[发明专利]一种检测核酸点突变的方法无效
申请号: | 200810208117.3 | 申请日: | 2008-12-29 |
公开(公告)号: | CN101768628A | 公开(公告)日: | 2010-07-07 |
发明(设计)人: | 姚见儿;白艳军;谈畅;李久彤 | 申请(专利权)人: | 上海透景生命科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 徐迅 |
地址: | 201203上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 核酸 突变 方法 | ||
1.一种用于检测核酸点突变的探针,其特征在于,所述探针的结构如式I所示:
Z-L-B (式I)
式中,
B表示探针与靶核酸结合的核酸结合区;
Z表示可有可无的固相载体;
L是连接臂;当Z不存在时,L是用于将B连接于Z的连接臂;当Z存在时,L是已经将B与Z相连的连接臂;
并且,所述的探针与靶核酸结合的结合区B具有式II所示的5’-3’结构:
S1-P1-S2-P2-S3 (式II)
式中,
P1和P2分别是一个碱基,其中的一个是针对突变位点的碱基,该碱基与野生型序列互补但与突变型序列不互补,或者该碱基与野生型序列不互补但与突变型序列互补;而另一个是辅助性的不匹配碱基,该碱基既与野生型序列不互补,也与突变型序列不互补;
S1是与野生型序列和突变型序列互补的结合区5’端核苷酸序列,其长度为X1个碱基;
S2是与野生型序列和突变型序列互补的结合区中部核苷酸序列,其长度为X2个碱基;
S3是与野生型序列和突变型序列互补的结合区3’端核苷酸序列,其长度为X3个碱基;
其中,X1、X2和X3的长度差的绝对值同时满足以下条件:
|X1-X2|≤4;
|X3-X2|≤4;
|X1-X3|≤4;
并且|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤8。
2.如权利要求1所述的探针,其特征在于,|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤6,更佳地|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤4,最佳地|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|=0。
3.如权利要求1所述的探针,其特征在于,X1、X2和X3的长度差的绝对值同时满足以下条件:
|X1-X2|≤3;
|X3-X2|≤3;
|X1-X3|≤3。
4.如权利要求1所述的探针,其特征在于,X1、X2和X3的长度差的绝对值同时满足以下条件:
|X1-X2|≤2;
|X3-X2|≤2;
|X1-X3|≤2。
5.如权利要求1所述的探针,其特征在于,所述的探针与靶核酸结合的结合区B的长度为15-25个碱基,更佳地为16-22个碱基。
6.如权利要求1所述的探针,其特征在于,所述的连接臂的长度为8-30个碱基。
7.如权利要求1所述的探针,其特征在于,所述的固相载体是荧光编码微球、膜条或玻片。
8.一种检测核酸样品是否存在点突变的检测方法,其特征在于,包括步骤:
将权利要求1所述的探针与待检测核酸样品进行杂交,并检测是否形成“待检测核酸-探针”杂交复合物,其中未形成所述的杂交复合物就表示样品存在所述的点突变,而形成所述的杂交复合物就表示样品存在所述的点突变。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,该方法还包括将检测结果与阳性对照和阴性对照进行比较。
10.一种用于核酸点突变的试剂盒,其特征在于,包括:容器以及位于容器中的权利要求1所述的探针。
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