[发明专利]用于预测患有肝脏病毒性感染的受试者针对抗病毒疗法的应答的方法无效

专利信息
申请号: 200880106317.6 申请日: 2008-09-08
公开(公告)号: CN101821629A 公开(公告)日: 2010-09-01
发明(设计)人: F·H·T·董;W·菲利波维奇;M·海姆;M·萨拉森-菲利波维奇 申请(专利权)人: 诺瓦提斯研究基金会弗里德里克·米谢尔生物医学研究所;巴塞尔大学医院
主分类号: G01N33/576 分类号: G01N33/576;C12Q1/68;A61P31/12
代理公司: 北京市中咨律师事务所 11247 代理人: 黄革生;林柏楠
地址: 瑞士*** 国省代码: 瑞士;CH
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摘要:
搜索关键词: 用于 预测 患有 肝脏 病毒性 感染 受试者 针对 抗病毒 疗法 应答 方法
【权利要求书】:

1.用于确定具有肝脏病毒性感染的受试者将应答于抗病毒疗法的可能性的方法,所述抗病毒疗法包括刺激干扰素(IFN)活性,该方法包括:

(a)对来自受试者的样品分析来自以下每个基因集合的至少一种基因的表达:

(i)KYNU;PAH;LOC129607;DDC;FOLH1;YBX1;BCHE;ACADL;ACSM3;NARF;SLPI;RPS5;RPL3;RPLP0;TRIM5和HERC5;

(ii)HTATIP2;CDK4;IFI44L;和KLHDC3;

(iii)C7;IF;IFI27;IFIT1;OAS2;G1P2;OAS1;IRF7;RSAD2;IFI44;OAS3;SIGIRR;和IFIT2;

(iv)RAB4A;PPP1R1A;PPM1E;ENPP2;CAP2;ADCY1;CABYR;EVI1;PTGFRN;TRIM55和IL28RA;

(v)MME;KCNN2;SLC16A10;AMOTL1;SPP2;LRCH4;HIST1H2BG;TSPYL5;HIST1H2AC;HIST1H2BD;PHTF1;ZNF684;GSTM5;FLJ20035;FIS;PARP12;C14orf21;PNPT1;FLJ39051;GALNTL1;OSBPL1A;LGALS3BP;TXNRD2;LOC201725;TOMM7;SRPX2;DCN;PSMAL;MICAL-L2;FLJ30046;SAMD9;ANKRD35;LOC284013;LOC402560;和LOC147646;和,

(b)比较该样品中所述基因的表达与对照样品中相同基因的表达。

2.权利要求1的方法,其中样品中所述基因与对照样品中相同基因的表达相比较而言改变的表达表明该受试者很可能不应答于所述抗病毒疗法。

3.权利要求1的方法,其中样品中所述基因与对照样品中相同基因的表达相比较而言未改变的表达表明该受试者很可能应答于所述抗病毒疗法。

4.前述权利要求任一项中所述的方法,其中抗病毒疗法包括PEG化的IFNα。

5.权利要求4的方法,其中抗病毒疗法包括PEG-IFNα和利巴韦林。

6.前述权利要求任一项中所述的方法,其中病毒性感染是乙型肝炎病毒感染或丙型肝炎病毒感染。

7.权利要求4的方法,其中病毒是丙型肝炎病毒。

8.前述权利要求任一项中所述的方法,其中样品包含肝脏组织。

9.前述权利要求任一项中所述的方法,其中分析了权利要求1的5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、71、72、73、74、75、76、77或78种基因的表达。

10.前述权利要求任一项中所述的方法,其中通过测量样品中mRNA基因转录物的量或从所述mRNA衍生的cDNA的量确定基因表达。

11.权利要求1至9中任一项所述的方法,其中通过测量样品中由基因编码的肽或多肽的量确定基因表达。

12.权利要求11的方法,其中使用特异性结合分子确定肽或多肽的量。

13.前述权利要求任一项中所述的方法,其中受试者是人。

14.用于确定具有肝脏病毒性感染的受试者将应答于抗病毒疗法的可能性的方法,所述抗病毒疗法包括刺激干扰素(IFN)活性,该方法包括:检查来自该受试者的样品以鉴定STAT1的亚细胞定位。

15.权利要求14的方法,其中如果大部分细胞具有核定位的STAT1,则该受试者很可能不应答于抗病毒疗法。

16.降低IFN系统激活的物质用于预防或治疗肝脏病毒性感染的用途。

17.降低IFN系统激活的物质在制造用于预防或治疗肝脏病毒性感染的药物中的用途。

18.用于实施权利要求1至13中任一项所述的方法的试剂盒,包含:

(i)用于分析受试者样品中来自权利要求1中所列出每个基因集合的至少一种基因的表达的工具;和,任选地,

(ii)用于比较该样品中所述基因的表达与对照样品中相同基因的表达的工具。

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