[发明专利]白血病融合基因的联合并行检测方法及诊断试剂盒无效
申请号: | 200910056971.7 | 申请日: | 2009-03-20 |
公开(公告)号: | CN101838682A | 公开(公告)日: | 2010-09-22 |
发明(设计)人: | 邵棠;孙黎;徐春雷 | 申请(专利权)人: | 江苏迈迪基因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 王函 |
地址: | 214192 江苏省无锡市锡山经济*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 白血病 融合 基因 联合 并行 检测 方法 诊断 试剂盒 | ||
1.一种白血病融合基因的联合并行检测方法,包括以下步骤:
(1)包含10种不同荧光编码的羧基微球Beads,每种微球上分别共价结合针对白血病中染色体易位形成的10种融合基因的mRNA所设计的特异性核酸探针;
(2)针对不同白血病类型中染色体易位所形成的10种融合基因的mRNA,分别设计上下游引物,对不同的融合基因mRNA,通过逆转录PCR扩增出相应的产物;
(3)含有特异性核酸探针的微球与融合基因mRNA的逆转录扩增产物混合杂交,加入链霉亲和素-藻红蛋白Streptavidin-PE后,通过液相芯片法xMAP检测荧光信号;
(4)将检测到的荧光信号与内参基因的荧光信号进行比较,从而确定检测样品中是否存在白血病融合基因,以及样品中融合基因的表达状况。
2.如权利要求1所述的白血病融合基因的联合并行检测方法,其特征在于,所述的微球是色彩编码微球Color-coded beads,其平均直径为5.6μm,是结合了不同荧光染料的聚苯烯微球。
3.如权利要求1所述的白血病融合基因的联合并行检测方法,其特征在于,所述的白血病中染色体易位形成的融合基因是针对以下10种可以自由组合的融合基因:
BCR-ABL b2a2、BCR-ABL b3a2、BCR-ABL e1a2、E2A-PBX1、TEL-AML1、MLL-AF4e10/e4、CBFB-MYH11 A type、AML1-ETO、PML-RARA L form、PML-RARA S form。
4.如权利要求1所述的白血病融合基因的联合并行检测方法,其特征在于,所述的共价结合于微球上的10条特异性核酸探针,包括如下序列,其中5’端含氨基修饰:
BCR-ABL b2a2:5’-AminolinkerC12TGAAGGGCTTCTTCCTTATT-3’,如SEQ IDNO.1所示;
BCR-ABL b3a2:5’-AminolinkerC12TGAAGGGCTTTTGAACTCTG-3’,如SEQ ID NO.2所示;
BCR-ABL e1a2:5’-AminolinkerC12TGAAGGGCTTCTGCGTCTCC-3’,如SEQ ID NO.3所示;
E2A-PBX1:5’-AminolinkerC12TACTCAAAACACTGTAGGAG-3’,如SEQ ID NO.4所示;
TEL-AML1:5’-AminolinkerC12TCCAAGTATGCATTCTGCTA-3’,如SEQ ID NO.5所示;
MLL-AF4e10/e4:5’-AminolinkerC12AGTAGGTCTGCTTAAAGTCC-3’,如SEQ IDNO.6所示;
CBFB-MYH11A type:5’-AminolinkerC12GCTCATGGACCTCCATTTCC-3’,如SEQID NO.7所示;
AML1-ETO:5’-AminolinkerC12TCAGTACGATTTCGAGGTTC-3’,如SEQ ID NO.8所示;
PML-RARA L form:5’-AminolinkerC12GTCTCAATGGCTGCCTCCCC-3’,如SEQ IDNO.9所示;
PML-RARA S form:5’-AminolinkerC12GTCTCAATGGCTTTCCCCTG-3’,如SEQ IDNO.10所示;
或者包含有上述序列的向5’端或/和3’端延长的序列;
或者与上述序列同源性大于85%的序列;
或者与上述序列的碱基互补序列;
或者使用上述所有序列中的任意一种或一种以上的组合。
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