thiostrepton前体肽,58个氨基酸;
9)水解酶基因,即tsrI:
tsrI位于基因簇核苷酸序列第11461-12054个碱基处,长度为594个碱基对,编码水解酶,197个氨基酸;
10)脱水酶基因,即tsrJ:
tsrJ位于基因簇核苷酸序列第12047-14848个碱基处,长度为2802个碱基对,编码脱水酶,933个氨基酸;
11)脱水酶基因,即tsrK:
tsrK位于基因簇核苷酸序列第14845-15885个碱基处,长度为1041个碱基对,编码脱水酶,346个氨基酸;
12)与thiostrepton大环合成相关具体功能未知基因,即tsrL:
tsrL位于基因簇核苷酸序列第15872-16978个碱基处,长度为1107个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,368个氨基酸;
13)NADH依赖的氧化酶基因,即tsrM:
tsrM位于基因簇核苷酸序列第16975-18744个碱基处,长度为1770个碱基对,编码NADH依赖的氧化酶,589个氨基酸;
14)与thiostrepton大环合成相关具体功能未知基因,即tsrN:
tsrN位于基因簇核苷酸序列第18741-20579个碱基处,长度为1839个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,612个氨基酸;
15)与thiostrepton大环合成相关具体功能未知基因,即tsrO:
tsrO位于基因簇核苷酸序列第20576-22621个碱基处,长度为2046个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,681个氨基酸;
16)细胞色素P450氧化酶基因,即tsrP:
tsrN位于基因簇核苷酸序列第22599-24023个碱基处,长度为1425个碱基对,编码细胞色素P450氧化酶,474个氨基酸;
17)酰基-CoA合成酶,即tsrQ:
tsrQ位于基因簇核苷酸序列第23999-25312个碱基处,长度为1314个碱基对,编码酰基-CoA合成酶,437个氨基酸;
18)细胞色素P450氧化酶基因,即tsrR:
tsrR位于基因簇核苷酸序列第25422-26612个碱基处,长度为1191个碱基对,编码细胞色素氧化酶,396个氨基酸;
19)脱水酶基因,即tsrS:
tsrS位于基因簇核苷酸序列第26603-29413个碱基处,长度为2811个碱基对,编码脱水酶,936个氨基酸;
20)铁硫簇氧化还原酶基因,即tsrT:
tsrT位于基因簇核苷酸序列第29430-31229个碱基处,长度为1800个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,599个氨基酸;
21)短链脱氢酶基因,即tsrU:
tsrU位于基因簇核苷酸序列第31226-32044个碱基处,长度为819个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,272个氨基酸;
22)与thiostrepton大环合成相关具体功能未知基因,即tsrV:
tsrV位于基因簇核苷酸序列第32391-33113个碱基处,长度为744个碱基对,编码一个具体功能未知的蛋白,247个氨基酸。
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