[发明专利]乙型肝炎病毒耐阿德福韦变异病毒株及其应用有效

专利信息
申请号: 200910175180.6 申请日: 2009-10-20
公开(公告)号: CN101899417A 公开(公告)日: 2010-12-01
发明(设计)人: 魏来;杜绍财;刘丽君;王江华 申请(专利权)人: 北京大学人民医院
主分类号: C12N7/00 分类号: C12N7/00;C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/63;C12N1/21;C12R1/19;C12R1/93
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王朋飞
地址: 100044 北京市西城区西*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 乙型肝炎 病毒 耐阿德福韦 变异 及其 应用
【说明书】:

技术领域

发明涉及医药生物技术领域,具体涉及一株耐阿德福韦的乙型肝炎病毒(HBV)变异株,本发明还涉及其检测试剂以及该病毒株在耐药性监测,交叉耐药性分析、药物筛选和新药物的发现等多方面的应用。

背景技术

阿德福韦酯是腺嘌呤磷酸酯化合物阿德福韦(ADV)的前药,口服后可迅速水解为ADV而发挥抗病毒作用。ADV是广谱抗病毒药物,为核苷类病毒逆转录酶抑制剂,通过抑制HBV的复制而发挥抗病毒作用。研究已证实,ADV对HBeAg阳性或HBeAg阴性的慢性乙型肝炎患者均有很好的疗效和安全性。现已作为一线药物应用于慢性乙型肝炎的抗病毒治疗。

与其他核苷类药物一样,ADV治疗中,也会发生HBV DNA耐药突变,从而导致ADV耐药。研究表明,ADV治疗慢性乙型肝炎患者过程中,第1-5年的耐药突变发生率分别为0%、3%、11%、18%和29%。

最常见的ADV耐药突变是HBV聚合酶D区的rtN236T和B区的rtA181V/T。在ADV治疗初期,几种突变可以伴随发生,也可单独出现,但随着疗程的增加,rtA181V常伴随rtN236T而出现。在体外药敏试验中,与野生株病毒相比,rtN236T变异病毒株对ADV的敏感性下降了3.9至13.8倍,而rtA181V变异株下降了2.5至3.0倍。已有多项研究指出,rtN236T的出现改变了复制催化活性区内氨基酸的极性,使得HBV聚合酶的折叠发生了变化,因此在复制阶段不利于其与底物的结合,从而导致复制过程受阻碍。而rtA181V的出现,在一定程度上校正了氨基酸极性上的变化,使得发生rtN236T突变后,聚合酶折叠更接近于原来状态,有利于耐药性变异病毒株的复制传代。此外,体内试验和体外试验的数据均提示,rtA181V变异对拉米夫定的敏感性不及rtN236T变异。这很可能是因为rtA181V变异与拉米夫定的rtL180M相毗邻,所以任何一种变异的发生都会对其产生邻位效应。

突变rtN236T和rtA181V对HBeAg阴性和阳性患者的影响不完全相同。ADV耐药现象在低病毒血症且HBeAg阳性患者中的发生率相当低,耐药的发生也部分体现在ALT的升高上。对于HBeAg阴性的患者来说,ADV治疗48周后停药,治疗获益常在停药1~2年后消失。但若继续用药直至144周,患者在治疗48周时所获得的病毒学、血清生化及组织学等各方面改善,将被保留且进一步好转。期间耐药发生率很低,且负面作用与初始的48周治疗时相似。

目前,ADV也常用于前期拉米夫定治疗失效的患者。早期48周及96周临床试验均提示,无论是野生型还是YMDD突变型病毒株,均对ADV敏感,治疗后HBV DNA下降呈指数趋势,且患者的耐受性良好。故两种药物联合应用更加有效地抑制了病毒的复制,但也可能发生聚合酶区的rtL180M+M204V和rtN236T联合突变,对拉米夫定和ADV产生双重耐药。尽管研究表明,拉米夫定耐药株对ADV敏感,但对HBV本身来说,三种变异联合增加了对ADV的耐药水平,与rtN236T单突变相比,对ADV的敏感性下降了2倍。在分子水平,联合突变导致底物结合位点更难与阿德福韦结合,因此进一步降低了对ADV的敏感性。

迄今为止,学者们发现不但HBV聚合酶基因区的rtA181V、rtN236T变异可引起ADV相关耐药,其他许多与ADV相关的突变,例如rtI233V、rtS85A、rtS85P、rtS119A、rtH133L、rtV214A、rtH234Q、rtP237H和rtN238D等,也可能与ADV耐药有关。然而,仍有许多慢性乙型肝炎患者,在ADV治疗中出现临床耐药,却检测不出已知变异位点的存在。故ADV相关HBV突变的研究还需要进一步的探索。

发明内容

本发明的目的是,找到引起ADV耐药的HBV新变异位点和相应的HBV突变病毒株,提供此新变异位点的检测方法和检测试剂盒,提供相应HBV突变病毒株的鉴定方法和鉴定试剂盒,以及此新变异位点和相应的HBV突变病毒株在筛选抗HBV药物,监测耐药突变等方面的应用。

本发明发现rtE218G突变,即HBV DNA聚合酶区218位的氨基酸密码子由GAG突变为GGG,该突变是与ADV耐药相关的新的HBV基因突变位点。体外表型实验结果显示,rtE218G突变病毒株能够独立引起对ADV的耐药,其IC50是野生病毒株的5.5倍。rtE218G突变株在体外的复制能力有所降低,大约是野生株的87%。

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