[发明专利]使用BRCA1相关蛋白(BRAP)基因内单核苷酸多态性判定炎症性疾病的方法

说明书

技术领域

本发明涉及炎症性疾病的诊断方法，该方法包含检测存在于BRCA1相关蛋白(BRAP)基因中的基因多态性；还涉及该方法中使用的寡核苷酸、含有该寡核苷酸的炎症性疾病诊断用试剂盒、以及它们的应用。

背景技术

即使生活方式变化以及新的药理学研究进展，包括心肌梗塞在内的冠状动脉疾病在很多国家仍成为主要的死亡原因。因此，人们强烈希望能够鉴定其发病中的遗传性以及环境性因子。

已知共同(共通)的遗传变异与罹患糖尿病或高血压等生活方式病的危险性显著相关。鉴定多基因性疾病的易感基因可以有利用“连锁”的方法以及利用“相关”的方法。连锁分析是检测疾病易感基因的基因座与基因标记(主要是微卫星)的基因座是否连锁、即，研究基因座之间的关系；而相关性分析是检测特定的基因标记(主要是单核苷酸多态性：SNP)的哪一个态(等位基因)与疾病相关、即，研究等位基因之间的关系。因此可以说，使用共同的变异作为标记的相关性分析比疾病相关基因的局部存在的连锁分析强很多。单核苷酸多态性(SNPs)是研究与疾病的易罹患性或药物反应性相关的基因时有用的多态性标记。SNPs对基因产物的质或量有直接影响，使某种疾病或药物的严重副作用产生的危险性增加。因此，期待通过研究多个SNPs，有助于疾病相关基因的鉴定或建立避免药物副作用的诊断方法。

关于基因变异与心肌梗塞的关系有以下方法：分析淋巴毒素-α(LT-α)基因、I Kappa B-like(IKBL)基因、或BAT1基因的多态性，判定心肌梗塞的遗传性因素的方法(WO2004/015100号公报)；分析半乳凝素-2的多态性，判定心肌梗塞的遗传性因素的方法(国际公开WO2005/017200号公报)等。还有人报道了醛脱氢酶2基因内的SNP与心肌梗塞的相关性(S.Takagi等人.，Hypertens Res.Vol.25，No.5(2002)，677～681页)。但是这些报告中，样品数、P值均不充分，数据的可靠性低。即，该文献中，只是用少量的样品数分析了ALDH2的SNP，因此可以认为是基因分型错误，结果的可靠性低，其显著性也低。如上所述，与心肌梗塞有关的基因变异的研究尚不足够。

非专利文献1：S.Takagi等人.，Hypertens Res.Vol.25，No.5(2002)，677～681页

专利文献1：国际公开WO2004/015100号公报

专利文献2：国际公开WO2005/017200号公报

发明内容

发明所要解决的课题

本发明要解决的课题是鉴定与心肌梗塞等炎症性疾病的发病进展相关的新型单核苷酸多态性(SNP)。本发明进一步要解决的课题是利用鉴定的SNP，提供心肌梗塞等炎症性疾病的诊断方法、或炎症性疾病的治疗药物的开发方法。

解决课题的方法

本发明人等为解决上述课题进行了深入研究，结果通过鉴定BRCA1相关蛋白(BRAP)基因内的单核苷酸多态性(SNP)与心肌梗塞的发病进展相关，完成了本发明。

即，本发明提供以下的发明。

(1)炎症性疾病的判定方法，该方法包含检测存在于BRCA1相关蛋白(BRAP)基因中的至少一种基因多态性。

(2)炎症性疾病的判定方法，该方法包含检测存在于BRCA1相关蛋白(BRAP)基因中的至少一种单核苷酸多态性。

(3)炎症性疾病的判定方法，该方法包含检测以下任意一种多态性：

(i)SEQ ID NO：1所示的BRCA1相关蛋白(BRAP)基因的外显子5的核苷酸序列中第90号核苷酸的A/G多态性(NCBI SNP Database中的登记号为rs3782886)；

(ii)SEQ ID NO：2所示的BRCA1相关蛋白(BRAP)基因的内含子3的核苷酸序列中第270号核苷酸的A/G多态性(NCBI SNP Database中的登记号为rs11066001)；或

(iii)与上述(i)或(ii)所述的多态性的连锁不平衡的指标r2为0.8以上(优选为0.9以上)的连锁不平衡状态的多态性。

(4)(1)～(3)中任一项所述的方法，其中，炎症性疾病是心肌梗塞。