[发明专利]针对抗原表位-抗体可变区的结构信息设计蛋白类药物的方法无效
| 申请号： | 200910151096.0 | 申请日： | 2003-02-21 |
| 公开（公告）号： | CN101684154A | 公开（公告）日： | 2010-03-31 |
| 发明（设计）人： | 沈倍奋;冯建男;黎燕;张巍 | 申请（专利权）人： | 北京天广实生物技术股份有限公司;中国人民解放军军事医学科学院基础医学研究所 |
| 主分类号： | C07K16/00 | 分类号： | C07K16/00;G06F17/50;C07K16/24;C07K7/06 |
| 代理公司： | 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人： | 权陆军;黄可峻 |
| 地址： | 100176北京市经济技术开发*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 针对 抗原 抗体 可变 结构 信息 设计 蛋白 类药物 方法 | ||
1、针对抗原表位-抗体可变区的结构信息设计蛋白类药物的方法，包括以下步骤：
(1)根据抗体可变区的保守序列分析，搭建抗体可变区的初始空间构象；
(2)再利用分子对接的方法模拟出抗体可变区的三维结构，结合牛顿力学方法获得抗体可变区的稳定构象；
(3)在抗原的晶体结构基础上，依据抗原的空间构象、静电效应及几何结构模拟出抗原的功能表位结构；
(4)再经过分子对接方法与分子动力学模拟方法获得抗原表位-抗体可变区复合物空间构象；
(5)最后根据利用上述空间构象特征，结合计算机辅助分子设计原理，得到抗体模拟物。
2、根据权利要求1所述的针对抗原表位-抗体可变区的结构信息设计蛋白类药物的方法，其特征在于：所述的分子对接方法考虑了溶剂效应的影响。
3、根据权利要求1所述的针对抗原表位-抗体可变区的结构信息设计蛋白类药物的方法，其特征在于：所述的牛顿力学方法对抗体结构进行了能量最小化处理。
4、根据权利要求1所述的针对抗原表位-抗体可变区的结构信息设计蛋白类药物的方法，其特征在于：所述的空间构象特征是指几何结构、可及性表面积和表观静电分布。
5、根据权利要求1所述的针对抗原表位-抗体可变区的结构信息设计蛋白类药物的方法，其特征在于：所述的抗体模拟物是指能与抗原表位特异性结合的蛋白类药物。
6、根据权利要求1所述的针对抗原表位-抗体可变区的结构信息设计蛋白类药物的方法，其特征在于：所述的抗原为TNFα，所述的抗体为TNFα的抗体Z12。
7、根据权利要求6所述的针对抗原表位-抗体可变区的结构信息设计蛋白类药物的方法，其特征在于：所述抗原功能表位为TNFα的141-146位氨基酸序列，序列DYLDFA。
8、由TNFα141-146位氨基酸序列DYLDFA组成的抗原功能表位，其根据权利要求1-7中任一项的方法获得。
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