[发明专利]用傅立叶红外光谱鉴别微生物的方法有效
申请号: | 200910202963.9 | 申请日: | 2009-05-22 |
公开(公告)号: | CN101556242A | 公开(公告)日: | 2009-10-14 |
发明(设计)人: | 胡昌勤;裴琳;马仕洪;戴翚;肖璜 | 申请(专利权)人: | 中国药品生物制品检定所 |
主分类号: | G01N21/35 | 分类号: | G01N21/35;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京北翔知识产权代理有限公司 | 代理人: | 唐铁军;钟守期 |
地址: | 100050*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 傅立叶 红外 光谱 鉴别 微生物 方法 | ||
1.一种利用红外光谱鉴别微生物的方法,包括:
a)培养对照微生物;
b)采集对照微生物的红外图谱;
c)在3000-2800cm-1和1800至700cm-1区间内的一个或多个谱段建 立微生物鉴别模型;
d)在与步骤a)中相同的条件下培养待测微生物;
e)在与步骤b)中相同的条件下采集待测微生物的红外图谱;
f)将步骤e)中获得的红外图谱代入微生物鉴别模型中确定待测微生 物的归属,
其中步骤c)中所述的鉴别模型为定性分析鉴别模型,在所述定性分 析鉴别模型中,待测微生物的归属如下进行:根据模型的识别率确定微 生物鉴别模型的临界匹配值,对每一种对照微生物的数据的采集平行进 行m次,将待测微生物与对照微生物的匹配值从小到大排列,至少前n 个匹配值均小于临界匹配值,并且对应于这些匹配值的微生物属于同一 类别,则该待测微生物被归入前n个匹配值所对应的微生物类别中,所 述m为选自2-10的整数。
2.权利要求1的方法,其中所述m为选自2-5的整数。
3.权利要求1的方法,其中所述m为3。
4.一种利用红外光谱鉴别微生物的方法,包括:
a)培养对照微生物;
b)采集对照微生物的红外图谱;
c)在3000-2800cm-1和1800至700cm-1区间内的一个或多个谱段建 立微生物鉴别模型;
d)在与步骤a)中相同的条件下培养待测微生物;
e)在与步骤b)中相同的条件下采集待测微生物的红外图谱;
f)将步骤e)中获得的红外图谱代入微生物鉴别模型中确定待测微生 物的归属,
其中步骤c)中所述的鉴别模型为同时使用聚类分析鉴别模型和定性 分析鉴别模型,所述定性分析鉴别模型如权利要求1所述,所述聚类分 析鉴别模型的第一层采用的谱段为约1200cm-1-约900cm-1、约3000cm-1- 约2800cm-1以及约1500cm-1-约1200cm-1,第二层采用的谱段为约1200 cm-1-约900cm-1、约1500cm-1-约1230cm-1以及约3000cm-1-约2800cm-1, 第三层采用的谱段为约1500cm-1-约1200cm-1、约940cm-1-约760cm-1以及约3100cm-1-约2900cm-1;或约1480cm-1-约1310cm-1以及约920 cm-1-约870cm-1;或约1500cm-1-约1300cm-1以及约950cm-1-约800cm-1, 或者它们的任意组合,
上述数值范围中的“约”表示在相应数值±5%范围内的数值也被包 括在该数值范围内。
5.权利要求1或4的方法,其中所述对照微生物的种类包括待测微 生物的种类以及在红外光谱法鉴别过程中易于与其混淆误判的其他微生 物种类,且所述对照微生物种类归属明确;所述微生物包括细菌或真菌。
6.权利要求1或4的方法,其中所述对照微生物选自肠杆菌科、葡 萄球菌属、假单胞菌属或梭菌属;或它们的任意组合。
7.权利要求1或4的方法,其中所述对照微生物或待测微生物的培 养使用胰酪大豆琼脂培养基、普通营养琼脂培养基、哥伦比亚琼脂培养 基、蛋白胨酵母粉琼脂培养基进行。
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