[发明专利]一株纤维素降解菌株LCB12的基因无效
申请号: | 200910063061.1 | 申请日: | 2009-07-06 |
公开(公告)号: | CN101665790A | 公开(公告)日: | 2010-03-10 |
发明(设计)人: | 刘琨;王焰新;李平;王艳红;童蕾;刘珩 | 申请(专利权)人: | 中国地质大学(武汉) |
主分类号: | C12N15/31 | 分类号: | C12N15/31;C12R1/01 |
代理公司: | 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 | 代理人: | 唐万荣 |
地址: | 430074湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 纤维素 降解 菌株 lcb12 基因 | ||
1.一株纤维素降解菌株LCB12的基因,其特征在于:为嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)LCB12 CCTCC N:M 209098的16S r DNA基因,其菌株的16S r DNA全序列如下:
CAGAGTGAAC GCTGGCGGTA GGCCTAACAC ATGCAAGTCG AACGGCAGCA CAGGAGAGCT 60
TGCTCTCTGG GTGACGAGTG GCGGACGGGT GAGGAATGCA TCGGAATTTA CTCTTTCGTG 120
GGGGATAACG TAGGGAAACT TACGCTAATA CCGCATACGA CCTACGGGTG AAAGCCGGGG 180
ACCTTCGGGC CTGGCGCGAA TGAATGAGCC GATGCCCGAT AGCTAGTTGG CGGGGTAAGA 240
GCCCACCAAG GCGACGATCG GTAGCTGGTC TGAGAGGATG ATCAGCCACA CTGGAACTGA 300
GACACGGTCC AGACTCCTAC GGGAGGCAGC AGTGGGGAAT ATTGGACAAT GGGCGCAAGC 360
CTGATCCAGC CATACCGCGT GGGTGAAGAA GGCCTTCGGG TTGTAAAGCC CTTTTGTTGG 420
GAAAGAAAAG CAGTCGGTTA ATACCCGATT GTTCTGACGG TACCCAAAGA ATAAGCACCG 480
GCTAACTTCG TGCCAGCAGC CGCGGTAATA CGAAGGGTGC AAGCGTTACT CGGAATTACT 540
GGGCGTAAAG CGTGCGTAGG TGGTTGTTTA AGTCTGTCGT GAAAGCCCTG GGCTCAACCT 600
GGGAATTGCG ATGGAAACTG GGCGACTAGA GTGTGGCAGA GGATAGTGGA ATTCCTGGTG 660
TAGCAGTGAA ATGCGTAGAG ATCAGGAGGA ACATCCGTGG CGAAGGCGAC TGTCTGGGCC 720
AACACTGACA CTGAGGCACG AAAGCGTGGG GAGCAAACAG GATTAGATAC CCTGGTAGTC 780
CACGCCCTAA ACGATGCGAA CTGGATGTTG GGTGCAATTT GGCACGCAGT ATCGAAGCTA 840
ACGCGTTAAG TTCGCCGCCT GGGGAGTACG GTCGCAAGAC TGAAACTCAA AGGAATTGAC 900
GGGGGCCCGC ACAAGCGGTG GAGTATGTGG TTTAATTCGA TGCAACGCGA AGAACCTTAC 960
CTGGCCTTGA CATGCACGGA ACTTTCCAGA GATGGATTGG TGCCTTCGGG AACCGTGACA 1020
CAGGTGCTGC ATGGCTGTCG TCAGCTCGTG TCGTGAGATG TTGGGTTAAG TCCCGCAACG 1080
AGCGCAACCC TTGTCCTTAG TTGCCAGCAC GTAATGGTGG GAACTCTAAG GAGACCGCCG 1140
GTGACAAACC GGAGGAAGGT GGGGATGACG TCAAGTCATC ATGGCCCTTA CGGCCAGGGC 1200
TACACACGTA CTACAATGGT GGGGACAGAG GGCTGCAAGC CGGCGACGGT AAGTCAATCG 1260
CAGAAACCCC ATCTCAGTCC GTATTGGAGT CTGCAACTCG ACTCCATGAA GTCGGAATCG 1320
CTAGTAATCG CAGATCAGCA TTGCTGCGGT GAATACGTTC CCGGGCCTTG TACACACCGC 1380
CCGTCACACC ATGGGAGTTT GTTGCACCAG AAGCAGGTAG CTTAACCTTC GGGAGGGCGC 1440
TGCAC 1445
上述16S r DNA序列全长1445个核苷酸。
2.根据权利要求1所述的一株纤维素降解菌株LCB12的基因,其特征在于:采用BLAST分析法,对嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)LCB12 CCTCC N:M 209098的16S rRNA基因序列与GenBank数据库比较分析发现,嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)LCB12 CCTCC N:M 209098与嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)的同源性高达99.0%。
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