[发明专利]急性传播的HIV包膜标记物

说明书

本申请要求享有2007年3月27日提交的美国临时申请第60/907,259号的优先权，其全部内容引入本文作为参考。

本发明是在美国国立卫生研究院授予的政府资助下(基金号A10678501)完成的。美国政府对本发明享有一些权利。

技术领域

本发明主要涉及人类免疫缺陷性病毒(HIV)，具体而言，涉及在患者中诱导针对HIV的免疫应答的方法及适用于所述方法的免疫原。本发明还涉及诊断试验试剂盒和使用其的方法。

背景技术

对于HIV疫苗的开发来说，病毒多样性仍然是最棘手的问题之一(Gaschen等，Science 296：2354(2002))。已经表明，当抗HIV-1包膜的抗体在感染前早就以高水平存在并且该抗体对于攻击免疫缺陷性病毒株具有特异性时，该抗体是保护性的(Mascola等，Nat.Med.6：207-210(2000)；Mascola等，J.Virology 73：4009-4018(1999))。尽管慢性HIV感染者中的病毒多样性特别多种多样，但HIV-1传播后的病毒多样性下降(Zhang等，J.Virol.67：33456-3356(1993)；Zhu等，Science 261：1179-1181(1993)；Ritola等，J.Virol.78：11208-11218(2004))。供体中的稀有变体可被选择性地传递至受体(Wolinsky等，Science 255：1134-1137(2000))。

在急性HIV感染中，与gag相比，HIV-1包膜的多样性存在不成比例的更大丢失，表明在传播事件期间env介导的病毒选择(Zhang等，J.Virol.67：33456-3356(1993)；Zhu等，Science 261：1179-1181(1993))。最近的数据表明，在急性HIV感染期间具有缩短的可变环的中和敏感性env被选择性传播(Derdeyn等，Science 303：2019-2022(2004))。还表明在SIV急性感染期间B细胞的耗损阻止了对SIV感染的控制(Miller等，J.Virology，2007年2月28日电子出版)。

本发明至少部分源自疫苗设计标准的确认，如果该标准被执行，则可以产生有效的抗HIV的疫苗。

发明内容

本发明主要涉及HIV。本发明的一个具体方面涉及一种诱导患者针对HIV的免疫应答的方法，及适用于该方法的免疫原。本发明的另一个具体方面涉及诊断试验试剂盒及使用其的方法。

根据下述说明，本发明的目的和优点将清楚明了。

附图说明

图1.100次自展(bootstrap)的患者共有区的ML树。

图2.SGA-衍生的包膜克隆体。

图3.汉明距离(hamming distance)频率的Z20直方图。

图4.同质性患者1012。

图5.同质性患者700010058。

图6.异质性患者Z18。

图7.异质性患者SC33。

图8.异质性患者。

图9.73例异质性患者。

图10.27例患者具有复杂的多峰分布，约15％具有表明异质性感染的汉明距离。

图11.SGA衍生的功能性包膜克隆体。

图12.交互信息标记物：每条垂线代表一个人，得到的序列数由高度表示。每个位置处氨基酸的断裂由颜色表示。11位在慢性情况下更易变，并且耐受P和N。

图13.信号肽的11位。

图14.NNSSG_E_KMEKG。

图15A-15Z.急性传播性标记物。

具体实施方式

本发明涉及包含本文所述的传播性标记物的来自经传播病毒的HIVEnv(尤其注意下面的实施例)及使用其作为疫苗免疫原的方法。本发明还涉及用作诊断试验的诊断靶标的包含所述传播性标记物的来自经传播病毒的HIV Env。此外，本发明涉及整合到共有Env中的HIV Env经传播标记物(即，经传播病毒序列标记物的氨基酸可以整合到另外的M组共有或亚型共有Env的序列中)。此外，本发明涉及HIV的经传播病毒共有Env(具有经传播的病毒标记物)及使用其作为免疫原的方法。另外，本发明涉及HIV的经传播病毒共有Env(具有经传播的病毒标记物)及使用其作为测试用诊断靶标的方法。