[发明专利]CYP2C19、ABCB1基因SNP检测液相芯片及其检测方法有效
申请号: | 200910038648.7 | 申请日: | 2009-04-15 |
公开(公告)号: | CN101565749A | 公开(公告)日: | 2009-10-28 |
发明(设计)人: | 许嘉森;何嘉英;任立芬 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663广东省广州市广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cyp2c19 abcb1 基因 snp 检测 芯片 及其 方法 | ||
1.一种CYP2C19和ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
(1).分别包被有特异的anti-tag序列的6种微球,每种微球具有不同颜色编码,anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.7~SEQ IDNO.12中的序列;
(2).针对每种型别的SNP位点分别设计的3对ASPE引物,每种ASPE引物由3’端的针对目的基因SNP位点的特异性序列和5’端的tag序列组成,所述tag序列能相应地与(1)中所选的微球上anti-tag序列互补配对;所述针对目的基因SNP位点的特异性序列分别为:SEQID NO.1及SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3及SEQ ID NO.4、和SEQ ID NO.5及SEQ ID NO.6;
(3).扩增出分别具有CYP2C19和ABCB1基因SNP位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的CYP2C19和ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,
所述扩增引物为:针对CYP2C19 Exon5的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14;针对CYP2C19Exon4的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16;针对ABCB1 Exon26的SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18。
3.根据权利要求1或2所述的CYP2C19和ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,
所述3对由tag序列和特异性序列组成的特异ASPE引物为:由SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.1组成的ASPE引物,及由SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.2组成的ASPE引物;由SEQ ID NO.21和SEQIDNO.3组成的ASPE引物,及由SEQ ID NO.22和SEQ ID NO.4组成的ASPE引物;由SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.5组成的ASPE引物,及由SEQ ID NO.24和SEQ ID NO.6组成的ASPE引物。
4.一种ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
(1).分别包被有特异的anti-tag序列的2种微球,每种微球具有不同颜色编码,anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.11~SEQ ID NO.12 中的序列;
(2).针对SNP位点设计的1对ASPE引物:每种ASPE引物由3’端的针对目的基因SNP位点的特异性序列和5’端的tag序列组成,所述tag序列能相应地与(1)中所选的微球上anti-tag序列互补配对;所述针对目的基因SNP位点的特异性序列为:SEQ ID NO.5及SEQ ID NO.6;
(3).扩增出具有ABCB1基因SNP位点的目标序列的引物。
5.根据权利要求4所述的ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,
所述扩增引物为SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18。
6.根据权利要求4或5所述的ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,所述特异ASPE引物为:由SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.5组成的ASPE引物,及由SEQ ID NO.24和SEQ ID NO.6组成的ASPE引物。
7.一种CYP2C19基因SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
(1).分别包被有特异的anti-tag序列的4种微球,每种微球具有不同颜色编码,anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.7~SEQ IDNO.10中的序列;
(2).针对每种型别的SNP位点分别设计的2对ASPE引物,每种ASPE引物由3’端的针对目的基因SNP位点的特异性序列和5’端的tag序列组成,所述tag序列能相应地与(1)中所选的微球上anti-tag序列互补配对;所述针对目的基因SNP位点的特异性序列分别为:SEQID NO.1及SEQ ID NO.2、和SEQ ID NO.3及SEQ ID NO.4;
(3).扩增出具有CYP2C19基因SNP位点的目标序列的引物。
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