[发明专利]用于RNA合成的硫代碳保护基团有效

专利信息
申请号: 200880024107.2 申请日: 2008-05-09
公开(公告)号: CN101784556A 公开(公告)日: 2010-07-21
发明(设计)人: 道格拉斯·J·德林杰;安杰斯卡·施尔扎拉;约翰·特纳尔;约尔·麦尔森;佐尔谭·库皮哈;佛纳多·法瑞拉;马文·H·卡鲁特斯;杰拉尔丁·F·德林杰 申请(专利权)人: 安捷伦科技有限公司;科罗拉多大学董事会
主分类号: C07H19/073 分类号: C07H19/073;C07H19/16;C07H21/02;A61K31/7072;A61K31/7076;A61K31/7088
代理公司: 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 代理人: 李剑;南霆
地址: 美国科*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 用于 rna 合成 硫代碳 保护 基团
【权利要求书】:

1.包含2′-羟基硫代氨基甲酸酯保护基团的核苷单体,其具有选自由 如下的式所组成的组的结构

其中,

BP是受保护或未受保护的杂环,所述杂环选自腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞 嘧啶、鸟嘌呤、尿嘧啶、1-甲基腺嘌呤、2-甲基腺嘌呤、N6-甲基腺嘌呤、 N6-异戊基腺嘌呤、2-甲基硫-N6-异戊基腺嘌呤、N,N-二甲基腺嘌呤、8-溴 腺嘌呤、2-硫代胞嘧啶、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、5-乙基胞嘧啶、4- 乙酰基胞嘧啶、1-甲基鸟嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、7-甲基鸟嘌呤、2,2-二甲基 鸟嘌呤、8-溴鸟嘌呤、8-氯鸟嘌呤、8-氨基鸟嘌呤、8-甲基鸟嘌呤、8-硫代 鸟嘌呤、5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、5-乙基尿嘧 啶、5-丙基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、5-羟甲基尿嘧啶、5-(羧基羟甲基)尿 嘧啶、5-(甲氨基甲基)尿嘧啶、5-(羧甲基氨甲基)-尿嘧啶、2-硫代尿嘧啶、 5-甲基-2-硫代尿嘧啶、5-(2-溴代乙烯基)尿嘧啶、尿嘧啶-5-氧乙酸、尿嘧 啶-5-氧乙酸甲基酯、假尿嘧啶、1-甲基假尿嘧啶、辫苷、肌苷、1-甲基肌 苷、次黄嘌呤、黄嘌呤、2-氨基嘌呤、6-羟基氨基嘌呤、6-硫代嘌呤和2,6- 二氨基嘌呤;

R1或R2各自独立地选自氢、保护基团和亚磷酰胺基;以及

R4和R5独立地选自烃基、被取代的烃基、芳基、被取代的芳基,其 中所述烃基表示烷基、烯基或炔基,条件是R4和R5能够与N环状相连。

2.根据权利要求1的核苷单体,其具有选自由如下组成的组的结构

3.根据权利要求1的核苷单体,其具有如下结构

R1或R2各自独立地选自保护基团和亚磷酰胺基。

4.合成核酸的方法,所述方法包括:

(a)提供具有未受保护的羟基的核苷残基和2′-羟基受保护的核苷单 体,其中所述2′-羟基受保护的核苷单体包含2′-羟基硫代氨基甲酸酯保护 基团;和

(b)在允许所述核苷单体与所述核苷残基共价键合的条件下将所述核 苷残基与所述核苷单体接触,并产生所述核酸,

其中所述2′-羟基受保护的核苷单体具有如权利要求1-3的任意一项中 所限定的结构。

5.根据权利要求4的方法,其中所述方法还包括去除所述2′-羟基保护 基团。

6.根据权利要求4-5任意一项所述的方法,其中所述核苷残基与固体 支持物共价键合。

7.根据权利要求6的方法,其中所述方法还包括从所述固体支持物上 切割所述核酸,产生游离的核酸。

8.根据权利要求7的方法,其中所述从所述固体支持物上切割所述核 酸包括使用无水胺将所述核酸从支持物上切割并去保护。

9.根据权利要求8的方法,其中从所述固体支持物上切割所述核酸通 过使用溶于苯酚中的乙二胺处理6到12小时来进行。

10.根据权利要求4所述的方法,其中所述方法还包括将所述核酸与 可药用的载体组合。

11.包含以下结构的核酸,

其中:

BP是受保护或未受保护的含氮碱基,其中所述含氮碱基选自腺嘌呤、 胸腺嘧啶、胞嘧啶、鸟嘌呤、尿嘧啶、1-甲基腺嘌呤、2-甲基腺嘌呤、N6- 甲基腺嘌呤、N6-异戊基腺嘌呤、2-甲基硫-N6-异戊基腺嘌呤、N,N-二甲基 腺嘌呤、8-溴腺嘌呤、2-硫代胞嘧啶、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、5-乙 基胞嘧啶、4-乙酰基胞嘧啶、1-甲基鸟嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、7-甲基鸟嘌 呤、2,2-二甲基鸟嘌呤、8-溴鸟嘌呤、8-氯鸟嘌呤、8-氨基鸟嘌呤、8-甲基 鸟嘌呤、8-硫代鸟嘌呤、5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧 啶、5-乙基尿嘧啶、5-丙基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、5-羟甲基尿嘧啶、5- (羧基羟甲基)尿嘧啶、5-(甲氨基甲基)尿嘧啶、5-(羧甲基氨甲基)-尿嘧啶、 2-硫代尿嘧啶、5-甲基-2-硫代尿嘧啶、5-(2-溴代乙烯基)尿嘧啶、尿嘧啶-5- 氧乙酸、尿嘧啶-5-氧乙酸甲基酯、假尿嘧啶、1-甲基假尿嘧啶、辫苷、肌 苷、1-甲基肌苷、次黄嘌呤、黄嘌呤、2-氨基嘌呤、6-羟基氨基嘌呤、6-硫 代嘌呤和2,6-二氨基嘌呤;

Q是如权利要求1-3的任意一项中所限定的硫代氨基甲酸酯保护基团;

R12选自由氢、烃基、被取代的烃基、芳基和被取代的芳基组成的 组,其中所述烃基表示烷基、烯基或炔基;以及

m是大于1的整数。

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