[发明专利]CYP2C19、ABCB1基因SNP检测液相芯片及其检测方法有效

专利信息
申请号: 200910038648.7 申请日: 2009-04-15
公开(公告)号: CN101565749A 公开(公告)日: 2009-10-28
发明(设计)人: 许嘉森;何嘉英;任立芬 申请(专利权)人: 广州益善生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N21/64
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 代理人: 万志香;曾旻辉
地址: 510663广东省广州市广州*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: cyp2c19 abcb1 基因 snp 检测 芯片 及其 方法
【权利要求书】:

1.一种CYP2C19和ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:

(1).分别包被有特异的anti-tag序列的6种微球,每种微球具有不同颜色编码,anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.7~SEQ IDNO.12中的序列;

(2).针对每种型别的SNP位点分别设计的3对ASPE引物,每种ASPE引物由3’端的针对目的基因SNP位点的特异性序列和5’端的tag序列组成,所述tag序列能相应地与(1)中所选的微球上anti-tag序列互补配对;所述针对目的基因SNP位点的特异性序列分别为:SEQID NO.1及SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3及SEQ ID NO.4、和SEQ ID NO.5及SEQ ID NO.6;

(3).扩增出分别具有CYP2C19和ABCB1基因SNP位点的目标序列的引物。

2.根据权利要求1所述的CYP2C19和ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,

所述扩增引物为:针对CYP2C19 Exon5的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14;针对CYP2C19Exon4的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16;针对ABCB1 Exon26的SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18。

3.根据权利要求1或2所述的CYP2C19和ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,

所述3对由tag序列和特异性序列组成的特异ASPE引物为:由SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.1组成的ASPE引物,及由SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.2组成的ASPE引物;由SEQ ID NO.21和SEQIDNO.3组成的ASPE引物,及由SEQ ID NO.22和SEQ ID NO.4组成的ASPE引物;由SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.5组成的ASPE引物,及由SEQ ID NO.24和SEQ ID NO.6组成的ASPE引物。

4.一种ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:

(1).分别包被有特异的anti-tag序列的2种微球,每种微球具有不同颜色编码,anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.11~SEQ ID NO.12 中的序列;

(2).针对SNP位点设计的1对ASPE引物:每种ASPE引物由3’端的针对目的基因SNP位点的特异性序列和5’端的tag序列组成,所述tag序列能相应地与(1)中所选的微球上anti-tag序列互补配对;所述针对目的基因SNP位点的特异性序列为:SEQ ID NO.5及SEQ ID NO.6;

(3).扩增出具有ABCB1基因SNP位点的目标序列的引物。

5.根据权利要求4所述的ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,

所述扩增引物为SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18。

6.根据权利要求4或5所述的ABCB1基因SNP检测液相芯片,其特征是,所述特异ASPE引物为:由SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.5组成的ASPE引物,及由SEQ ID NO.24和SEQ ID NO.6组成的ASPE引物。

7.一种CYP2C19基因SNP检测液相芯片,其特征是,主要包括有:

(1).分别包被有特异的anti-tag序列的4种微球,每种微球具有不同颜色编码,anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.7~SEQ IDNO.10中的序列;

(2).针对每种型别的SNP位点分别设计的2对ASPE引物,每种ASPE引物由3’端的针对目的基因SNP位点的特异性序列和5’端的tag序列组成,所述tag序列能相应地与(1)中所选的微球上anti-tag序列互补配对;所述针对目的基因SNP位点的特异性序列分别为:SEQID NO.1及SEQ ID NO.2、和SEQ ID NO.3及SEQ ID NO.4;

(3).扩增出具有CYP2C19基因SNP位点的目标序列的引物。

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