[发明专利]干酪乳杆菌Zhang中GroEL的蛋白序列有效
申请号: | 200910250671.2 | 申请日: | 2009-12-14 |
公开(公告)号: | CN101705235A | 公开(公告)日: | 2010-05-12 |
发明(设计)人: | 张和平;孟和;张文羿;孙志宏 | 申请(专利权)人: | 内蒙古农业大学 |
主分类号: | C12N15/31 | 分类号: | C12N15/31;C12N15/10;C07K14/195;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京君智知识产权代理事务所 11305 | 代理人: | 向华 |
地址: | 010018 内蒙古*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 干酪 杆菌 zhang groel 蛋白 序列 | ||
【技术领域】
本发明属于基因工程领域,具体地,涉及一种蛋白编码序列,特别 是一种干酪乳杆菌Zhang中GroEL的蛋白序列。
【背景技术】
益生菌是指通过摄入适当量从而对宿主产生有益作用的活菌,乳杆 菌亦是这一大家族中的主要成员。它们不仅可以加工成各种食品通过消 化道发挥有益作用,还可以外用于同样存在固有菌群的泌尿系统和皮 肤。常见功能主要包括保持肠道正常菌群,对抗感染、缓解乳糖不耐症、 降低胆固醇、抑制癌症和刺激免疫系统。最近几年的临床研究热点集中 于炎症性胃肠病、过敏、外科感染、抗生素相关腹泻、妇科感染、粘膜 免疫、癌症以及肥胖等相关症状上。由于益生菌与健康、营养、饮食的 密切关系,越来越受到消费者的重视。包含有功能性益生菌的食品与饮 料消费正成为全球的一项消费趋势。虽然有着很好的功能性,但其应用 范围却受到很大限制,由于对热、湿度和其它苛刻的条件比较敏感。因 此,能否适应这些环境就成为筛选益生菌的首要条件之一。
GroEL热休克家族蛋白(又称为分子伴侣,属于Hsp60家族),主要 功能是帮助新合成的蛋白质正确折叠和装配,以保证蛋白质有效地发挥 功能,在乳杆菌适应逆境过程中有着举足轻重的作用。从结构上来看, GroEL蛋白是同型寡聚复合物,由14个相对分子质量58×103的亚基 组成,形成两层垛叠的背靠背双环组成的中空圆柱结构,每个环由7个 亚基组成。在GroEL的中央腔中可结合多种非天然的多肽,底物结合 主要靠非天然多肽暴露的疏水侧链和GroEL顶端结构域的疏水残基相 互作用。早期基因突变的研究证明,GroEL在任何温度下都是菌株细胞 生长所必需的。它的突变会降低RNA和DNA合成速度,在非正常温 度下细胞不能进行正常的分裂,和乳杆菌细胞的温度胁迫反应相关。新 近的研究结果却也表明,GroEL蛋白可能竞争抑制约氏乳杆菌对于 HT-29细胞的黏附,这也意味着该蛋白也分泌信号序列,有黏附功能和 黏附关联。
本发明参考其它菌株GroEL基因序列,克隆测序获得干酪乳杆菌 Zhang(Lactobacillus casei Zhang)GroEL基因序列,并对不同物种 GroEL基因核酸和氨基酸序列进行相似性比较,为今后开展与干酪乳杆 菌中GroEL蛋白的相关研究工作提供基础资料。
在文献“王俊国等,干酪乳杆菌Zhang对大鼠抗氧化能力的影响, 营养学报2009年第31卷第1期,公开日2009年2月中公开了干酪乳 杆菌Zhang菌株。
在中国专利申请CN200810175856.7,公开号CN101418270A,公开 日2009年4月29日,扉页、第2页、第6页中公开了干酪乳杆菌Zhang 菌株,并已经说明保藏号为CGMCC1697。
在专利申请号2006101273622,公开号CN 101144062A,公开公开 日为2008年3月19日,提供了分类命名为干酪乳杆菌,名称为zhang 的菌株的生物材料保藏证明,保藏号为CGMCC 1697。
上述文献内容引入本文作为参考。
【发明内容】
本发明提供了一种干酪乳杆菌Zhang中热休克蛋白GroEL编码序 列,该序列是干酪乳杆菌Zhang应激密切相关的基因,其核苷酸序列与 已公布的干酪乳杆菌BL23的核酸序列FM177140和干酪乳杆菌 ATCC334的核酸序列CP000423有99%的相似性。
具体地,本发明提供了一种干酪乳杆菌Zhang中的热休克蛋白 GroEL的编码序列,该序列的核苷酸序列为SEQ ID NO:1,
本发明还提供了一种分离出的干酪乳杆菌Zhang中的GroEL蛋白, 该蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:2。
本发明还提供了SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列的多肽、或其保守 性变异多肽、或其活性片段,或其活性衍生物。
本发明还提供了一种干酪乳杆菌Zhang中热休克蛋白GroEL基因 的克隆和测序方法。该方法包括步骤:(1)PCR引物设计与合成;(2) 干酪乳杆菌DNA的提取;(3)目的片断的PCR扩增;(4)琼脂糖凝胶 电泳检测;(5)目的基因片断回收与鉴定;(6)目的基因片断的克隆与 鉴定;(7)测序,其特征在于PCR引物为SEQ ID NO:3(正向)和SEQ ID NO:4(反向),其序列信息如下:
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