[发明专利]检测靶核酸的方法无效
申请号: | 200910118236.4 | 申请日: | 2009-03-03 |
公开(公告)号: | CN101570793A | 公开(公告)日: | 2009-11-04 |
发明(设计)人: | 中村奈绪子;桥本幸二;源间信弘 | 申请(专利权)人: | 株式会社东芝 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 罗菊华 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 核酸 方法 | ||
1.一种检测靶核酸的方法,其特征在于,包含:
制备靶核酸和用于监测洗涤水平的监测核酸,所述靶核酸包含靶 序列,且所述监测核酸包含不与靶序列或靶序列的互补序列杂交的序 列,
将所述靶核酸和监测核酸提供给包含靶序列的互补序列的核酸探 针和监测核酸探针,以监测洗涤水平,所述监测核酸探针包含监测核 酸所含的序列的互补序列,从而使靶核酸与核酸探针杂交,且使监测 核酸与监测核酸探针杂交;
洗涤在上述步骤中产生的杂种,以去除非特异性杂种,
分别测量来自与靶核酸杂交的核酸探针的信号强度和来自与监测 核酸杂交的监测核酸探针的信号强度,和
检查洗涤步骤是否正常进行;
其中所述监测核酸探针显示出与监测核酸杂交且随后在洗涤的最 佳温度范围和该范围附近的改变的洗涤温度洗涤后信号强度的变化,
预先基于从已经与监测核酸杂交且随后在洗涤的最佳温度范围洗 涤的监测核酸探针得到的信号强度,确定具有上下限的洗涤的最佳信 号强度范围,且
所述检查步骤包含作出下述判断:当从与监测核酸杂交的监测核 酸探针得到的信号强度是在洗涤的最佳信号强度范围内时,洗涤已经 正常进行,和当所述信号强度是在洗涤的最佳信号强度范围外时,洗 涤步骤中存在异常。
2.根据权利要求1的方法,其特征在于,当从与监测核酸杂交的 监测核酸探针得到的信号强度高于洗涤的最佳信号强度范围的上限 时,判断洗涤步骤中存在异常。
3.根据权利要求1的方法,其特征在于,当与监测核酸杂交后没 有洗涤从监测核酸探针得到的信号强度假定为100时,在恒定盐浓度 和恒定pH条件下,在不同的洗涤温度洗涤,监测核酸探针显示出每1 ℃13或更高的信号强度变化速率。
4.根据权利要求3的方法,其特征在于,所述信号强度变化速率 是在恒定盐浓度和恒定pH条件下洗涤时,信号强度比相对于洗涤温度 的函数的近似直线的倾斜度。
5.根据权利要求4的方法,其特征在于,信号强度比相对于洗涤 温度的函数的近似直线是在信号强度比达到50时的洗涤温度±2℃的 范围内的4个点的信号强度形成的直线。
6.根据权利要求1的方法,其特征在于,当与监测核酸杂交后没 有洗涤从监测核酸探针得到的信号强度假定为100时,在恒定盐浓度 和恒定pH条件下,在不同的洗涤温度洗涤,监测核酸探针显示出每1 ℃15或更高的信号强度变化速率。
7.根据权利要求6的方法,其特征在于,所述信号强度变化速率 是在恒定盐浓度和恒定pH条件下洗涤时,信号强度比相对于洗涤温度 的函数的近似直线的倾斜度。
8.根据权利要求7的方法,其特征在于,信号强度比相对于洗涤 温度的函数的近似直线是在信号强度比达到50时的洗涤温度±2℃的 范围内的4个点的信号强度形成的线。
9.根据权利要求1的方法,其特征在于,当与监测核酸杂交后没 有洗涤从监测核酸探针得到的信号强度假定为100时,在恒定盐浓度 和恒定pH条件下,在不同的洗涤温度洗涤,监测核酸探针显示出每1 ℃18或更高的信号强度变化速率。
10.根据权利要求9的方法,其特征在于,所述信号强度变化速 率是在恒定盐浓度和恒定pH条件下洗涤时,信号强度比相对于洗涤温 度的函数的近似直线的倾斜度。
11.根据权利要求10的方法,其特征在于,信号强度比相对于洗 涤温度的函数的近似直线是在信号强度比达到50时的洗涤温度±2℃ 的范围内的4个点形成的直线。
12.根据权利要求1的方法,其特征在于,基于使洗涤后来自非 特异性杂种的信号强度与来自特异性杂种的信号强度彼此不同的温 度,决定洗涤的最佳温度范围。
13.根据权利要求1的方法,其特征在于,所述监测核酸是与靶 核酸相同的核酸,用作监测核酸的序列不同于靶序列。
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