[发明专利]一种蛋白激酶磷酸化特异位点计算识别方法

权利要求书

1.一种蛋白激酶磷酸化特异位点计算识别方法，其特征在于包括如下步骤：

a)具体包括a1)精选20种天然氨基酸的629种三维性质参数，包括Randic 分子剖面参数，几何特征参数，基于不同原子间距的径向基函数描述子， 基于电衍射法的分子结构表征得到的描述子，加权整体不变分子的描述 子以及几何、拓扑与原子重量的集合参数；a2)对629种三维性质参数做 主成分分析，得到12个主成分；a3)计算各主成分得分，建立氨基酸三维 性质得分；

b)用氨基酸三维性质得分表征蛋白激酶磷酸化特异位点的结构特征，其中的 每个氨基酸用12个氨基酸三维性质得分表征；

c)用费歇尔准则得分方法挑选与蛋白激酶磷酸化特异位点特征密切相关的 性质参数，并作为模型的输入变量；

d)用径向基核支持向量机建立蛋白激酶磷酸化特异位点识别模型，以自取代 检验，留1/10法交互检验以及外部检验验证模型的预测能力，将每个样 本的输入变量带入模型并识别蛋白激酶磷酸化特异位点。