[发明专利]一株纤维素降解菌株LCB12的基因无效

专利信息
申请号: 200910063061.1 申请日: 2009-07-06
公开(公告)号: CN101665790A 公开(公告)日: 2010-03-10
发明(设计)人: 刘琨;王焰新;李平;王艳红;童蕾;刘珩 申请(专利权)人: 中国地质大学(武汉)
主分类号: C12N15/31 分类号: C12N15/31;C12R1/01
代理公司: 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 代理人: 唐万荣
地址: 430074湖北*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 纤维素 降解 菌株 lcb12 基因
【权利要求书】:

1.一株纤维素降解菌株LCB12的基因,其特征在于:为嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)LCB12 CCTCC N:M 209098的16S r DNA基因,其菌株的16S r DNA全序列如下:

CAGAGTGAAC GCTGGCGGTA GGCCTAACAC ATGCAAGTCG AACGGCAGCA CAGGAGAGCT    60

TGCTCTCTGG GTGACGAGTG GCGGACGGGT GAGGAATGCA TCGGAATTTA CTCTTTCGTG    120

GGGGATAACG TAGGGAAACT TACGCTAATA CCGCATACGA CCTACGGGTG AAAGCCGGGG    180

ACCTTCGGGC CTGGCGCGAA TGAATGAGCC GATGCCCGAT AGCTAGTTGG CGGGGTAAGA    240

GCCCACCAAG GCGACGATCG GTAGCTGGTC TGAGAGGATG ATCAGCCACA CTGGAACTGA    300

GACACGGTCC AGACTCCTAC GGGAGGCAGC AGTGGGGAAT ATTGGACAAT GGGCGCAAGC    360

CTGATCCAGC CATACCGCGT GGGTGAAGAA GGCCTTCGGG TTGTAAAGCC CTTTTGTTGG    420

GAAAGAAAAG CAGTCGGTTA ATACCCGATT GTTCTGACGG TACCCAAAGA ATAAGCACCG    480

GCTAACTTCG TGCCAGCAGC CGCGGTAATA CGAAGGGTGC AAGCGTTACT CGGAATTACT    540

GGGCGTAAAG CGTGCGTAGG TGGTTGTTTA AGTCTGTCGT GAAAGCCCTG GGCTCAACCT    600

GGGAATTGCG ATGGAAACTG GGCGACTAGA GTGTGGCAGA GGATAGTGGA ATTCCTGGTG    660

TAGCAGTGAA ATGCGTAGAG ATCAGGAGGA ACATCCGTGG CGAAGGCGAC TGTCTGGGCC    720

AACACTGACA CTGAGGCACG AAAGCGTGGG GAGCAAACAG GATTAGATAC CCTGGTAGTC    780

CACGCCCTAA ACGATGCGAA CTGGATGTTG GGTGCAATTT GGCACGCAGT ATCGAAGCTA    840

ACGCGTTAAG TTCGCCGCCT GGGGAGTACG GTCGCAAGAC TGAAACTCAA AGGAATTGAC    900

GGGGGCCCGC ACAAGCGGTG GAGTATGTGG TTTAATTCGA TGCAACGCGA AGAACCTTAC    960

CTGGCCTTGA CATGCACGGA ACTTTCCAGA GATGGATTGG TGCCTTCGGG AACCGTGACA    1020

CAGGTGCTGC ATGGCTGTCG TCAGCTCGTG TCGTGAGATG TTGGGTTAAG TCCCGCAACG    1080

AGCGCAACCC TTGTCCTTAG TTGCCAGCAC GTAATGGTGG GAACTCTAAG GAGACCGCCG    1140

GTGACAAACC GGAGGAAGGT GGGGATGACG TCAAGTCATC ATGGCCCTTA CGGCCAGGGC    1200

TACACACGTA CTACAATGGT GGGGACAGAG GGCTGCAAGC CGGCGACGGT AAGTCAATCG    1260

CAGAAACCCC ATCTCAGTCC GTATTGGAGT CTGCAACTCG ACTCCATGAA GTCGGAATCG    1320

CTAGTAATCG CAGATCAGCA TTGCTGCGGT GAATACGTTC CCGGGCCTTG TACACACCGC    1380

CCGTCACACC ATGGGAGTTT GTTGCACCAG AAGCAGGTAG CTTAACCTTC GGGAGGGCGC    1440

TGCAC                                                                1445

上述16S r DNA序列全长1445个核苷酸。

2.根据权利要求1所述的一株纤维素降解菌株LCB12的基因,其特征在于:采用BLAST分析法,对嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)LCB12 CCTCC N:M 209098的16S rRNA基因序列与GenBank数据库比较分析发现,嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)LCB12 CCTCC N:M 209098与嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)的同源性高达99.0%。

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