[发明专利]用于推测性鉴定培养物内微生物类型的系统和方法有效
申请号: | 200880128140.X | 申请日: | 2008-02-19 |
公开(公告)号: | CN101978068A | 公开(公告)日: | 2011-02-16 |
发明(设计)人: | P·S·贝蒂 | 申请(专利权)人: | 贝克顿·迪金森公司 |
主分类号: | C12Q1/04 | 分类号: | C12Q1/04 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 张阳 |
地址: | 美国加*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 推测 鉴定 培养 微生物 类型 系统 方法 | ||
1.一种鉴定培养皿内培养物中的微生物类型的方法,所述方法包括:
(A)为所述培养皿内培养物的生物学状态的多个测量值中的每个测量值,计算(i)该测量值与(ii)在初始时间点测得的培养物的初始生物学状态之间的规格化相对值,由此形成多个规格化相对值,其中所述多个测量值中的每个测量值在第一时间点和第二时间点之间的不同时间点测得;
(B)为第一时间点和第二时间点之间各时间点的每一个预定的固定间隔,确定针对在各时间点的该预定的固定间隔内生物学状态各测量值的规格化相对值的一阶导数,由此形成多个速率转化值,其中多个速率转化值包括多组速率转化值,其中多组速率转化值中的每组速率转化值针对第一时间点和第二时间点之间的连续时间点的不同组;
(C)为多组速率转化值中的每组速率转化值,计算平均相对转化值作为该组速率转化值中每个速率转化值的集中趋势测度,由此计算多个平均相对转化值;
(D)从多个规格化相对值和多个平均相对转化值确定最大代谢速率和生长范围;
(E)从最大代谢速率和生长范围确定所述培养皿内培养物中的微生物类型。
2.如权利要求1所述的方法,所述方法还包括:
(F)将所述培养皿内培养物中的微生物类型的鉴定输出至用户接口装置、监视器、计算机可读存储介质、计算机可读存储器、或者本地或远程计算机系统;或者显示所述培养物中的微生物类型的鉴定。
3.如权利要求1所述的方法,其中第一时间点位于所述初始时间点的5分钟或更多分钟之后,并且第二时间点位于所述初始时间点的30个或更多个小时之后。
4.如权利要求1所述的方法,其中第一时间点位于初始时间点的0.5小时到3小时之后,第二时间点位于初始时间点的4.5小时到20小时之后。
5.如权利要求1所述的方法,其中在所述多组速率转化值的第一组速率转化值中的各速率转化值的集中趋势测度包括:
在所述第一组速率转化值中的每一个速率转化值的几何均值,
在所述第一组速率转化值中的每一个速率转化值的算数均值,
在所述第一组速率转化值中的每一个速率转化值的中位数,或者
在所述第一组速率转化值中的每一个速率转化值的众数。
6.如权利要求1所述的方法,其中所述培养物生物学状态的多个测量值中的各测量值分别在第一时间点和第二时间点之间的周期性时间间隔处从所述培养物测得。
7.如权利要求6所述的方法,其中所述周期性时间间隔是在1分钟到20分钟之间的时间量。
8.如权利要求6所述的方法,其中所述周期性时间间隔是在5分钟到15分钟之间的时间量。
9.如权利要求1所述的方法,其中所述培养物的初始生物学状态通过与所述培养物接触的传感器的荧光输出来确定。
10.如权利要求9所述的方法,其中所述传感器的荧光输出的量受CO2浓度、O2浓度、或pH的影响。
11.如权利要求1所述的方法,其中所述培养皿内的培养物生物学状态的多个测量值包括培养物生物学状态的10到50,000个测量值。
12.如权利要求1所述的方法,其中所述培养皿内的培养物生物学状态的多个测量值包括培养物生物学状态的100到10,000个测量值。
13.如权利要求1所述的方法,其中所述培养皿内的培养物生物学状态的多个测量值包括培养物生物学状态的150到5,000个测量值。
14.如权利要求1所述的方法,其中步骤(B)中各时间点的每个预定的固定间隔由针对第一时间点和第二时间点之间的时间窗内的各时间点的每个速率转化值组成,并且其中所述时间窗是在20分钟到10小时之间的时间段。
15.如权利要求1所述的方法,其中步骤(B)中各时间点的每个预定的固定间隔由针对第一时间点和第二时间点之间且在其间测量所述培养皿内培养物的生物学状态的时间窗内的所有时间点的速率转化值组成,并且其中所述时间窗的持续时间是20分钟到2小时之间的时间段。
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