[发明专利]炎性肠病的基因表达标志物无效
申请号: | 200880125846.0 | 申请日: | 2008-11-26 |
公开(公告)号: | CN101970689A | 公开(公告)日: | 2011-02-09 |
发明(设计)人: | 亚历山大·R·阿巴斯;希拉里·克拉克;劳里·迪尔;查尔斯·李斯;科林·L·诺布尔;杰克·萨特桑吉 | 申请(专利权)人: | 健泰科生物技术公司;爱丁堡大学老学院理事会 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 11105 | 代理人: | 张红春 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 炎性肠病 基因 表达 标志 | ||
1.一种诊断哺乳动物受试者中炎性肠病(IBD)的存在的方法,包括确定自所述受试者获得的测试样品中编码SEQ ID NO:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、194、197、199、201、203、205、207、和230任一所示多肽的核酸的表达水平相对于对照中的表达水平较高,其中所述较高水平的表达指示获得测试样品的受试者中IBD的存在。
2.一种诊断哺乳动物受试者中炎性肠病(IBD)的存在的方法,包括确定自所述受试者获得的测试样品中编码SEQ ID NO:108、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、211、213、215、217、219、221、223、225、和228任一所示多肽的核酸的表达水平相对于对照中的表达水平较低,其中所述较低水平的表达指示获得测试样品的受试者中IBD的存在。
3.权利要求1或2的方法,其中所述哺乳动物受试者是人受试者。
4.权利要求3的方法,其中所述表达水平的证据是通过基因表达序型分析的方法获得的。
5.权利要求3的方法,其中所述方法是基于PCR的方法。
6.权利要求4的方法,其中所述表达水平是相对于一种或多种参照基因或其表达产物的表达水平标准化的。
7.权利要求1或2的方法,包括确定至少两种所述基因或其表达产物的表达水平的证据。
8.权利要求1或2的方法,包括确定至少三种所述基因或其表达产物的表达水平的证据。
9.权利要求1或2的方法,包括确定至少四种所述基因或其表达产物的表达水平的证据。
10.权利要求1或2的方法,包括确定至少五种所述基因或其表达产物的表达水平的证据。
11.权利要求1或2的方法,进一步包括创建汇总所述IBD检测的报告的步骤。
12.权利要求1或2的方法,其中所述IBD是溃疡性结肠炎。
13.权利要求1或2的方法,其中所述IBD是克罗恩氏病。
14.权利要求1或2的方法,其中所述IBD是溃疡性结肠炎和克罗恩氏病。
15.权利要求1或2的方法,其中所述测试样品来自结肠组织活检。
16.权利要求15的方法,其中所述活检来自选自下组的组织:回肠末端、升结肠、降结肠、和乙状结肠。
17.权利要求15的方法,其中所述活检来自发炎的结肠区域。
18.权利要求15的方法,其中所述活检来自不发炎的结肠区域。
19.权利要求1或2的方法,其中所述确定步骤指示所述哺乳动物受试者中IBD的复发,且其中所述哺乳动物受试者先前诊断有IBD并为所述先前诊断的IBD接受过治疗。
20.权利要求19的方法,其中所述治疗包括手术。
21.权利要求1或2的方法,其中所述确定步骤指示所述哺乳动物受试者中所述IBD的突发。
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