[发明专利]一种外切酶保护荧光定量PCR检测壬基酚的方法无效
申请号: | 200910056752.9 | 申请日: | 2009-08-20 |
公开(公告)号: | CN101691606A | 公开(公告)日: | 2010-04-07 |
发明(设计)人: | 赵晓祥;邓琴 | 申请(专利权)人: | 东华大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/44;G01N21/64 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达;谢文凯 |
地址: | 201620 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 外切 保护 荧光 定量 pcr 检测 壬基 方法 | ||
1.一种外切酶保护荧光定量PCR检测壬基酚的方法,包括如下步骤:
(1)含受体细胞溶质的提取:取经过一个月壬基酚暴露喂养后的金鱼,用5mg/L的苯坐卡因麻醉。取出肝脏,用0.15mol/L冰上预冷的KCl溶液洗去肝脏外血液,再用灭过菌的滤纸吸干表面水分,按照肝脏m∶缓冲液v=1∶4比例加入冰上预冷的HEDG缓冲液于玻璃匀浆器中匀浆;匀浆液于12000g离心20min,收集上清,再于16000g离心1小时,小心吸取上清,即为含有受体的细胞溶质,分装后于-80℃保存备用;
(2)结合DNA的制备:将pUC19质粒稀释50倍作为模板,常规PCR方法扩增制得结合DNA;产物于1%琼脂糖凝胶电泳分离,用PCR产物快速纯化试剂盒纯化回收;
(3)受体-配体结合:将1g/L的壬基酚按10倍比稀释为10-8~10-2g/L,各取10μl,加入上述提取的细胞溶质250μl,于20℃振荡温育2h;
(4)受体-配体-结合DNA复合物的制备:从上述每管中取出20μl于1.5mlEP管中,加入1μg poly(dI.dC)于20℃温育15min后,再加入2μl结合DNA,继续20℃温育15min,此时溶液中为受体配体DNA复合物;
(5)外切酶消解:按照复合物、核酸外切酶III buffer和HEDG缓冲液的体积比为6∶1∶3向复合物中加入核酸外切酶buffer和HEDG缓冲液,混匀后37℃温育15min;每20μl再加入核酸外切酶III 100U,混匀后于37℃温育15min;取出5μl酶切产物,加入S1核酸酶量为50U的15μl S1核酸酶混合液,37℃温育30min;再加入1μlS1核酸酶停止液,70℃灭活10min;得到荧光定量PCR的模板;
(6)荧光定量PCR扩增:每20μl体系的组成为SYBR Green I Master mix10μl,浓度为10μmol/L的引物R11μl,浓度为10μmol/L的引物R21μl,模板2.5μl,灭菌双蒸水5.5μl;荧光定量PCR循环步骤:94℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,循环40次;最后在72℃延伸5min;
(7)建立荧光定量PCR检测壬基酚标准曲线;
(8)根据标准曲线,经线性回归分析,得到壬基酚浓度与Ct值关系,进行不同浓度壬基酚的检测;
步骤(2)所述的结合DNA制备过程中,引物碱基序列为:上游引物F1:5′CGGAGTTCCG TGAGA AGA GG ATAAC GCAGG AAAGA ACATG 3′下游引物F2:5′CTCTTCTCAC GCAAC TCCGG TCAGG CAACT ATGGA TGAAC 3′;
步骤(6)所述的荧光定量PCR扩增过程中,引物碱基序列为:上游引物R1:5′TCGACGCTCAAGTCA GAG 3′;下游引物R2:5′TAGCA CCGCC TACAT ACC 3′。
2.根据权利要求1所述的外切酶保护荧光定量PCR检测壬基酚的方法,其特征在于:步骤(3)所述的受体-配体结合,采用表面等离子体共振定性鉴定雌激素受体蛋白与壬基酚结合情况。
3.根据权利要求1所述的外切酶保护荧光定量PCR检测壬基酚的方法,其特征在于:步骤(5)所述的外切酶消解,S1核酸酶停止液含0.3mol/LTris碱,1.35mol/LEDTA。
4.根据权利要求1所述的外切酶保护荧光定量PCR检测壬基酚的方法,其特征在于:步骤(6)所述的荧光定量PCR扩增体系,每20μl体系中所包含MgCl2浓度为2μmol/L。
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