[发明专利]用于减少RNAi中的脱靶表型效应的siRNA的不依赖于序列的修饰形式和其稳定形式无效

专利信息
申请号: 200880113683.4 申请日: 2008-09-17
公开(公告)号: CN101849008A 公开(公告)日: 2010-09-29
发明(设计)人: N·普瑞;I·查尔斯;S·马格达雷诺;A·乌拉索夫;C·博内特 申请(专利权)人: 应用生物系统有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 罗菊华
地址: 美国加*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 用于 减少 rnai 中的 脱靶 表型 效应 sirna 依赖于 序列 修饰 形式 稳定
【权利要求书】:

1.一种化学合成的过客(有义)寡核苷酸,其具有15至30个核苷酸的长度并且包含:不依赖于序列的修饰形式(1)、不依赖于序列的修饰形式(2)和不依赖于序列的修饰形式(3)中的一个:

(1)5′Np-m-m-Nx-m-m-Nq-nr3′,其中p为0或1;x为7、8、9、10或11;r为0、1或2;以及q是表示过客链的长度减去(p+x+r+4)的整数;

(2)5′Np-m-m-Ny-m-Nz-m-Nq-nr3′,其中p为0或1;y为7、8或9并且z为1;或y为7并且z为2或3;r为0、1或2;以及q是表示过客链的长度减去(p+y+z+r+4)的整数;

(3)5′m-N1-m-Nx-m-m-Nq-nr3′,其中x为8、9或10;r为0、1或2;以及q为表示过客链的长度减去(x+r+5)的整数;

其中,

各m独立地是二环核苷酸或三环核苷酸;

各n独立地是脱氧核苷酸、修饰的核苷酸或核糖核苷酸;

当m是二环核苷酸时,各N独立地是除了二环核苷酸外的核苷酸,和

当m是三环核苷酸时,各N独立地是除了三环核苷酸外的核苷酸。

2.包含权利要求1的过客(有义)寡核苷酸和引导(反义)寡核苷酸的化学合成的短干扰RNA,所述引导(反义)寡核苷酸具有15至30个核苷酸,与至少12个核苷酸的过客(有义)寡核苷酸连续互补的区域;引导链还与靶mRNA的至少一部分具有互补性。

3.权利要求2的化学合成的短干扰RNA,其中所述过客(有义)寡核苷酸包含不依赖于序列的修饰形式(1),p为0,x为10且r为2。

4.权利要求2的化学合成的短干扰RNA,其中所述过客(有义)寡核苷酸包含不依赖于序列的修饰形式(1),p为0,x为9或11且r为2。

5.权利要求2的化学合成的短干扰RNA,其中所述过客(有义)寡核苷酸包含不依赖于序列的修饰形式(2),p为0,y为9且r为2。

6.权利要求2的化学合成的短干扰RNA,其中至少一个m具有结构(a)、(b)或(c):

其中

R1和R2独立地是O、S、CH2或NR,其中R是氢或C1-3-烷基;

R3是CH2、CH2-O、CH2-S、CH2-CH2、CH2-CH2-CH2、CH-CH或CH2-NR,其中R是氢或C1-3-烷基;

R4和R5独立地是核苷间的连接、末端基团或保护基团;

R4和R5中至少一个是核苷间的连接;和

B是核碱基、核碱基衍生物或核碱基类似物。

7.权利要求6的化学合成的短干扰RNA,其中所述过客(有义)寡核苷酸包含不依赖于序列的修饰形式(1),p为0,x为10,r为2,并且各m具有结构(a),其中R1是O,R2是O且R3是CH2

8.权利要求6的化学合成的短干扰RNA,其中所述过客(有义)寡核苷酸包含不依赖于序列的修饰形式(1),p为1,x为9或10,r为2,并且各m具有结构(a),其中R1是O,R2是O且R3是CH2

9.权利要求6的化学合成的短干扰RNA,其中所述过客(有义)寡核苷酸包含不依赖于序列的修饰形式(3),x为9或10,r为2,并且各m具有结构(a),其中R1是O,R2是O且R3是CH2

10.权利要求2的化学合成的短干扰RNA,其中所述过客(有义)寡核苷酸和所述引导(反义)寡核苷酸通过核苷酸环或连接体环共价连接,从而形成短发夹寡核苷酸。

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