[发明专利]IL1R1基因启动子区的SNP位点、其确定法及应用无效
申请号: | 200810208251.3 | 申请日: | 2008-12-30 |
公开(公告)号: | CN101768631A | 公开(公告)日: | 2010-07-07 |
发明(设计)人: | 刘艳;金玮 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 王函 |
地址: | 200025上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | il1r1 基因 启动 子区 snp 确定 应用 | ||
1.一种IL1R1基因启动子区域中的SNP位点,其特征在于:是IL1R1基因启动子区域-1253位的T/C多态,具有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。
2.如权利要求1所述的IL1R1基因启动子区域中的SNP位点,其特征在于:所述IL1R1基因启动子区域-1253位的T/C多态,是IL1R1基因T/C多态中的CC基因型多态。
3.一种IL1R1基因启动子区域中的SNP位点的确定方法,包括步骤:
1)提取宿主细胞的基因组DNA;
2)将模板DNA进行PCR扩增,并将PCR产物纯化;
3)纯化后的PCR产物进行DNA测序,从而确定SNP位点。
4.如权利要求3所述的IL1R1基因启动子区域中的SNP位点的确定方法,其特征在于:所述步骤2)中的PCR扩增引物和步骤3)中的测序引物都为上游:3’-gcctggaactggtgattgg-5’,下游:3’-cagcctgagtgacagagtgaga-5’。
5.一种IL1R1基因启动子区域中的SNP位点的基因型确定方法,包括步骤:
1)提取宿主细胞的基因组DNA;
2)将模板DNA进行PCR扩增,并将PCR产物纯化;
3)纯化后的PCR产物进行PCR延伸反应,树脂纯化;
4)芯片点样后,质谱检测,进行数据分析,从而确定SNP位点的基因型。
6.如权利要求5所述的IL1R1基因启动子区域中的SNP位点的基因型确定方法,其特征在于:所述步骤2)中的PCR 扩增的引物是上游:3’-acgttggatggtctcgcatggttagaaaatc-5’,下游:3’-acgttggatgccatctcaaaaaaaaaaaagg-5’;步骤3)中的延伸反应的引物是下游:3’-atgctttttaaacaaatacagg-5’。
7.一种IL1R1基因启动子区域中的SNP位点在冠心病方面的应用。
8.如权利要求7所述的IL1R1基因启动子区域中的SNP位点在冠心病方面的应用,其特征在于:所述冠心病方面是控制冠心病发病、冠状动脉粥样硬化病变程度或脂代谢异常方面。
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