[发明专利]通过无公式方法确定熔融温度有效
申请号: | 200910207618.4 | 申请日: | 2009-10-16 |
公开(公告)号: | CN101782940A | 公开(公告)日: | 2010-07-21 |
发明(设计)人: | R·T·克尼克 | 申请(专利权)人: | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;C12M1/40 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 朱海煜;王忠忠 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 瑞士;CH |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 公式 方法 确定 熔融 温度 | ||
1.一种确定DNA的熔融温度Tm的计算机实现方法,所述方法包括:
-接收表示DNA样本的熔融曲线的数据集,所述数据集包括各 具有一对坐标值的多个数据点;
-数值确定所述熔融曲线的数据点的一阶导数值;
-确定所述一阶导数值的基线;
-从所述一阶导数值减去所述基线,以产生修正的一阶导数值;
-确定所述修正的一阶导数值的第一最大值;以及
-输出所述第一最大值,其中所述第一最大值表示DNA样本的 熔融温度Tm。
2.如权利要求1所述的方法,还包括以下步骤:
-通过对高斯混合模型函数应用列文伯格-马夸尔特(LM)回归过 程以确定所述函数的一个或多个参数来计算拟合所述修正的一阶导 数值的曲线的近似,其中所述参数包括初始条件,并且其中所述第一 最大值用作第一参数的初始条件;以及
-输出所述第一参数,其中所述第一参数表示DNA样本的第一 熔融温度Tm1。
3.如权利要求2所述的方法,其中,所述高斯混合模型包括如 下形式的表达:
其中,μ1是所述第一参数,以及其中α1和σ1是附加参数。
4.如权利要求1所述的方法,进一步包括:确定所述一阶导数 值是否包括最接近所述第一最大值的台肩值。
5.如权利要求2所述的方法,进一步包括:显示所述第一参数 值。
6.如权利要求2所述的方法,进一步包括以下步骤:
-确定所述修正的一阶导数值的第二、第三或第四最大值,其中 所述第二、第三或第四最大值用作第二、第三或第四参数的初始条件; 以及
-输出所述第二、第三或第四参数,其中所确定的第二、第三或 第四参数表示DNA样本的第二、第三或第四熔融温度Tm2、Tm3或 Tm4。
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