[发明专利]构象约束多肽序列的组合文库

权利要求书

1.一种物理上可选择的展示，其包含一种或多种天然或变异多肽的离散或 随机片段的串联或多聚体装配物，或模拟所述片段的序列的串联或多聚 体装配物，其中至少一些所述装配物形成构象约束多肽靶物，并且其中 至少一些所述片段不同于抗体片段。

2.权利要求1的展示，其是构象性表位文库。

3.权利要求1的展示，其包含超过一种多肽的离散或随机片段的串联或多 聚体装配物，或模拟所述片段的序列的串联或多聚体装配物。

4.权利要求1的展示，其中至少一些所述串联或多聚体装配物包含两种或 更多种来自相同多肽的不同部分的片段，或模拟所述片段的序列。

5.权利要求1的展示，其中至少一些所述串联或多聚体装配物包含来自不 同多肽的片段，或模拟所述片段的序列。

6.权利要求1的展示，其中至少一些所述串联或多聚体装配物包含抗体或 抗体片段和所述抗体或抗体片段的配体。

7.权利要求1的展示，其中在所述串联或多聚体装配物中，至少一些所述 片段或序列是彼此直接融合的。

8.权利要求1的展示，其中在所述串联或多聚体装配物中，至少一些所述 片段或序列是由外源连接序列偶联的。

9.权利要求1的展示，其中在所述串联或多聚体装配物中，至少一些所述 片段或序列由结构支持元件组成或包含结构支持元件。

10.权利要求1的展示，其中至少一些所述构象约束多肽靶物是由于所述串 联或多聚体装配物中所存在的所述片段或模拟序列的接近性而形成的。

11.权利要求1的展示，其中至少一些所述构象约束多肽靶物是由于所述串 联或多聚体装配物中所述结构支持元件的存在而形成的。

12.权利要求11的展示，其中所述结构支持元件是一种或多种蛋白质家族的 特征性基序。

13.权利要求11的展示，其中所述结构支持元件选自下组：螺旋束、β-片层 结构、三叶结构、跨膜螺旋、和胞外环。

14.权利要求1的展示，其中所述构象约束多肽靶物包含受体序列。

15.权利要求14的展示，其中所述受体序列包括受体的结构基序。

16.权利要求1的展示，其选自下组：体内和体外展示系统。

17.权利要求16的展示系统，其选自下组：病毒的、真核生物的、细菌的、 核糖体、mRNA、和DNA展示系统。

18.权利要求17的展示，其是噬菌体展示。

19.权利要求17的展示，其中所述真核生物展示系统是哺乳动物或酵母展 示。

20.权利要求17的展示，其中所述细菌展示系统是细菌细胞或孢子展示。

21.权利要求20的展示，其中所述细菌展示系统是枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)或苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)孢子展示。

22.权利要求11的展示，其中所述细菌展示系统是苏云金芽孢杆菌孢子展 示。

23.一种筛选方法，包括

(a)提供物理上可选择的展示，其包含一种或多种天然或变异多肽的离 散或随机片段的串联或多聚体装配物，或模拟所述片段的序列的串 联或多聚体装配物，其中至少一些所述装配物形成构象约束多肽靶 物，并且其中至少一些所述片段不同于抗体片段；

(b)使所述展示与候选结合配偶体的文库在如下条件下接触，其中彼此 具有结合亲和力的构象约束多肽靶物和候选结合配偶体形成靶物- 结合配偶体复合物；并

(c)检测至少一些所形成的靶物-结合配偶体复合物。

24.权利要求23的方法，其进一步包括步骤(d)鉴定参与至少一些所检测出的 靶物-结合配偶体复合物形成的靶序列。