[发明专利]一组恶性肿瘤中突变PTPα基因及其应用无效

专利信息
申请号: 200910247437.4 申请日: 2009-12-29
公开(公告)号: CN102108365A 公开(公告)日: 2011-06-29
发明(设计)人: 不公告发明人 申请(专利权)人: 上海新号源生物科技有限公司
主分类号: C12N15/55 分类号: C12N15/55;C12Q1/68
代理公司: 上海翼胜专利商标事务所(普通合伙) 31218 代理人: 翟羽
地址: 200436 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一组 恶性肿瘤 突变 ptp 基因 及其 应用
【说明书】:

【技术领域】

发明涉及一组恶性肿瘤中突变PTPα基因。

【背景技术】

蛋白质酪氨酸磷酸激酶(PTKs)和蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTPs)分别为两大酶家族,双方通过磷酸化和去磷酸化的正负调节来维持正常细胞的生命活动,如使生长、发育、分化和凋亡有条不紊的进行。恶性肿瘤的发生往往是由于这种正常平衡调节的失控所致,比如两大酶家族中某一个或几个关键酶基因突变或者酶活性被任何因素激活是诱导引发恶性肿瘤的根本原因。

PTPα(称Protein Tyrosine Phosphataseα)属蛋白质酪氨酸磷酸酶大家族中一员,由793个氨基酸组成,分子量为130KDa,能特异催化酪氨酸残基上修饰的磷酸去磷酸化。通过对原癌基因Src家族酪氨酸磷酸激酶催化底物去磷酸化来调控Src酪氨酸磷酸激酶为主导的信号传导,达到维持细胞生长和有丝分裂的正常进行。PTPα又为受体型的跨膜蛋白质酪氨酸磷酸酶,它不仅参与生长激素受体(EGFR)、胰岛素受体(IR)的信号通路而且还参与细胞迁移的调控并具有抑制肿瘤细胞凋亡的功能。

自1990年PTPα基因被克隆以来,国内外尚未报道恶性肿瘤中有关PTPα突变基因,还没发明检测PTPα基因的突变体的高效技术。

【发明内容】

本发明所要解决的技术问题是,提供恶性肿瘤中一种突变PTPα基因。

本发明所要解决的第二个技术问题是,提供突变PTPα基因在诊断恶性肿瘤中的应用及在恶性肿瘤靶向治疗中的应用。

为了解决上述第一个问题,本发明提供了如下三种突变PTPα基因:ΔPTPα245、ΔPTPα652、ΔPTPα445。

恶性肿瘤中一种突变PTPα基因ΔPTPα245,野生型PTPα基因长度为2379bp,共20个编码外显子,分别是:exon 1:1-73bp;exon 2:74-415bp;exon 3:416-500bp;exon 4:501-574bp;exon 5:575-711bp;exon 6:712-802bp;exon 7:803-879bp;exon 8:880-916bp;exon 9:917-1014bp;exon 10:1015-1134bp;exon11:1035-1301bp;exon 12:1302-1437bp;exon 13:1438-1587bp;exon 14:1588-1681bp;exon 15:1682-1758bp;exon 16:1759-1893bp;exon 17:1894-2019bp;exon 18:2020-2171bp;exon 19:2172-2307bp;exon 20:2308-2379bp,突变PTPα基因突变位置:第711位核甘酸后插入95个新核甘酸片段;基因改变:引起部分第6至20编码外显子缺失;蛋白质改变:蛋白质含245个氨基酸其中融合8个新的氨基酸位于C-末端。

所述95个新核甘酸序列如SEQ ID NO:1所示。

所述8个新的氨基酸序列如下:-VFLWNLTS-。

野生型PTPα基因外显子如图1所示,E代表外显子(exon)。

ΔPTPα245基因外显子如图2所示。

恶性肿瘤中一种突变PTPα基因ΔPTPα652,野生型PTPα基因长度为2379bp,共20个编码外显子,分别是:exon 1:1-73bp;exon 2:74-415bp;exon 3:416-500bp;exon 4:501-574bp;exon 5:575-711bp;exon 6:712-802bp;exon 7:803-879bp;exon 8:880-916bp;exon 9:917-1014bp;exon 10:1015-1134bp;exon11:1035-1301bp;exon 12:1302-1437bp;exon 13:1438-1587bp;exon 14:1588-1681bp;exon 15:1682-1758bp;exon 16:1759-1893bp;exon 17:1894-2019bp;exon 18:2020-2171bp;exon 19:2172-2307bp;exon 20:2308-2379bp,基因突变位置:第1015-1437核甘酸缺失;基因改变:引起第10,11,12编码外显子缺失;蛋白质改变:蛋白质含652个氨基酸。

野生型PTPα基因外显子如图1所示,E代表外显子(exon)。

ΔPTPα652基因外显子如图3所示,第10、11、12外显子缺失,423个核苷酸缺失。

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