[发明专利]一种提高淀粉液化芽孢杆菌fengycin产量的启动子置换方法无效

专利信息
申请号: 200810243721.X 申请日: 2008-12-12
公开(公告)号: CN101475944A 公开(公告)日: 2009-07-08
发明(设计)人: 陆兆新;孙会刚;别小妹;吕凤霞;乌云达来;卢亚萍;王煜;曹林 申请(专利权)人: 南京农业大学
主分类号: C12N15/52 分类号: C12N15/52;C12N15/11;C12N1/21;C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/07
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 代理人: 张素卿
地址: 210095江苏省*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 提高 淀粉 液化 芽孢 杆菌 fengycin 产量 启动子 置换 方法
【权利要求书】:

1.一种提高淀粉液化芽孢杆菌fengycin产量的启动子置换方法,是将野生型淀粉液化芽孢杆菌ES-2的fengycin合成酶基因的启动子Ppps置换为启动子P59的方法,其特征在于,

1)启动子P59序列的克隆

设计启动子P59的引物:

上游引物:5’-ctttattgttttgccatt-3’

下游引物:5’-ggataagaaagtgaaataacaaactgtcaaataaagta-3’

采用上述引物并以质粒pHB201做为模板,扩增获得一个长377bp的P59启动子序列;

2)fengycin合成酶基因同源片段及新霉素抗性基因的克隆

设计淀粉液化芽孢杆菌fengycin合成酶基因5’端的DNA片段引物序列,

上游引物:5’-tactttatttgaagtttgttatttcactttcttatcc-3’

下游引物:5’-ccaaacttcttgtctg-3’

以淀粉液化芽孢杆菌ES-2基因组DNA为模板,扩增获得一个长450bp的fengycin合成酶基因同源片段SEQ ID NO.1,即淀粉液化芽孢杆菌fengycin合成酶基因5’端部分片段;

设计新霉素抗性基因的引物,

上游引物:5’-ccggaattcgcgaccttccactcaccggtt-3’

下游引物:5’-ccggaattccggggcaatgaaattagactat-3’

从质粒pMK3扩增得到新霉素抗性基因片段1153bp;

3)同源整合载体的构建

将PCR产物分别纯化后,通过SOE PCR的方法将启动子P59DNA片段和fengycin合成酶基因同源片段连接到一起,ddH2O重溶,与pMD19-T载体连接,得到质粒载体pMD19-T1,然后在质粒载体pMD19-T1的EcoRI位点加上新霉素抗性基因,得到质粒载体pMD19-T2,将pMD19-T2转化大肠杆菌TOP10F’,获得同源整合载体转化的大肠杆菌TOP10F’;

4)同源整合载体转化淀粉液化芽孢杆菌野生菌株ES-2

将同源整合载体转化的大肠杆菌TOP10F’,提取同源整合载体质粒,转化感受态淀粉液化芽孢杆菌野生菌株ES-2,获得同源整合载体转化的淀粉液化芽孢杆菌ES-2菌株,即启动子P59置换的菌株。

2.权利要求1所述方法得到的置换菌株。

3.权利要求2所述置换菌株的鉴定方法,其特征在于:

设计引物:

上游引物:5’-ctttattgttttgccatt-3; 

下游引物:5’-ccaaacttcttcgtctg-3,

以启动子P59置换的菌株基因组DNA为模板,在100μl体系中,引物终浓度各为1μM,dNTPs终浓度为0.2mM,淀粉液化芽孢杆菌基因组DNA10ng,4U pfu DNA聚合酶;扩增程序为94℃2min;30个循环:94℃50s,53℃50s,72℃90s;72℃10min;

如果扩增得到大小826bp的DNA片段,即是启动子P59片段和淀粉液化芽孢杆菌ES-2fengycin合成酶基因5’端部分DNA片段连接到一起,并整合到野生淀粉液化芽孢杆菌ES-2的基因组DNA中的DNA片段,即为启动子P59置换的菌株。 

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