[发明专利]一种检测土拉菌的基因液相芯片及其检测方法有效
申请号: | 200910080262.2 | 申请日: | 2009-03-17 |
公开(公告)号: | CN101560562A | 公开(公告)日: | 2009-10-21 |
发明(设计)人: | 王静;文海燕;孙肖红;杨宇;胡孔新;宋亚军;刘衡川 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;G01N21/64;C12R1/01 |
代理公司: | 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 尹振启 |
地址: | 100025北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 土拉菌 基因 芯片 及其 方法 | ||
1.一种检测土拉菌(Francisella tularensis)的基因液相芯片,该芯片包括:荧 光编码的微球、捕获探针、引物、PCR反应体系、链亲和素-藻红蛋白;
其中所述引物包括:
Ft-F GGGCAAATCTAGCAGGTCAAG
Ft-R GCTGTAGTCGCACCATTATCCT
下游引物5’端经生物素标记:
Ft-R:5’-生物素-GCTGTAGTCGCACCATTATCCT;
其中所述捕获探针选自:
探针名称 探针序列(5’-3’)
Ft TGCTGGTTTAACATGGTTCTTTGG
上面所述探针在合成时在5’端进行氨基修饰,并且连接15-20个T 作为间隔链,然后将探针与所选的编码微球进行偶联。
2.用权利要求1所述的基因液相芯片检测土拉菌的非诊断性检测方法, 该方法包括:样本核酸的提取,PCR扩增,检测病原体核酸;其中所述 样本核酸的提取包括以下步骤:
1)向每管样本中加入NaI,振荡混匀,煮沸;
2)离心,转上清液至另一含20%玻璃粉液的离心管中;
3)充分混匀,室温放置,使暴露的DNA吸附于玻璃粉上;离心,小心倾 去上清液;
4)向玻璃粉-DNA沉淀中加入75%乙醇,充分混匀,离心,小心倾去上 清液;
5)重复步骤4),然后置于37℃恒温箱内干燥;
6)向上述干燥的玻璃粉-DNA沉淀中加20μl TE,充分混匀,65℃加热, 离心,回收上清液备用;
其中所述检测步骤包括:
1)取偶联微球,装于PCR管中,根据微球计数结果计算相应加入量;
2)向各管中加5~17μl PCR扩增得到的产物,混匀;
3)95℃变性10分钟;随后45~60℃反应10~30分钟;
4)离心或抽滤去掉未结合的PCR产物;
5)再向各孔加链亲和素-藻红蛋白,室温避光孵育,抽滤去掉未结合的 SA-PE;
6)再向各孔加入75μlTE悬浮液,振荡使微球重悬;上检测仪器进行检测。
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