[发明专利]CYP2D6基因突变检测液相芯片及检测方法有效
申请号: | 200910214370.4 | 申请日: | 2009-12-29 |
公开(公告)号: | CN101824467A | 公开(公告)日: | 2010-09-08 |
发明(设计)人: | 许嘉森;何嘉英;曾涛;李国强;朱泽尧 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cyp2d6 基因突变 检测 芯片 方法 | ||
1.一种CYP2D6基因突变检测液相芯片,其特征是,包括有:
(A).针对CYP2D6C2850T、CYP2D6Deletion的突变位点的ASPE引物:每种ASPE引物由5’ 端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列分 别为:SEQID NO.17及SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20;所述tag序列选自SEQ ID NO.1-10中 的任3种序列;
(B).分别包被有特异的anti-tag序列的3种微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有 间隔臂序列,上述每种微球具有不同颜色编码;所述anti-tag序列选自SEQID NO.21~SEQ ID NO.30中的序列,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).用于扩增具有CYP2D6C2850T以及CYP2D6Deletion突变位点的CYP2D6基因目标序列 的扩增引物。
2.根据权利要求1所述的CYP2D6基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物包 括有:SEQ ID NO.37及SEQ ID NO.38,SEQ ID NO.41及SEQ ID NO.42。
3.根据权利要求2所述的CYP2D6基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物还 包括有用于巢式PCR的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32。
4.根据权利要求1所述的CYP2D6基因突变检测液相芯片,其特征是,所述(A)中ASPE 引物分别为:针对CYP2D6C2850T的野生型和突变型由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.17组成的 序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.18组成的序列、及针对CYP2D6Deletion的由SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.20组成的序列。
5.根据权利要求1所述的CYP2D6基因突变检测液相芯片,其特征是,还包括有 (D):针对CYP2D6C100T、CYP2D6G1846A、CYP2D6A2549del、和/或CYP2D6 Dulplication突变位点的ASPE引物,每种ASPE引物由3’端的针对目的基因突变位点的特异 性引物序列和5’端的tag序列组成,所述特异性引物序列为:针对CYP2D6C100T的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12、针对CYP2D6G1846A的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14、针对 CYP2D6A2549del的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16、和针对CYP2D6Dulplication的SEQ ID NO.19中的一组或多组;所述tag序列选自SEQ ID NO.1-10中的序列,该所选tag序列与(A) 中所选tag序列不相同;
(E):与(D)中ASPE引物对应的包被有特异的anti-tag序列的种微球,所述anti-tag 序列与(D)中的所选的对应tag序列互补配对;所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间 隔臂序列,上述每种微球具有不同颜色编码;
(F):用于扩增具有CYP2D6C100T、CYP2D6G1846A、CYP2D6A2549del、CYP2D6 Dulplication中一个或多个突变位点的CYP2D6基因目标序列的扩增引物。
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