[发明专利]用于产生可测序文库的改进的核酸处理的系统和方法无效

专利信息
申请号: 200980107471.X 申请日: 2009-02-25
公开(公告)号: CN101965410A 公开(公告)日: 2011-02-02
发明(设计)人: M·埃格霍尔姆;B·C·戈温;S·K·哈奇森;D·R·里奇斯;M·T·罗南;J·F·西蒙斯;T·阿尔伯特;M·S·布拉弗曼;M·D·帕尔默;J·杰德罗;J·基奇曼;G·C·费雷里 申请(专利权)人: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 李进;李连涛
地址: 瑞士*** 国省代码: 瑞士;CH
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摘要:
搜索关键词: 用于 产生 序文 改进 核酸 处理 系统 方法
【权利要求书】:

1.用于有效靶标处理的衔接子元件,所述衔接子元件包含:

包含非互补区和互补区的半互补双链核酸衔接子,其中所述非互补区包含第一扩增引物位点和第二扩增引物位点,并且所述互补区包含测序引物位点和一个或多个肌苷物质。

2.权利要求1的衔接子元件,其中所述非互补区包含可检测部分。

3.权利要求1的衔接子元件,其中所述互补区包含平末端。

4.权利要求1的衔接子元件,其中所述互补区包含粘性末端。

5.权利要求1的衔接子元件,其中所述互补区包含多元标识元件。

6.权利要求1的衔接子元件,其中所述肌苷物质位于单链中。

7.权利要求15的衔接子元件,其中所述肌苷物质位于离所述链末端至少四个序列位置。

8.权利要求1的衔接子元件,其中所述互补区包含一个或多个硫代磷酸酯物质。

9.包含权利要求1的半互补双链核酸衔接子的试剂盒。

10.用于有效靶标处理的方法,所述方法包括:

将双链核酸衔接子物质连接到线性双链核酸分子的每一个末端,以产生衔接的双链核酸分子,其中所述双链核酸衔接子物质包含适用于连接到所述线性双链核酸分子的互补区和抑制连接的非互补区;

解离已衔接的双链核酸分子以产生第一链和第二链,每条链在第一末端包含第一扩增引物位点和测序引物位点,在第二末端包含第二扩增位点;以及

单独扩增所述第一链和第二链,以产生包含所述第一链拷贝的第一克隆群和包含所述第二链拷贝的第二克隆群。

11.权利要求11的方法,所述方法进一步包括测定所述第一克隆群的序列,以产生所述第一链的序列组成。

12.权利要求11的方法,所述方法进一步包括在所述解离步骤之前,测定已衔接的双链核酸的量,其中所述双链核酸衔接子包含荧光部分。

13.权利要求11的方法,其中所述互补区包含一个或多个肌苷物质。

14.用于多元靶标处理和富集的方法,所述方法包括:

将双链核酸衔接子物质与来自多个样品的多个线性双链核酸分子的每一末端连接,以产生衔接的双链核酸分子库,其中所述双链核酸衔接子物质包含样品特异性标识元件;

解离来自已衔接的双链核酸分子库的多个成员,以从各个解离成员产生第一链和第二链,从而产生单链分子群;

使多个单链分子群成员与已结合基底的捕获探针杂交,其中所述单链分子群包含至少一个不与已结合基底的捕获探针杂交的成员;

从已结合基底的捕获探针洗脱已杂交的成员,以产生富集的单链分子群;

扩增富集的单链分子群的多个成员,以由各个扩增成员产生克隆群;

单独测定所述克隆群的序列,以产生各个扩增成员的序列数据,所述序列数据包含所述多元标识元件的序列组成;以及

用所述样品特异性标识物将所述序列数据与所述样品之一相联系。

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