[发明专利]一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法有效
申请号: | 200910020751.9 | 申请日: | 2009-04-24 |
公开(公告)号: | CN101613742A | 公开(公告)日: | 2009-12-30 |
发明(设计)人: | 崔朝霞;王鸿霞;吴丹华;刘媛;李倩倩 | 申请(专利权)人: | 中国科学院海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 | 代理人: | 许宗富;周秀梅 |
地址: | 26607*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 中华 绒螯蟹 多元 通量 遗传 标记 系统 分析 方法 | ||
1.一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统,其特征在于:所述多元 高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统,其中 微卫星分子标记系统为由7个EST-SSR标记的系统1和6个EST-SSR标记 的系统2组成;
系统1由7个EST-SSR标记组成,扩增7个EST-SSR标记的7对引物 分别是
NE5:F 5′-CGTGAATGCTGTAGTGTAAT-3′;
R 5′-CACCAGAAATAATGAGGTTT-3′;
NE12:F 5′-ATGACATTGATGCCTGACG-3′;
R 5′-TGCCTTTATTGACCGAGAC-3′;
NE16:F 5′-TTTCACATCCTCCACAGACA-3′;
R 5′-GCCACAAGTACACCCAATCA-3′;
NE27:F 5′-ACGGGAAATGGAACAGAT-3′;
R 5′-TCCTTCCATCCTGAGTCC-3′;
NE46:F 5′-ACTGCTGTTGTTGGTGGTC-3′;
R 5′-CCTTAATCCGTTGCGTCA-3′;
NE48:F 5′-AAAGGTCAGTTAATTTCTTGAT-3′;
R 5′-TCTAGTGAAATGACATATTGGT-3′;
NE49:F 5′-AGACCGCTGTTATGCTCCT-3′;
R 5′-ATGGGAATGAAGGTTATGTATG-3′;
系统2由6个EST-SSR标记组成,扩增6个EST-SSR标记的6对引物 分别是
NE1:F 5′-CATTCCAAGTCTTGACCCC-3′;
R:5′-CAGAGCCACAACACTAACG-3′;
NE18:F 5′-TATTCAACATTTCAACAACGAT-3′;
R:5′-GACGAGCGAAGAACTGGA-3′;
NE23:F 5′-AGAGGCAAATGCGATAAAGA-3′;
R:5′-CACGACAGACTTACCAGCAC-3′;
NE25:F 5′-AGGAGGTGCGTAAGAGTGA-3′;
R:5′-TTTCCTTCCATCCTGAGTC-3′;
NE26:F 5′-ACGGGAAATGGAACAGAT-3′;
R:5′-TCCTTCCATCCTGAGTCC-3′;
NE36:F 5′-ATGTGGACTGCGGGAGA-3′;
R:5′-GTGGTGGTAGGTTCGTCTGT-3′;
线粒体序列信息系统由扩增COI,Cytb和CR序列的三对引物组成,这 三对引物分别是,
LCO1490:5′-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3′和HCO2193: 5′-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3′、
F1:5′-CATGCCTGAATAGTAGGAGT-3′和R1:5′-GTGCTCCAATTCAGGTCAAT-3′、
F2:5′-GACCGTTGAGACTACTACTATAATA-3′和R2: 5′-TCCGTTGCATGTAAGTATATAGTAG-3′。
2.一种采用权利要求1所述中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统进行 的遗传分析方法,其特征在于:首先,运用权利要求1所述线粒体序列信 息系统作为分子标记,将混养家系中同一母本和不同母本所产的后代根据 遗传结构和遗传多样性分开,然后再运用权利要求1所述微卫星分子标记 系统,将已区分母本的后代根据遗传距离和遗传多样性进行父本的区分, 从而完成中华绒螯蟹遗传育种过程中的系谱认证并确认近交系数。
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