[发明专利]RNA选择性杂交试剂及其应用

权利要求书

1.由下述式(1)和式(2)中任一个表示的核苷衍生物，

其中，式(1)和式(2)中，Z表示碳原子或氮原子，R₁表示氢原子或羟基保护基，R₂表示氢原子或磷酸二酯基。

2.如权利要求1所述的核苷衍生物，其由式(1)表示且所述Z为氮原子。

3.由下述式(3)和式(4)表示的核苷衍生物，

其中，式(3)和式(4)中，Z表示碳原子或氮原子，W₁表示氢原子或羟基保护基，W₂表示羟基保护基、亚磷酰胺基或者要结合或已结合到固相载体上的连接基团，R₃表示氢原子或氨基保护基。

4.一种寡核苷酸，其具有由下述式(5)和式(6)中任一个表示的一种或两种以上的核苷酸衍生物单元，

其中，式(5)和式(6)中，Z表示碳原子或氮原子，X¹表示O、S或Se，X²表示SH(或S^-)、S或Se^-、碳原子数为1～4的烷基或吗啉基。

5.一种RNA杂交试剂，其具有由下述式(5)和式(6)中任一个表示的一种或两种以上的核苷酸衍生物单元，

其中，式(5)和式(6)中，Z表示碳原子或氮原子，X¹表示O、S或Se，X²表示SH(或S^-)、S或Se^-、碳原子数为1～4的烷基或吗啉基。

6.如权利要求5所述的RNA杂交试剂，其中，所述核苷酸衍生物单元由式(5)表示且所述Z为氮原子。

7.如权利要求5或6所述的杂交试剂，其在末端具有所述核苷酸衍生物单元。

8.如权利要求5～7中任一项所述的杂交试剂，其具有能够形成茎-环结构的碱基序列并且在所述环上具有所述核苷酸衍生物单元。

9.一种探针组，用于检测RNA上的突变，其中，包含：

第一探针，在与所述突变位点相当的5’末端或3’末端具有由下述式(5)和式(6)中任一个表示的一种或两种以上的核苷酸衍生物单元，和

一种或两种以上的第二探针，在与所述突变位点相当的3’末端或5’末端具有脱氧核苷酸，所述脱氧核苷酸具有与所述突变位点上可能存在的碱基互补的碱基，

其中，式(5)和式(6)中，Z表示碳原子或氮原子，X¹表示O、S或Se，X²表示SH(或S^-)、S或Se^-、碳原子数为1～4的烷基或吗啉基。

10.一种检测方法，用于检测单核苷酸多态性，其中，包括以下步骤：

准备作为可能包含所述单核苷酸多态性的基因表达产物的RNA样品的步骤，

使用将选自下述探针组中的一种第一探针和一种第二探针组合得到的一种或两种以上的组合，使所述第一探针和所述第二探针与所述RNA样品以能够杂交的方式进行接触的步骤，和

对所述RNA样品与所述第一探针和所述第二探针的杂交产物中的所述第一探针的荧光信号进行检测的步骤，

其中，所述探针组包含：

第一探针，在与所述单核苷酸多态性位点相当的5’末端或3’末端具有由下述式(5)和式(6)中任一个表示的核苷酸衍生物单元，和

一种或两种以上的第二探针，在与所述单核苷酸多态性位点相当的3’末端或5’末端具有脱氧核苷酸，所述脱氧核苷酸具有与所述单核苷酸多态性位点上可能存在的碱基互补的碱基。

其中，式(5)和式(6)中，Z表示碳原子或氮原子，X¹表示O、S或Se，X²表示SH(或S^-)、S或Se^-、碳原子数为1～4的烷基或吗啉基。