[发明专利]对在人类血清中指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的鉴定

权利要求书

1.鉴定在人类血清中存在的指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的方法，当与来自未患有所述病理学状态的人类的血清中相同的所述蛋白质的表达水平相比时，所述蛋白质具有改变的表达水平，所述方法包括以下步骤：

第一获得步骤，从不患有所述人类肺组织的所述病理学状态的人类群体获得大量人类血清；

第二获得步骤，从患有哮喘的人类群体获得大量人类血清；

第三获得步骤，从患有非小细胞肺癌的人类群体获得大量人类血清；

暴露步骤，将在所述第一获得步骤、所述第二获得步骤和所述第三获得步骤中获得的所述人类血清暴露于消化剂，所述消化剂将在所述人类血清中的所述蛋白质裂解成可预测和定义的肽；

分离步骤，从所述人类血清分离所述肽；

使用液相色谱质谱仪，将来自在所述第一获得步骤、所述第二获得步骤和所述第三获得步骤中获得的各个所述大量人类血清的所述肽进行分析，所述质谱仪其中具有疏水性固定相的柱，以及流过所述柱的溶剂系统，所述溶剂系统分离所述肽，以及检测机构以产生质谱读数，所述质谱读数包括所述肽的质量和测量随着所述肽通过所述柱的时间阶段的所述肽的所述强度的图解说明；

第一比较步骤，将来自在所述第一获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数与来自在所述第二获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数进行比较；

第二比较步骤，将来自在所述第一获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数与来自在所述第三获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数进行比较；

第三比较步骤，将来自在所述第二获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数与来自在所述第三获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数进行比较；

选择步骤，选择在所述第一比较步骤、所述第二比较步骤和所述第三比较步骤中比较的所述质谱读数，其中所述质谱读数指示在以下之间相同的所述肽的基本上变化的所述强度：(a).患有所述哮喘的所述人类群体与不患有所述肺组织病的所述病理学状态的所述人类群体；(b).患有所述非小细胞肺癌的所述人类群体与不患有所述肺组织病的所述病理学状态的所述人类群体；和(c).患有所述哮喘的所述人类群体与患有所述非小细胞肺癌的所述人类的所述群体；

鉴定步骤，通过从在所述选择步骤期间选择的所述质谱读数获得所述肽的特征，鉴定指示所述人类肺组织的所述病理学状态的所述蛋白质；和

其中所述人类肺组织的所述病理学状态包括所述哮喘和所述非小细胞肺癌。

2.根据权利要求1所述的鉴定在人类血清中存在的指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的方法，其中所述消化剂为胰蛋白酶或其它内切蛋白酶。

3.根据权利要求2所述的鉴定在人类血清中存在的指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的方法，其中所述鉴定步骤进一步包括以下步骤：

分析步骤，通过预定义的计算机程序分析在所述选择步骤期间选择的所述质谱读数，所述预定义的计算机程序将所述肽的所述质谱读数与预鉴定的蛋白质的质谱读数的至少一个文库比较，并且将在所述质谱读数中的所述肽的所述质量和所述强度与所述预鉴定的蛋白质的质量和强度匹配；和

获得步骤，从所述预定义的计算机程序获得作为结果的鉴定的蛋白质。

4.根据权利要求2所述的鉴定在人类血清中存在的指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的方法，其中所述鉴定步骤进一步包括以下步骤：

运行步骤，通过预定义的计算机程序运行在所述分析步骤期间选择的所述质谱读数，所述预定义的计算机程序将所述肽的所述质谱读数与预鉴定的蛋白质的质谱读数的至少一个文库比较，并且将在所述质谱读数中的所述肽的所述质量和所述强度与所述预鉴定的蛋白质的候选物列表的质量和强度匹配，所述候选物列表包括具有与所述肽的所述质量和所述强度基本上类似的所述质量和所述强度的大量所述预鉴定的蛋白质；和

确定步骤，从所述候选物列表确定作为结果的鉴定的蛋白质。

5.根据权利要求4所述的鉴定在人类血清中存在的指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的方法，其中所述确定步骤包括消除在所述候选物列表中不是所述得到的鉴定的蛋白质的蛋白质的步骤，包括以下步骤：

消除步骤，消除在所述候选物列表上的与所述肽的所述强度和质量不是最基本上相似的所述蛋白质的所述强度和所述质量；和

选择步骤，从所述候选物列表选择与所述肽的所述强度和质量最基本上相似的所述强度和所述质量。