[发明专利]检测人甲型流感病毒H1和/或H3亚型的引物及方法有效
申请号: | 200910303111.9 | 申请日: | 2009-06-10 |
公开(公告)号: | CN101899531A | 公开(公告)日: | 2010-12-01 |
发明(设计)人: | 严安;丁国徽;董辉;熊慧;金维荣;赵国屏;李亦学;车小燕;吴凡;童光志 | 申请(专利权)人: | 上海人类基因组研究中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京元中知识产权代理有限责任公司 11223 | 代理人: | 王明霞 |
地址: | 200020 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 人甲型 流感病毒 h1 h3 引物 方法 | ||
1.一种检测人甲型流感病毒H1和/或H3亚型的引物,其特征在于,包含由SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:6所示的任一核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的检测人甲型流感病毒H1和/或H3亚型的引物,其特征在于,所述引物选自下述两组引物中的至少一组:
(1)用于扩增甲型流感病毒H1靶核酸序列的引物对:包括由SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的至少15个连续核苷酸的核酸引物、由SEQ ID NO:2所示核苷酸序列的至少15个连续核苷酸的核酸引物和由SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的至少15个连续核苷酸的核酸引物;
(2)用于扩增甲型流感病毒H3靶核酸序列的引物对:包括由SEQ ID NO:4所示核苷酸序列的至少15个连续核苷酸的核酸引物、由SEQ ID NO:5所示核苷酸序列的至少15个连续核苷酸的核酸引物和由SEQ ID NO:6所示核苷酸序列的至少15个连续核苷酸的核酸引物。
3.根据权利要求2所述的检测人甲型流感病毒H1和/或H3亚型的引物,其特征在于,所述引物选自下述两组引物中的至少一组:
(1)用于扩增甲型流感病毒H1靶核酸序列的引物对:包括由SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的核酸引物、由SEQ ID NO:2所示核苷酸序列的核酸引物和由SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的核酸引物;
(2)用于扩增甲型流感病毒H3靶核酸序列的引物对:包括由SEQ ID NO:4所示核苷酸序列的核酸引物、由SEQ ID NO:5所示核苷酸序列的核酸引物和由SEQ ID NO:6所示核苷酸序列的核酸引物。
4.一种检测人甲型流感病毒H1和/或H3亚型的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取核酸样本;
(2)以步骤(1)提取的核酸为模板,用权利要求1至3任意一项所述的引物序列,PCR扩增病原体的靶核酸序列;
(3)对扩增产物进行序列测定,并分析结果。
5.根据权利要求4所述的检测人甲型流感病毒H1和/或H3亚型的方法,其特征在于,所述的PCR扩增的反应体系为
cDNA 100倍稀释液:2μl
10×Taq buffer:2μl
dNTP(25mM):2μl
上游引物(10μM):0.6μl
下游引物(10μM):0.6μl
Taq聚合酶(5U/μ1):0.3μl
H2O:12.5μl。
6.根据权利要求4所述的检测人甲型流感病毒H1和/或H3亚型的方法,其特征在于,所述的PCR扩增的反应条件为:94℃预变性5分钟;94℃ 30秒、58℃ 30秒、72℃ 30秒重复反应35~40个循环;最后72℃延伸5分钟。
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