[发明专利]一种基于RT-LAMP技术的H3亚型流感快速检测分型方法在审

专利信息
申请号: 200910029320.9 申请日: 2009-04-09
公开(公告)号: CN101608242A 公开(公告)日: 2009-12-23
发明(设计)人: 刘奋勇;顾宏伟 申请(专利权)人: 泰州亲和力生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 225300江苏省泰州市*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 rt lamp 技术 h3 流感 快速 检测 方法
【权利要求书】:

1、一种基于RT-LAMP技术的H3亚型流感快速检测分型方法,它包括以下 步骤:

步骤一,检索流感病毒基因组序列数据库,对流感病毒基因组序列数据库 中H3亚型流感病毒的HA基因序列进行序列分析,设计出6条高特异的、高度 保守的RT-LAMP专用引物针对靶基因的8个区域,其中4条引物针对靶基因的 6个区域,这4条引物为FIP、BIP,F3和B3,其余2条为loop引物LP1,LP2, loop引物LP1,LP2针对靶基因的2个区域;

步骤二,收取待检样本进行预处理,然后从预处理后的待检样本中提取总 RNA作为反应模板,总RNA在低温条件下进行保存待用;

步骤三,配置RT-LAMP反应体系,首先在反应管中依次加入反应buffer, dNTPs,然后再加入LAMP专用引物FIP、BIP、F3、B3、LP1和LP2,逆转录酶和 DNA扩增酶;

步骤四,将步骤二中总RNA反应模板混入步骤三所配制的RT-LAMP反应体 系置于水浴中,恒温条件下进行RT-LAMP扩增;

步骤五,将步骤四中扩增后的反应产物进行判定,呈阳性则表示样本中含 有H3亚型流感病毒,呈阴性则表示不含有H3亚型流感病毒。

2、根据权利要求1中所述的基于RT-LAMP技术的H 3亚型流感快速检测分 型方法,其特征是步骤二中采用Trizol法或总RNA提取试剂盒来提取待检样本 的总RNA。

3、根据权利要求1中所述的基于RT-LAMP技术的H3亚型流感快速检测分 型方法,其特征是步骤一中各引物的序列表为:

  序号   引物名   序列(5’→3’)   1   FIP   GCTTCCATTTGGAGTGATGCATTCCGAAGTGGGAAAAGCTCAAT   2   BIP   GTAAACAGGATCACATATGGGGCGCATCCCTGTTGCCARTT   3   F3   AATTGCTCCTCGGGGTTA   4   B3   CCGAATATGCCTCTAGTTTG

  5   LP1   GCCAATGGGTGCATCTGAC   6   LP2   GTCCCAGATATGTTAAGCAAAACAC

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