[发明专利]一种检测核酸点突变的方法无效

专利信息
申请号: 200810208117.3 申请日: 2008-12-29
公开(公告)号: CN101768628A 公开(公告)日: 2010-07-07
发明(设计)人: 姚见儿;白艳军;谈畅;李久彤 申请(专利权)人: 上海透景生命科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 徐迅
地址: 201203上海市浦*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 核酸 突变 方法
【权利要求书】:

1.一种用于检测核酸点突变的探针,其特征在于,所述探针的结构如式I所示:

Z-L-B    (式I)

式中,

B表示探针与靶核酸结合的核酸结合区;

Z表示可有可无的固相载体;

L是连接臂;当Z不存在时,L是用于将B连接于Z的连接臂;当Z存在时,L是已经将B与Z相连的连接臂;

并且,所述的探针与靶核酸结合的结合区B具有式II所示的5’-3’结构:

S1-P1-S2-P2-S3    (式II)

式中,

P1和P2分别是一个碱基,其中的一个是针对突变位点的碱基,该碱基与野生型序列互补但与突变型序列不互补,或者该碱基与野生型序列不互补但与突变型序列互补;而另一个是辅助性的不匹配碱基,该碱基既与野生型序列不互补,也与突变型序列不互补;

S1是与野生型序列和突变型序列互补的结合区5’端核苷酸序列,其长度为X1个碱基;

S2是与野生型序列和突变型序列互补的结合区中部核苷酸序列,其长度为X2个碱基;

S3是与野生型序列和突变型序列互补的结合区3’端核苷酸序列,其长度为X3个碱基;

其中,X1、X2和X3的长度差的绝对值同时满足以下条件:

|X1-X2|≤4;

|X3-X2|≤4;

|X1-X3|≤4;

并且|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤8。

2.如权利要求1所述的探针,其特征在于,|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤6,更佳地|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤4,最佳地|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|=0。

3.如权利要求1所述的探针,其特征在于,X1、X2和X3的长度差的绝对值同时满足以下条件:

|X1-X2|≤3;

|X3-X2|≤3;

|X1-X3|≤3。

4.如权利要求1所述的探针,其特征在于,X1、X2和X3的长度差的绝对值同时满足以下条件:

|X1-X2|≤2;

|X3-X2|≤2;

|X1-X3|≤2。

5.如权利要求1所述的探针,其特征在于,所述的探针与靶核酸结合的结合区B的长度为15-25个碱基,更佳地为16-22个碱基。

6.如权利要求1所述的探针,其特征在于,所述的连接臂的长度为8-30个碱基。

7.如权利要求1所述的探针,其特征在于,所述的固相载体是荧光编码微球、膜条或玻片。

8.一种检测核酸样品是否存在点突变的检测方法,其特征在于,包括步骤:

将权利要求1所述的探针与待检测核酸样品进行杂交,并检测是否形成“待检测核酸-探针”杂交复合物,其中未形成所述的杂交复合物就表示样品存在所述的点突变,而形成所述的杂交复合物就表示样品存在所述的点突变。

9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,该方法还包括将检测结果与阳性对照和阴性对照进行比较。

10.一种用于核酸点突变的试剂盒,其特征在于,包括:容器以及位于容器中的权利要求1所述的探针。

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