[发明专利]白血病融合基因的联合并行检测方法及诊断试剂盒无效

专利信息
申请号: 200910056971.7 申请日: 2009-03-20
公开(公告)号: CN101838682A 公开(公告)日: 2010-09-22
发明(设计)人: 邵棠;孙黎;徐春雷 申请(专利权)人: 江苏迈迪基因生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G01N21/64
代理公司: 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 代理人: 王函
地址: 214192 江苏省无锡市锡山经济*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 白血病 融合 基因 联合 并行 检测 方法 诊断 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种白血病融合基因的联合并行检测方法,包括以下步骤:

(1)包含10种不同荧光编码的羧基微球Beads,每种微球上分别共价结合针对白血病中染色体易位形成的10种融合基因的mRNA所设计的特异性核酸探针;

(2)针对不同白血病类型中染色体易位所形成的10种融合基因的mRNA,分别设计上下游引物,对不同的融合基因mRNA,通过逆转录PCR扩增出相应的产物;

(3)含有特异性核酸探针的微球与融合基因mRNA的逆转录扩增产物混合杂交,加入链霉亲和素-藻红蛋白Streptavidin-PE后,通过液相芯片法xMAP检测荧光信号;

(4)将检测到的荧光信号与内参基因的荧光信号进行比较,从而确定检测样品中是否存在白血病融合基因,以及样品中融合基因的表达状况。

2.如权利要求1所述的白血病融合基因的联合并行检测方法,其特征在于,所述的微球是色彩编码微球Color-coded beads,其平均直径为5.6μm,是结合了不同荧光染料的聚苯烯微球。

3.如权利要求1所述的白血病融合基因的联合并行检测方法,其特征在于,所述的白血病中染色体易位形成的融合基因是针对以下10种可以自由组合的融合基因:

BCR-ABL b2a2、BCR-ABL b3a2、BCR-ABL e1a2、E2A-PBX1、TEL-AML1、MLL-AF4e10/e4、CBFB-MYH11 A type、AML1-ETO、PML-RARA L form、PML-RARA S form。

4.如权利要求1所述的白血病融合基因的联合并行检测方法,其特征在于,所述的共价结合于微球上的10条特异性核酸探针,包括如下序列,其中5’端含氨基修饰:

BCR-ABL b2a2:5’-AminolinkerC12TGAAGGGCTTCTTCCTTATT-3’,如SEQ IDNO.1所示;

BCR-ABL b3a2:5’-AminolinkerC12TGAAGGGCTTTTGAACTCTG-3’,如SEQ ID NO.2所示;

BCR-ABL e1a2:5’-AminolinkerC12TGAAGGGCTTCTGCGTCTCC-3’,如SEQ ID NO.3所示;

E2A-PBX1:5’-AminolinkerC12TACTCAAAACACTGTAGGAG-3’,如SEQ ID NO.4所示;

TEL-AML1:5’-AminolinkerC12TCCAAGTATGCATTCTGCTA-3’,如SEQ ID NO.5所示;

MLL-AF4e10/e4:5’-AminolinkerC12AGTAGGTCTGCTTAAAGTCC-3’,如SEQ IDNO.6所示;

CBFB-MYH11A type:5’-AminolinkerC12GCTCATGGACCTCCATTTCC-3’,如SEQID NO.7所示;

AML1-ETO:5’-AminolinkerC12TCAGTACGATTTCGAGGTTC-3’,如SEQ ID NO.8所示;

PML-RARA L form:5’-AminolinkerC12GTCTCAATGGCTGCCTCCCC-3’,如SEQ IDNO.9所示;

PML-RARA S form:5’-AminolinkerC12GTCTCAATGGCTTTCCCCTG-3’,如SEQ IDNO.10所示;

或者包含有上述序列的向5’端或/和3’端延长的序列;

或者与上述序列同源性大于85%的序列;

或者与上述序列的碱基互补序列;

或者使用上述所有序列中的任意一种或一种以上的组合。

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