[发明专利]基于白三烯C4合酶(LTC4S)晶体结构选择或设计调节剂的方法无效
申请号: | 200880023356.X | 申请日: | 2008-05-07 |
公开(公告)号: | CN101816001A | 公开(公告)日: | 2010-08-25 |
发明(设计)人: | 安德烈亚斯·科尔;萨德·埃沙格伊;丹尼尔·马丁内斯·莫利纳;帕尔·努德隆德;安德斯·韦特霍尔姆;杰西帕·Z·黑格斯特罗姆 | 申请(专利权)人: | 比奥里波克斯公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 王旭 |
地址: | 瑞典*** | 国省代码: | 瑞典;SE |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 白三烯 c4 ltc4s 晶体结构 选择 设计 调节剂 方法 | ||
1.用于选择或设计预期调节白三烯C4合酶(LTC4S)活性的化合物的方法,所述方法包括使用分子建模方式选择或设计预期与LTC4S的催化位点或底物结合区相互作用的化合物的步骤,其中将LTC4S的催化位点或底物结合区的至少一部分的三维结构与化合物的三维结构进行比较,并选择预期与所述催化位点或底物结合区相互作用的化合物。
2.权利要求1的方法,其中LTC4S的活性位点或底物结合区的至少一部分的三维结构是对包含N端六组氨酸标记物的LTC4S多肽所确定的三维结构(或其部分)。
3.权利要求1或权利要求2的方法,其中LTC4S的活性位点或底物结合区的至少一部分的三维结构是对人LTC4S多肽所确定的三维结构(或其部分)。
4.前述权利要求中任一项的方法,其中LTC4S的活性位点或底物结合区的至少一部分的三维结构是可通过晶体的X射线分析获得的三维结构(或其部分),所述晶体可利用包含去污剂的母液溶液获得。
5.权利要求4的方法,其中所述去污剂是十二烷基麦芽糖苷(DDM)。
6.前述权利要求中任一项的方法,其中所述母液溶液包含谷胱甘肽(GSH)。
7.权利要求1-5中任一项的方法,其中LTC4S的活性位点或底物结合区的至少一部分的三维结构是通过表I中所示的结构坐标表示的结构(或其部分),或关于所述结构坐标±来自所述蛋白质主链原子的小于或的均方根偏差建模的结构。
8.权利要求1-4中任一项或6的方法,其中LTC4S的活性位点或底物结合区的至少一部分的三维结构是通过表II中所示的结构坐标表示的结构(或其部分),或关于所述结构坐标±来自所述蛋白质主链原子的小于或的均方根偏差建模的结构。
9.前述权利要求中任一项的方法,其中所选择的化合物预期封闭或结合称为“GSH底物结合腔”(由包括全长人LTC4S的残基Arg51,Arg30,Arg104,Gln53,Asn55,Glu58,Tyr59,Tyr93,Tyr97,Ile27,Pro37,Leu108的残基,或等价残基形成);“亲脂性底物结合裂隙”(由包括Ala20,Leu24,Ile27,Tyr59,Trp116,Ala112,Leu115,Leu108,Tyr109,Leu62,Val119,Thr66,Val16和Leu17的残基,或等价残基形成);或“催化位点”(由包括Arg104或Arg31的残基,或等价残基形成)的结构区域的至少一部分。
10.前述权利要求中任一项的方法,还包括合成、纯化和/或配制所选择的化合物的步骤。
11.前述权利要求中任一项的方法,包括评估所述化合物是否调节LTC4S活性,和选择调节所述活性的化合物的步骤。
12.前述权利要求中任一项的方法,包括评估所述化合物是否调节全细胞、组织或器官中的LTC4的信号传导,和选择调节所述活性的化合物的步骤。
13.权利要求12的方法,还包括评估所述化合物是否调节全细胞、组织或器官中的LTC4S活性,和选择调节所述活性的化合物的步骤。
14.权利要求10-13中任一项的方法,还包括合成、纯化和/或配制所选择的化合物的步骤。
15.制备调节LTC4S的活性的化合物的方法,所述方法包括1)执行按照权利要求1-14中任一项的方法,和2)合成、纯化和/或配制所选择的化合物。
16.突变的LTC4S多肽,其中突变与全长人LTC4S的Arg51,Arg30,Arg104,Gln53,Asn55,Glu58,Tyr59,Tyr93,Tyr97,Ile27,Pro37,Leu108,Ala20,Leu24,Ile27,Tyr59,Trp116,Ala112,Leu115,Leu108,Tyr109,Leu62,Val119,Thr66,Val16和Leu17或Arg31等价的一种或多种残基。
17.编码按照权利要求16的突变LTC4S的多核苷酸。
18.按照权利要求17的多核苷酸,其适合于表达按照权利要求16的突变LTC4S。
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