[发明专利]提高DNA回收试剂盒回收效率的震荡洗脱方法有效

专利信息
申请号: 200910110854.4 申请日: 2009-01-09
公开(公告)号: CN101463350A 公开(公告)日: 2009-06-24
发明(设计)人: 汤坤贤;焦念志 申请(专利权)人: 厦门大学;东山县生态环境科学研究所
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 厦门南强之路专利事务所 代理人: 马应森
地址: 361005福*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 提高 dna 回收 试剂盒 效率 震荡 洗脱 方法
【说明书】:

技术领域

发明涉及一种DNA回收试剂盒,尤其是涉及一种在DNA回收试剂盒的操作步骤中增加一个震荡的方法,以提高DNA的回收效率,用于DNA片段的PCR产物回收。

背景技术

国外公司生产的DNA回收试剂盒(如Takara)一般回收效率较高,但价格昂贵,实验步骤比较繁琐,回收每个样品的试剂成本约是国产试剂盒(如博大泰克)的5倍。国产的回收试剂盒价格便宜,操作简便,但回收效率较低,影响后续的实验,如变性梯度凝胶电泳(DGGE)实验、DNA片段测序等。国内有不少学者对提高DNA的回收效率的方法进行了探讨,主要有电泳法([1]蒋安,梁慧,陈旭等.回收琼脂糖凝胶中DNA的简便方法.生物技术通报.2006(2):102-103)、速冻-快速离心法与凝胶浸泡法([2]王春,陈琳玲,许灿新等.简便快速的PCR产物回收方法.南华大学学报·医学版.2005,33(1):108-110)、冰冻法([3]彭桂庄,庄东红.琼脂糖凝胶电泳中DNA回收方法的比较.生物学杂志.2006,23(5):48-50)和挤压回收法([4]薛仁镐,金圣爱,孙世孟等.琼脂糖凝胶中DNA片段的挤压回收法.生物技术.2006,16(3):50-51),还有其它快速简便的方法([5]姜勇,刘杰,陈伟明.一种从琼脂糖凝胶上回收DNA的高效、快捷、经济的方法.细胞生物学杂志.2000,22(4):220-221;[6]王文锋,穆灵敏,王红霞.一种高效·快速回收DNA片断的方法.安徽农业科学.2008,36(28):12118;[7]朱晓峰,安小平,陈锦辉等.一种简便、高效、经济的从凝胶中回收DNA的方法.生物技术通讯.2006,17(4):603-604)。

实验室的DNA回收一般使用现成的试剂盒。以博大泰克B型小量DNA片段快速胶回收试剂盒为例,其回收方法的实验步骤为:

(1)制作1%的琼脂糖回收胶,PCR产物上样电泳,切下目的条带放入1.5ml离心管中。

(2)加入550μl溶胶液,55℃溶胶5min,期间摇动2次。

(3)装柱,9000rpm,离心30s,重复1次,去掉废液。

(4)500μl漂洗液漂洗,12000rpm离心30s,重复漂洗一次。倒掉废液后,再于12000rpm离心2min。

(5)往柱子中加入合适的洗脱液(通常30~50μl),室温下放置1~2min后,12000rpm离心2min。按说明书,为提高回收率,一般分2次加入洗脱液,每次25μl,共50μl。

这样的回收结果往往DNA浓度偏低,经常会出现有些样品达不到后续的实验要求,如进行DGGE实验或送测序,需要重新PCR和胶回收,浪费试剂和时间,影响实验进度。部分勉强能用于后续实验的样品,由于DNA浓度较低,也影响实验效果,如DGGE条带淡且模糊,有些信息因此无法表达,需要重新进行DGGE实验,更加浪费时间和试剂。

发明内容

本发明的目的在于针对现有的DNA回收试剂盒的回收效率较低等不足,提供一种回收效率较高,能满足后续实验需求的提高DNA回收试剂盒回收效率的震荡洗脱方法。

本发明的技术方案是在现有的上述DNA回收试剂盒回收方法基础上对其中的步骤(5)进行改进。

本发明包括以下步骤:

1)制备1%的琼脂糖回收胶,PCR产物上样电泳,切下目的条带放入1.5ml离心管中;

2)加入550μl溶胶液,55℃溶胶5min,期间摇动2次;

3)装柱,9000rpm,离心30s,重复1次,去掉废液;

4)500μl漂洗液漂洗,12000rpm离心30s,重复漂洗一次,倒掉废液后,再于12000rpm离心2min;

5)往柱子中加入1次洗脱液,洗脱液的加入量按回收试剂盒的一次加入量计,静置,将装有柱子的离心管插在震荡器的孔中,以500~1000rpm/min的速度震荡,回收DNA。其回收浓度达到最大,比不震荡的浓度提高约20%。

在步骤5)中,所述静置的时间可为0~5min,最好为1min,震荡的速度最好是800rpm/min,震荡的时间可为0.5~5min,最好是2min。

与现有的回收方法相比,本发明具有以下突出优点:

1)与只加1次30μl的洗脱液不震荡相比,本发明的回收浓度和回收量提高约20%;

2)与加2次共50μl洗脱液不震荡相比,本发明的回收量虽提高较少,约6%,但回收浓度提高约77%;

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