[发明专利]生物信息计算网格系统有效

专利信息
申请号: 200910071229.3 申请日: 2009-01-09
公开(公告)号: CN101488872A 公开(公告)日: 2009-07-22
发明(设计)人: 张伟哲;张宏莉;刘文懋;何慧;吴太康;许笑 申请(专利权)人: 哈尔滨工业大学
主分类号: H04L12/18 分类号: H04L12/18;G06F17/30
代理公司: 哈尔滨市松花江专利商标事务所 代理人: 牟永林
地址: 150001黑龙江*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 生物 信息 计算 网格 系统
【权利要求书】:

1.生物信息计算网格系统,它包括生物信息计算门户网站服务器(1)、多个生物信息计算服务的发布者终端(2)和多个服务的使用者终端(4);生物信息计算服务的发布者终端(2)向生物信息计算门户网站服务器(1)提供服务的源代码或可执行程序;服务的使用者终端(4)从生物信息计算门户网站服务器(1)寻找自己需要的服务,并通过生物信息计算门户网站服务器(1)运行生物信息计算服务的发布者终端(2)上的可执行程序以获得结果,或者服务的使用者终端(4)根据生物信息计算服务的发布者终端(2)所提供的源代码自行编写程序在生物信息计算服务的发布者终端(2)上运行以获得结果;生物信息计算服务的发布者终端(2)所提供的源代码或可执行程序以XML文件形式发布;

它还包括多个服务的部署者服务器(3),服务的部署者服务器(3)从生物信息计算服务的发布者终端(2)的官方站点或者生物信息计算门户网站服务器(1)的镜像下载生物信息计算服务的发布者终端(2)所发布的服务,部署到自己的服务器上,供所有的服务的使用者终端(4)使用,并将自己的服务部署信息登记到生物信息计算门户网站服务器(1)上;

其特征在于所述生物信息计算门户网站服务器(1)包括用户管理模块(1-1)、服务发布模块(1-2)、服务部署模块(1-3)、服务监测模块(1-4)、作业调度模块(1-5)和作业状态检测模块(1-6);

用户管理模块(1-1):以完成对不同的用户提供相应的服务和规定相应的操作权限;

服务发布模块(1-2):以完成生物信息计算服务的发布者终端(2)在生物信息计算门户网站服务器(1)上发布其生物信息计算服务并注册其服务;

服务部署模块(1-3):以完成对服务的部署者服务器(3)服务部署信息的登记,生成服务的部署信息文件;

服务监测模块(1-4):每隔一段时间对所有的生物信息计算服务的发布者终端(2)、服务的使用者终端(4)和服务的部署者服务器(3)资源的状态进行一次检测,如果遇到资源失效,则会将其标记为不可用;如果资源恢复,则将其重新标记为可用;同时,检测过程中,系统还会收集资源的硬件和软件信息,用于调度决策的依据;

作业调度模块(1-5):以完成服务的使用者终端(4)所要求的生物信息计算服务在多个生物信息计算服务的发布者终端(2)和多个服务的部署者服务器(3)之间的任务布置和调度指挥;

作业状态检测模块(1-6):以完成作业进程的状态跟踪和显示。

2.根据权利要求1所述的生物信息计算网格系统,其特征在于作业调度模块(1-5)使用在线启发式的调度算法;所述在线启发式的调度算法由最快处理器速度优先调度算法、最大处理器数目优先调度算法、最大处理器总量优先调度算法、最大内存总容量优先调度算法、最大空闲内存容量优先调度算法、最大磁盘总容量优先调度算法、最大空闲磁盘容量优先调度算法、最大带宽优先调度算法和随机调度算法组成,在具体的服务中由服务的使用者终端(4)在作业调度模块(1-5)的提示下选择使用哪一个调度算法。

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