[发明专利]结核分枝杆菌噬菌体随机肽库无效
申请号: | 200910066714.1 | 申请日: | 2009-03-30 |
公开(公告)号: | CN101555630A | 公开(公告)日: | 2009-10-14 |
发明(设计)人: | 张林波;王海燕;刘香英;姜秀云;沙里金;张丹丹;吴红珍;关松磊 | 申请(专利权)人: | 吉林农业大学 |
主分类号: | C40B40/08 | 分类号: | C40B40/08;C40B30/04;C12N7/01;G01N33/569;C12R1/32 |
代理公司: | 长春市四环专利事务所 | 代理人: | 刘玉仁 |
地址: | 130118吉林省长*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 结核 分枝杆菌 噬菌体 随机 | ||
1、结核分枝杆菌噬菌体随机肽库,其特征在于,是由下述方法制备的:
A、用现有技术方法提取结核分枝杆菌H37Rv基因组;
B、按H37Rv基因组12.0μl(DNA浓度4.8μg/μl)、DNaseI0.5μl、10×Buffer1.5μl比例配制反应系,温度16℃消化结核分枝杆菌H37Rv基因组;反应30min;加入1/10体积的EDTA(0.25M)终止反应,得随机基因片段50-80bp;
C、取脱磷酸的噬菌体M13KE和平端化的随机DNA片段进行连接,连接体系为:M13KE8μl、随机DNA片段25μl、10×Buffer-24μl、T4DNA连接酶(NEB)3μl,总体积为40μl;电击参数为:2mm电击杯,电压2500v,电阻200Ω,电容25μF;电击后记录数为:电压2385v,时间3.4ms,分别于16℃连接16h;得结核分枝杆菌噬菌体随机肽库,用TU(transducting unit,TU)值来衡量,库容量为62×100×100=6.2×105/ml。
2、根据权利要求1所述的结核分枝杆菌噬菌体随机肽库,其特征在于,用常规M13方法对噬菌体的扩增,然后进行三轮淘选:
第一轮淘选
1)96孔酶标板,鹿结核阳性血清IgG溶液(100μg/ml)作为靶分子溶液;
2)包被:每孔加150μl①溶液,沿孔壁加入使表面完全润湿;
3)在增湿容器中4℃过夜;
4)封阻:倒掉包被液,用力拍甩以除去残余溶液;每孔加满封阻液,4℃作用1h;
5)倒掉封阻液,用TBST缓冲液快速洗板6次;倾去缓冲液,倒置在干净滤纸上拍甩以除去残余溶液;
6)取100μl用TBST缓冲液稀释的噬菌体展示基因组肽库(滴度为1.50×1011),加入到已封阻的酶标板上,温和摇动10~60min;
7)倾倒除去未结合噬菌体,倒置板在干净滤纸上拍甩除去残余溶液;
8)按⑤中所述方法用TBST缓冲液洗板10次,每次换一干净的滤纸以避免交叉污染;
9)用非特异性缓冲液(0.2M Glycine-HCl,1mg/ml BSA)分离已结合的分子(温和摇动>10min),将洗脱液吸入另一干净微量离心管中,用15μlMTris-HCl中和;
10)常规M13方法测定洗脱物扩增前滴度;
11)将测定滴度后剩余的洗脱物扩增:将洗脱物加入到20ml ER2738培养物中(对数前期,OD600≈0.6),37℃、200rpm振荡培养4.5h;
12)将上述培养物转入一离心管中,4℃10,000rpm离心10min,上清转入另一离心管中,再离心;
13)将上清的上部80%转入一新鲜管中,加入1/6体积的PEG/NaCl,4℃沉淀过夜;
14)4℃10,000rpm离心15min,倒掉上清液,再短暂离心,弃去残留上清液;
15)沉淀物重悬于1ml TBS中,悬液转入微量离心管中,4℃10,000rpm离心5min使残余细胞沉淀;
16)上清转入另一新鲜微量离心管中,用1/6体积的PEG/NaCl再沉淀;冰上孵育15~60min,4℃10,000rpm离心10min,弃上清,再短暂离心,用微量移液器吸去残余上清;
17)沉淀物重悬于200μlTBS,0.02%NaN3中,4℃10,000rpm离心1min,上清转入新鲜管中,此即为扩增后的洗脱物;4℃贮存;
18)测定扩增后洗脱物滴度;
19)再包被一个板准备第二轮淘选时用;
第二轮淘选
1)第二轮淘选所用噬菌体的加入量为1.5×1011pfu;
2)第二轮淘选:用第一轮淘选扩增的洗脱物重复第一轮筛选中的步骤,包被用的鹿结核IgG浓度为50μg/ml(用0.1M PH8.6NaHCO3稀释100μg/ml的鹿结核IgG),在清洗步骤中将Tween-20的浓度增至0.5%(v/v);
3)测定第二轮淘选所得的洗脱物扩增后的滴度;
4)再包被一个板准备第三轮淘选时用;
第三轮淘选
用第二轮淘选扩增的洗脱物重复第一轮筛选中的步骤,第二轮淘选所用噬菌体的加入量为1.5×1011pfu,包被用的鹿结核IgG浓度为25μg/ml(用0.1M PH8.6NaHCO3稀释100μg/ml的鹿结核IgG),在清洗步骤中将Tween-20的浓度增至0.5%(v/v)。
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